Table 3.

Gene usage and germ line homology in subsets using certain VH genes

VH gene and patient no.
VH homology to germ line gene, %
VL gene
JL gene
VL homology to germ line gene, %
VL gene reading frame
VH1-69      
   15   100   κA27   4   100   F  
   16   100   λ2-17   3   100   F  
   17*  100   λ2-6   2   100   F  
   18   100   κA3   2   100   F  
   19   100   κA11   5   99.5   F  
   20   100   κA23, κL23   1, 2   100, 99.5   F, NF  
   21   100   κL12   1   100   F  
   22*  100   λ2-6   2   100   F  
   23   100   λ2-17   2   100   F  
   24*  100   κA27   1   100   F  
   25   100   λ1-17   3   100   F  
   26*  100   κA27   3   100   F  
   27*  100   κA27   1   100   F  
   28*  100   κA27   1   100   F  
   29†  100   κO8   4   100   F  
   30   100   κA27   1   99.6   F  
   31   100   κO8   4   99.5   F  
   32   100   κA17   5   100   NF  
   33   100   κO2   1   100   F  
   34   100   λ1-13   3   100   F  
   61†  100   ND   ND   ND   ND  
   72*  100   ND   ND   ND   ND  
VH1-2      
   35†  90   κA30   4   93.2   NF  
   36   100   λ1-17   2   99.3   F  
   37   100   κO2   2   100   F  
   38   100   κL2   4   100   F  
   39*  100   κB3   4   100   F  
   40*  100   κA17   1   100   F  
   41*  100   κB3   2   100   F  
   42*  100   κB3   4   100   F  
   43   100   κB3   2   100   F  
   44   100   κL10   2   99.6   NF  
   60†  88.3   ND   ND   ND   ND  
   69*  100   ND   ND   ND   ND  
VH1-3      
   45*  100   κO2   2   100   F  
   46*  100   κO2   1   100   F  
   47*  100   κO2, κB3   1, 4   100, 100   F, NF  
   48*  100   κO2, λ1-4   2   100, 99.6   F, F  
   49*  100   κO2   2   100   F  
   50   100   κB3   1   100   NF  
   51*  100   κO2   2   100   F  
   52*  100   κO2   1   100   F  
   53   92.4   κL12   2   100   F  
   64*  100   κO2   4   100   F  
   65*  100   κO2   1   100   F  
VH1-18      
   54   100   λ1-4   2   99.6   F  
   55   100   κA27, κA2   ND, 2   100, 100   F, NF  
   56*  100   κO2   1   100   F  
   57*  100   κO2   2   100   F  
   58   92.8   λ2-14   3   99.1   F  
   59*  100   κO2, κL6   3, 1   100, 100   F, F  
VH4-39      
      3   100   κA3   4   100   NF  
      4   94.6   λ2-14   2   98.1   F  
      5   94.2   κL2   1   95.5   F  
      6*  99.1   κO2, κL2   2, 4   100, 98   F, NF  
      7*  100   κO2   2   100   F  
      8*  100   κA3   2   100   ND  
      9*  100   κO2   4   99.5   F  
   10*  100   κO2, κL12   4, 2   100, 100   F, NF  
   11   94.2   κA3   4   97.5   F  
   12   100   κL8   4   100   F  
   13   100   κB3, κL19   1, 4   99.6, 100   F  
   14   100   κL6   3   99.5   F  
VH4-34      
      1†  94.9   κA27   5   95.1   F  
      2†  95.8   κA27   1   94.9   F  
   67†  92.2   κA17   2   100   F  
   68†
 		 93.6
 		 κA17
 		 2
 		 100
 		 F
 
VH gene and patient no.
VH homology to germ line gene, %
VL gene
JL gene
VL homology to germ line gene, %
VL gene reading frame
VH1-69      
   15   100   κA27   4   100   F  
   16   100   λ2-17   3   100   F  
   17*  100   λ2-6   2   100   F  
   18   100   κA3   2   100   F  
   19   100   κA11   5   99.5   F  
   20   100   κA23, κL23   1, 2   100, 99.5   F, NF  
   21   100   κL12   1   100   F  
   22*  100   λ2-6   2   100   F  
   23   100   λ2-17   2   100   F  
   24*  100   κA27   1   100   F  
   25   100   λ1-17   3   100   F  
   26*  100   κA27   3   100   F  
   27*  100   κA27   1   100   F  
   28*  100   κA27   1   100   F  
   29†  100   κO8   4   100   F  
   30   100   κA27   1   99.6   F  
   31   100   κO8   4   99.5   F  
   32   100   κA17   5   100   NF  
   33   100   κO2   1   100   F  
   34   100   λ1-13   3   100   F  
   61†  100   ND   ND   ND   ND  
   72*  100   ND   ND   ND   ND  
VH1-2      
   35†  90   κA30   4   93.2   NF  
   36   100   λ1-17   2   99.3   F  
   37   100   κO2   2   100   F  
   38   100   κL2   4   100   F  
   39*  100   κB3   4   100   F  
   40*  100   κA17   1   100   F  
   41*  100   κB3   2   100   F  
   42*  100   κB3   4   100   F  
   43   100   κB3   2   100   F  
   44   100   κL10   2   99.6   NF  
   60†  88.3   ND   ND   ND   ND  
   69*  100   ND   ND   ND   ND  
VH1-3      
   45*  100   κO2   2   100   F  
   46*  100   κO2   1   100   F  
   47*  100   κO2, κB3   1, 4   100, 100   F, NF  
   48*  100   κO2, λ1-4   2   100, 99.6   F, F  
   49*  100   κO2   2   100   F  
   50   100   κB3   1   100   NF  
   51*  100   κO2   2   100   F  
   52*  100   κO2   1   100   F  
   53   92.4   κL12   2   100   F  
   64*  100   κO2   4   100   F  
   65*  100   κO2   1   100   F  
VH1-18      
   54   100   λ1-4   2   99.6   F  
   55   100   κA27, κA2   ND, 2   100, 100   F, NF  
   56*  100   κO2   1   100   F  
   57*  100   κO2   2   100   F  
   58   92.8   λ2-14   3   99.1   F  
   59*  100   κO2, κL6   3, 1   100, 100   F, F  
VH4-39      
      3   100   κA3   4   100   NF  
      4   94.6   λ2-14   2   98.1   F  
      5   94.2   κL2   1   95.5   F  
      6*  99.1   κO2, κL2   2, 4   100, 98   F, NF  
      7*  100   κO2   2   100   F  
      8*  100   κA3   2   100   ND  
      9*  100   κO2   4   99.5   F  
   10*  100   κO2, κL12   4, 2   100, 100   F, NF  
   11   94.2   κA3   4   97.5   F  
   12   100   κL8   4   100   F  
   13   100   κB3, κL19   1, 4   99.6, 100   F  
   14   100   κL6   3   99.5   F  
VH4-34      
      1†  94.9   κA27   5   95.1   F  
      2†  95.8   κA27   1   94.9   F  
   67†  92.2   κA17   2   100   F  
   68†
 		 93.6
 		 κA17
 		 2
 		 100
 		 F
 

F indicates functional rearrangement; NF, nonfunctional rearrangement; ND, rearrangement was not determined; and ND, not determined.

*

Cases displaying restricted HCDR3 features

†

Cases displaying restricted HCDR3 features in a low frequency

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