Table 1.

Sequence and annealing temperature of RT-PCR primers used


Name

Forward primer

Reverse primer

Temperature, °C
β-actin   5′ ATGAAGATCCTGACCGAGCG 3′   5′ TACTTGCGCTCAGGAGGAGC 3′   58  
Rex-1   5′ CGTGTAACATACACCATCCG 3′   5′ GAAATCCTCTTCCAGAATGG 3′   55  
Gata-1   5′ TAAGGTGGCTGAATCCTCTGCATC 3′   5′ ACGTTCTTGGACACCTTGAAGACGG 3′   64  
SCL   5′ ATTGCACACACGGGATTCTG 3′   5′ GAATTCAGGGTCTTCCTTAG 3′   50  
EKLF   5′ ACCACCCTGGGACAGTTTCT 3′   5′ GAAGGGTCCTCCGATTTCAG 3′   60  
Epo-R   5′ TTCTCCTCGCTATCACCGCATC 3′   5′ CCTCAAACTCGCTCTCTGGGCT 3′   64  
α-globin   5′ CTCTCTGGGGAAGACAAAAGCAAC 3′   5′ GGTGGCTAGCCAAGGTCACCAGCA 3′   55  
βmajor-globin   5′ CACAAACCCCAGAAACAGACA 3′   5′ CTGACAGATGCTCTCTTGGG 3′   55  
βH1-globin   5′ CTCAAGGAGACCTTTGCTCA 3′   5′ AGTCCCCATGGAGTCAAAGA 3′   55  
ϵ-globin   5′ GGAGAGTCCATTAAGAACCTAGACAA 3′   5′ CTGTGAATTCATTGCCGAAGTAC 3′   55  
ζ-globin   5′ GCTCAGGCCGAGCCCATTGG 3′   5′ TAGCGGTACTTCTCAGTCAG 3′   55  
CEBPα   5′ GGTGGACAAGAACAGCAACGAG 3′   5′ TAGAGATCCAGCGACCCGAAAC 3′   55  
CEBPϵ   5′ AGCCCCCGACACCCTTGATGA 3′   5′ GTCCCCTTCTCAAGGCACCCT 3′   58  
G-CSFR   5′ CCCCTCAAACCTATCCTGCCTC 3′   5′ TCCAGGCAGAGATGAGCGAATG 3′   58  
GM-CSF   5′ TGAGGAGGATGTGGCTGCAGAA 3′   5′ TGTGCCACATCTCTTGGTCCCT 3′   65  
MPO   5′ ATGCAGTGGGGACAGTTTCTG 3′   5′ GTCGTTGTAGGATCGGTACTG 3′   55  
c-fms   5′ GCGATGTGTGAGCAATGGCAGT 3′   5′ AGACCGTTTTGCGTAAGACCTG 3′   60  
ICSBP   5′ GTCCCAACTGGACATTTCCG 3′   5′ CATTCACGCAGCCAGCAG 3′   58  
IL-7Rα   5′ TTACTTCAAAGGCTTCTGGAG 3′   5′ CTGGCTTCAACGCCTTTCACCTCA 3′   58  
Pax5   5′ CGGGTCAGCCATGGTTGTG 3′   5′ GTGCTGTCTCTCAAACACG 3′   52  
Gata-3   5′ TATGTGCCCGAGTACAGCTC 3′   5′ TGTAGTACAGCCCACAGGCA 3′   57  
Ets-1   5′ CTACGGTATCGAGCATGCTCAGTG 3′   5′ AAGGTGTCTGTCTGGAGAGGGTCC 3′   58  
Flt3   5′ TCTTGAGACCGTTACAAACC 3′   5′ ATGTCTGTTCCGAACAACTC 3′   54  
CXCR4
 
5′ AAATTTTTGTGTAAGGCTGTC 3′
 
5′ CCCAAAAGGATGAAGGAGTCG 3′
 
52
 

Name

Forward primer

Reverse primer

Temperature, °C
β-actin   5′ ATGAAGATCCTGACCGAGCG 3′   5′ TACTTGCGCTCAGGAGGAGC 3′   58  
Rex-1   5′ CGTGTAACATACACCATCCG 3′   5′ GAAATCCTCTTCCAGAATGG 3′   55  
Gata-1   5′ TAAGGTGGCTGAATCCTCTGCATC 3′   5′ ACGTTCTTGGACACCTTGAAGACGG 3′   64  
SCL   5′ ATTGCACACACGGGATTCTG 3′   5′ GAATTCAGGGTCTTCCTTAG 3′   50  
EKLF   5′ ACCACCCTGGGACAGTTTCT 3′   5′ GAAGGGTCCTCCGATTTCAG 3′   60  
Epo-R   5′ TTCTCCTCGCTATCACCGCATC 3′   5′ CCTCAAACTCGCTCTCTGGGCT 3′   64  
α-globin   5′ CTCTCTGGGGAAGACAAAAGCAAC 3′   5′ GGTGGCTAGCCAAGGTCACCAGCA 3′   55  
βmajor-globin   5′ CACAAACCCCAGAAACAGACA 3′   5′ CTGACAGATGCTCTCTTGGG 3′   55  
βH1-globin   5′ CTCAAGGAGACCTTTGCTCA 3′   5′ AGTCCCCATGGAGTCAAAGA 3′   55  
ϵ-globin   5′ GGAGAGTCCATTAAGAACCTAGACAA 3′   5′ CTGTGAATTCATTGCCGAAGTAC 3′   55  
ζ-globin   5′ GCTCAGGCCGAGCCCATTGG 3′   5′ TAGCGGTACTTCTCAGTCAG 3′   55  
CEBPα   5′ GGTGGACAAGAACAGCAACGAG 3′   5′ TAGAGATCCAGCGACCCGAAAC 3′   55  
CEBPϵ   5′ AGCCCCCGACACCCTTGATGA 3′   5′ GTCCCCTTCTCAAGGCACCCT 3′   58  
G-CSFR   5′ CCCCTCAAACCTATCCTGCCTC 3′   5′ TCCAGGCAGAGATGAGCGAATG 3′   58  
GM-CSF   5′ TGAGGAGGATGTGGCTGCAGAA 3′   5′ TGTGCCACATCTCTTGGTCCCT 3′   65  
MPO   5′ ATGCAGTGGGGACAGTTTCTG 3′   5′ GTCGTTGTAGGATCGGTACTG 3′   55  
c-fms   5′ GCGATGTGTGAGCAATGGCAGT 3′   5′ AGACCGTTTTGCGTAAGACCTG 3′   60  
ICSBP   5′ GTCCCAACTGGACATTTCCG 3′   5′ CATTCACGCAGCCAGCAG 3′   58  
IL-7Rα   5′ TTACTTCAAAGGCTTCTGGAG 3′   5′ CTGGCTTCAACGCCTTTCACCTCA 3′   58  
Pax5   5′ CGGGTCAGCCATGGTTGTG 3′   5′ GTGCTGTCTCTCAAACACG 3′   52  
Gata-3   5′ TATGTGCCCGAGTACAGCTC 3′   5′ TGTAGTACAGCCCACAGGCA 3′   57  
Ets-1   5′ CTACGGTATCGAGCATGCTCAGTG 3′   5′ AAGGTGTCTGTCTGGAGAGGGTCC 3′   58  
Flt3   5′ TCTTGAGACCGTTACAAACC 3′   5′ ATGTCTGTTCCGAACAACTC 3′   54  
CXCR4
 
5′ AAATTTTTGTGTAAGGCTGTC 3′
 
5′ CCCAAAAGGATGAAGGAGTCG 3′
 
52
 

or Create an Account

Close Modal
Close Modal