Table 2.

CDR3 amino acid sequences of E tetramer-positive T cells


Subject group



N-D-N





No. of clones/total
Healthy 1   YFCASS (Vβ16)   QVLG   QETQYFGPGTRLLVL (Jβ2.5)   EDLKN   10/13  
   LLQGF   TEAFFGQGTRLTVV (Jβ1.1)   EDLNK   3/13  
Healthy 2   YFCASS (Vβ16)   QDVGRV   NEQFFGPGTRLTVL (Jβ2.1)   EDLKN   13/13  
HAM 1   YFCASS (Vβ16)   PLRGAK   ETQYFGPGTRLLVL (Jβ2.5)   EDLKN   15/15  
HAM 2   YLCASS (Vβ7)   PTGGLIT   DTQYFGPGTRLTVL (Jβ2.3)   EDLKN   18/20  
   PQELPTGG   NEKLFFGSGTQLSVL (Jβ1.4)   EDLNK   2/20  
AC1
 
YFCASS (Vβ13S2)
 
Y
 
QETQYFGPGTRLLVL (Jβ2.5)
 
EDLKN
 
18/18
 

Subject group



N-D-N





No. of clones/total
Healthy 1   YFCASS (Vβ16)   QVLG   QETQYFGPGTRLLVL (Jβ2.5)   EDLKN   10/13  
   LLQGF   TEAFFGQGTRLTVV (Jβ1.1)   EDLNK   3/13  
Healthy 2   YFCASS (Vβ16)   QDVGRV   NEQFFGPGTRLTVL (Jβ2.1)   EDLKN   13/13  
HAM 1   YFCASS (Vβ16)   PLRGAK   ETQYFGPGTRLLVL (Jβ2.5)   EDLKN   15/15  
HAM 2   YLCASS (Vβ7)   PTGGLIT   DTQYFGPGTRLTVL (Jβ2.3)   EDLKN   18/20  
   PQELPTGG   NEKLFFGSGTQLSVL (Jβ1.4)   EDLNK   2/20  
AC1
 
YFCASS (Vβ13S2)
 
Y
 
QETQYFGPGTRLLVL (Jβ2.5)
 
EDLKN
 
18/18
 

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