Table 1.

Alignment and characterization of GC-rich motifs in the Dβ1 promoter


Site

Sequences
-35   C   C   T   A   T   G   G   G   A   G   G   G   T   C   C   T  
-281   G   A   G   A   A   G   G   G   C   G   G   A   T   A   C   A  
-314   T   C   A   T   A   G   G   G   T   G   G   T   T   C   C   C  
Consensus   -   -   -   A/T   A/T   G   G   G   N   G   G   N   T   N   C   -  
Binding   -   -   -   C   A/c   a   G   G   t   t   T   C   -   -   -   -  
Nonbinding
 
-
 
-
 
-
 
-
 
-
 
T/C
 
T
 
C
 
-
 
-
 
-
 
-
 
-
 
-
 
-
 
-
 

Site

Sequences
-35   C   C   T   A   T   G   G   G   A   G   G   G   T   C   C   T  
-281   G   A   G   A   A   G   G   G   C   G   G   A   T   A   C   A  
-314   T   C   A   T   A   G   G   G   T   G   G   T   T   C   C   C  
Consensus   -   -   -   A/T   A/T   G   G   G   N   G   G   N   T   N   C   -  
Binding   -   -   -   C   A/c   a   G   G   t   t   T   C   -   -   -   -  
Nonbinding
 
-
 
-
 
-
 
-
 
-
 
T/C
 
T
 
C
 
-
 
-
 
-
 
-
 
-
 
-
 
-
 
-
 

Bases in lowercase have a reduced ability to compete with wild-type sequences. — indicates not applicable.

or Create an Account

Close Modal
Close Modal