Table 2.

Sequences of the family-specific Jβ primers used for TCR-β PCR

First amplificationSecond amplification
5′3′ 5′3′
JβFS1A  Jβ 1.1  ACT GTG AGT CTG GTG CC JβFS1  TGA GTC TGG TGC CTT GTC CAA A  
 Jβ 1.2  ACG GTT AAC CTG GTC CC   TTA ACC TGG TCC CCG AAC CGA A  
 Jβ 1.3  ACA GTG AGC CAA CTT CC   TGA GCC AAC TTC CCT CTC CAA A 
 Jβ 1.4  ACA GAG AGC TGG GTT CC   AGA GCT GGG TTC CAC TGC CAA A  
 Jβ 1.5  ATG GAG AGT CGA GTC CC   AGA GTC GAG TCC CAT CAC CAA A  
 Jβ 1.6  ACA GTG AGC CTG GTC CC  TGA GCC TGG TCC CAT TCC CAA A  
JβFS2A  Jβ 2.1  ACG GTG AGC CGT GTC CC  JβFS2  TGA GCC GTG TCC CTG GCC CGA A 
 Jβ 2.2  ACG GTC AGC CTA GAG CC   TCA GCC TAG AGC CTT CTC CAA A  
 Jβ 2.3  ACT GTC AGC CGG GTG CC   TCA GCC GGG TGC CTG GGC CAA A  
 Jβ 2.4  ACT GAG AGC CGG GTC CC  AGA GCC GGG TCC CGG CGC CGA A  
 Jβ 2.5  ACC AGG AGC CGC GTG CC   CGA GCC GCG TGC CTG GCC CGA A  
 Jβ 2.6 ACG GTC AGC CTG CTG CC   TCA GCC TGC TGC CGG CCC CGA A 
 Jβ 2.7  ACC GTG AGC CTG GTG CC   TGA GCC TGG TGC CCG GCC CGA A 
First amplificationSecond amplification
5′3′ 5′3′
JβFS1A  Jβ 1.1  ACT GTG AGT CTG GTG CC JβFS1  TGA GTC TGG TGC CTT GTC CAA A  
 Jβ 1.2  ACG GTT AAC CTG GTC CC   TTA ACC TGG TCC CCG AAC CGA A  
 Jβ 1.3  ACA GTG AGC CAA CTT CC   TGA GCC AAC TTC CCT CTC CAA A 
 Jβ 1.4  ACA GAG AGC TGG GTT CC   AGA GCT GGG TTC CAC TGC CAA A  
 Jβ 1.5  ATG GAG AGT CGA GTC CC   AGA GTC GAG TCC CAT CAC CAA A  
 Jβ 1.6  ACA GTG AGC CTG GTC CC  TGA GCC TGG TCC CAT TCC CAA A  
JβFS2A  Jβ 2.1  ACG GTG AGC CGT GTC CC  JβFS2  TGA GCC GTG TCC CTG GCC CGA A 
 Jβ 2.2  ACG GTC AGC CTA GAG CC   TCA GCC TAG AGC CTT CTC CAA A  
 Jβ 2.3  ACT GTC AGC CGG GTG CC   TCA GCC GGG TGC CTG GGC CAA A  
 Jβ 2.4  ACT GAG AGC CGG GTC CC  AGA GCC GGG TCC CGG CGC CGA A  
 Jβ 2.5  ACC AGG AGC CGC GTG CC   CGA GCC GCG TGC CTG GCC CGA A  
 Jβ 2.6 ACG GTC AGC CTG CTG CC   TCA GCC TGC TGC CGG CCC CGA A 
 Jβ 2.7  ACC GTG AGC CTG GTG CC   TGA GCC TGG TGC CCG GCC CGA A