Table 1.

Mutational analysis of consensus salivary gland lymphomaVH genes

Case no. GermlineVH gene % homologyCDR1 and 2 FW1, 2, and 3
RS R/S Random R/S R S R/S Random R/S
V1-69 97  4  0  4  3.6  3  1  3  
2  V1-69 91  6  5  1.2  3.6  5  11 0.45  3  
3  V1-69 98  1  0  1  3.6  3  0.67  3  
4  V1-69 92  6  4  1.5  3.6 7  7  1  3  
5  V1-69 93  2  5  0.4 3.6  7  8  0.87  3  
6  V1-69 98  3  3  3.6  1  2  0.5  3  
7  V1-69 98  3  0.3  3.6  2  1  2  3  
8  V1-69 97 1  2  0.5  3.6  4  2  2  3  
9  V1-46 94  6  3  2  4.2  1  7  0.14  2.8  
10 V3-7 98  2  0  2  4.9  1  2  0.5  2.8 
11  V3-30.3 100  
12  V3-11 94  3  1  4.3  6  8  0.75  2.8  
13  V3-30 91  4  1.2  3.9  10  7  1.4  2.8  
14  V4-39 94  4  1  4  4.5  7  4  1.7  2.6 
Case no. GermlineVH gene % homologyCDR1 and 2 FW1, 2, and 3
RS R/S Random R/S R S R/S Random R/S
V1-69 97  4  0  4  3.6  3  1  3  
2  V1-69 91  6  5  1.2  3.6  5  11 0.45  3  
3  V1-69 98  1  0  1  3.6  3  0.67  3  
4  V1-69 92  6  4  1.5  3.6 7  7  1  3  
5  V1-69 93  2  5  0.4 3.6  7  8  0.87  3  
6  V1-69 98  3  3  3.6  1  2  0.5  3  
7  V1-69 98  3  0.3  3.6  2  1  2  3  
8  V1-69 97 1  2  0.5  3.6  4  2  2  3  
9  V1-46 94  6  3  2  4.2  1  7  0.14  2.8  
10 V3-7 98  2  0  2  4.9  1  2  0.5  2.8 
11  V3-30.3 100  
12  V3-11 94  3  1  4.3  6  8  0.75  2.8  
13  V3-30 91  4  1.2  3.9  10  7  1.4  2.8  
14  V4-39 94  4  1  4  4.5  7  4  1.7  2.6 

Columns headed with “R” or “S” give the number of deduced replacement or silent mutations from the proposed germlineVH nucleotide sequences, respectively. “Random R/S” refers to the ratio of all possible replacement to silent mutations for the given areas as described by Chang and Casali.31 

or Create an Account

Close Modal
Close Modal