Table 3.

EBV LMP1 Gene Deletion Region Polymorphisms

Case Diagnosis EBNA-1 Subtype LMP Gene Deletion 322 325 326 327 328 333 334335 337 338 342 344 348 349 351 352354 355 356 361 366
B95.8    CAA Gln  GAA Glu  GAG Glu  GTT Val  GAA Glu  CAG Gln  CAG Gln  GGC Gly CCT Pro  TTG Leu  GGA Gly  GGC Gly CAT His  GAT Asp  GGC Gly  CAT His GGC Gly  GGT Gly  GAT Asp  ACG Thr TCT Ser  
1  Br HD  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  —  AGC Ser  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
2  Br HD  P-thr  No  —  —  —  —  —  —   —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  GAC  —  ACT Thr  
3  Br HD  P-thr  No  —  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  CGT Arg  —  TGT Cys  —  ACA ACT Thr  
4  Br HD  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
5  Br HD  V-leu  No  —  —  —  —  GGA Gly  —  —  —  —  —  GGT —  CGT Arg  AAT Asn AGC Ser  CGT Arg  —  —  —  —  ACT Thr  
6  Br HD  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
7  Br HD  V-leu»  No  GAA Glu  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  ACA  ACT Thr  
8  Br HD  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
9  Br HD  V-leu  No  GAA Glu  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  CGT Arg  —  —  —  ACA  ACT Thr  
10  Br HD  P-thr»  No  —  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  CGT Arg  —  —  —  ACA  ACT Thr  
11  Br HD  V-leu  No  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
12  Br HD  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  GAT Asp  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
13  Br HD  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
14  Br HD  V-leu  No  —  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  CGT Arg  —  —  —  ACA  ACT Thr  
15  Br HD  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  ACA  ACT Thr  
16  Br HD  P-thr  Yes  —  —  —  GAT Asp  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  ACA  ACT Thr  
17  Br HD  V-leu  No  ?  —  —  —  —  —  —  —  —  —  GGT  —  —  —  —  CGT Arg  —  —  —  —  ACT Thr  
18  Br React  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
19  Br React  V-leu  Yes  —  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
20  Br React  P-alaIV No —  —  —  —  —  —   —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  
21  Br React  P-thr  No  GAA Glu  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  GGT Gly  —  CGT Arg  —  —  —  ACA ACT Thr  
22  Br React  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  TCT Ser  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
23  Br React  P-thr  No  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  AAT Asn  —  —  AAT Asn —  —  GAC  —  ACT Thr  
24  Am HD  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —   —  ACT Thr  
25  Am HD  P-thr  No  —  —  —  —  CAA Gln  —  —  —  —  —  —  —  GCT Ala  —  —  —  —  —  GAC  —  ACT Thr  
26  Am HD  P-thr  No  —  —  —  —  CAA Gln  —  —  —  —  —  —  —  GCT Ala  —  —  —  —  —  GAC  —  ACT Thr  
27  Am HD  P-thr  No  CAC His  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  CGT Arg  AGC Ser  —  AAT Asn  ACA  ACT Thr  
28  Am HD  P-thr  Yes  AAT Asn  —  GAC Asp  —  —  —  AGG  AGC Ser  TCT Ser  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
29  Am HD  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
30  Am HD  P-thr  No  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  GAC  —  ACT Thr  
31  Am HD  P-thr  No  GAA Glu  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  CGT Arg  —  —  —  ACA  ACT Thr  
32  Am HD  V-leu  No  —  GAG —  —  —  —  —  —  —  —  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  GCT 
33  Am HD  P-ala  No  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  
34  Am HD  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  —  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
35  Am HD  P-ala»  No  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  GAC  —  ACT Thr  
36  Am React  P-ala»  No  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  
37  Am React  P-ala′»  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
38 Am React  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr 
39  Am React  P-thr′  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  
40  Am React V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
41  Am React  V-leu  No  —  —  —  —  —  AGG Arg  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  CGT Arg  —  —  —  ACA  ACT Thr  
42  Am React  P-thr  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
43  Am React  P-thr  No  GAA Glu  —  —  —  —  —  CGG Arg  GTC Val  —  TCG Ser  GGT  —  —  GCT Ala  —  CGT Arg  —  —  —  ACA ACT Thr  
44  Am React  P-thr  No  —  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  TGT Cys  —  ACA  ACT Thr  
45  Am React  P-thr  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
46  Am React  V-leu  Yes  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  
Case Diagnosis EBNA-1 Subtype LMP Gene Deletion 322 325 326 327 328 333 334335 337 338 342 344 348 349 351 352354 355 356 361 366
B95.8    CAA Gln  GAA Glu  GAG Glu  GTT Val  GAA Glu  CAG Gln  CAG Gln  GGC Gly CCT Pro  TTG Leu  GGA Gly  GGC Gly CAT His  GAT Asp  GGC Gly  CAT His GGC Gly  GGT Gly  GAT Asp  ACG Thr TCT Ser  
1  Br HD  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  —  AGC Ser  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
2  Br HD  P-thr  No  —  —  —  —  —  —   —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  GAC  —  ACT Thr  
3  Br HD  P-thr  No  —  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  CGT Arg  —  TGT Cys  —  ACA ACT Thr  
4  Br HD  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
5  Br HD  V-leu  No  —  —  —  —  GGA Gly  —  —  —  —  —  GGT —  CGT Arg  AAT Asn AGC Ser  CGT Arg  —  —  —  —  ACT Thr  
6  Br HD  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
7  Br HD  V-leu»  No  GAA Glu  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  ACA  ACT Thr  
8  Br HD  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
9  Br HD  V-leu  No  GAA Glu  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  CGT Arg  —  —  —  ACA  ACT Thr  
10  Br HD  P-thr»  No  —  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  CGT Arg  —  —  —  ACA  ACT Thr  
11  Br HD  V-leu  No  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
12  Br HD  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  GAT Asp  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
13  Br HD  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
14  Br HD  V-leu  No  —  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  CGT Arg  —  —  —  ACA  ACT Thr  
15  Br HD  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  ACA  ACT Thr  
16  Br HD  P-thr  Yes  —  —  —  GAT Asp  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  ACA  ACT Thr  
17  Br HD  V-leu  No  ?  —  —  —  —  —  —  —  —  —  GGT  —  —  —  —  CGT Arg  —  —  —  —  ACT Thr  
18  Br React  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
19  Br React  V-leu  Yes  —  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
20  Br React  P-alaIV No —  —  —  —  —  —   —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  
21  Br React  P-thr  No  GAA Glu  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  GGT Gly  —  CGT Arg  —  —  —  ACA ACT Thr  
22  Br React  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  TCT Ser  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
23  Br React  P-thr  No  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  AAT Asn  —  —  AAT Asn —  —  GAC  —  ACT Thr  
24  Am HD  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —   —  ACT Thr  
25  Am HD  P-thr  No  —  —  —  —  CAA Gln  —  —  —  —  —  —  —  GCT Ala  —  —  —  —  —  GAC  —  ACT Thr  
26  Am HD  P-thr  No  —  —  —  —  CAA Gln  —  —  —  —  —  —  —  GCT Ala  —  —  —  —  —  GAC  —  ACT Thr  
27  Am HD  P-thr  No  CAC His  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  CGT Arg  AGC Ser  —  AAT Asn  ACA  ACT Thr  
28  Am HD  P-thr  Yes  AAT Asn  —  GAC Asp  —  —  —  AGG  AGC Ser  TCT Ser  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
29  Am HD  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
30  Am HD  P-thr  No  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  GAC  —  ACT Thr  
31  Am HD  P-thr  No  GAA Glu  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  CGT Arg  —  —  —  ACA  ACT Thr  
32  Am HD  V-leu  No  —  GAG —  —  —  —  —  —  —  —  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  GCT 
33  Am HD  P-ala  No  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  
34  Am HD  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  —  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
35  Am HD  P-ala»  No  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  GAC  —  ACT Thr  
36  Am React  P-ala»  No  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  
37  Am React  P-ala′»  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
38 Am React  V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr 
39  Am React  P-thr′  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  
40  Am React V-leu  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
41  Am React  V-leu  No  —  —  —  —  —  AGG Arg  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  CGT Arg  —  —  —  ACA  ACT Thr  
42  Am React  P-thr  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
43  Am React  P-thr  No  GAA Glu  —  —  —  —  —  CGG Arg  GTC Val  —  TCG Ser  GGT  —  —  GCT Ala  —  CGT Arg  —  —  —  ACA ACT Thr  
44  Am React  P-thr  No  —  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  TGT Cys  —  ACA  ACT Thr  
45  Am React  P-thr  Yes  AAT Asn  —  —  —  —  —  CGG Arg  —  —  TCG Ser  GGT  —  —  —  —  —  —  —  —  —  ACT Thr  
46  Am React  V-leu  Yes  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  —  

Abbreviations: Am HD, American Hodgkin’s disease; Am React, American reactive tissues; Br HD, Brazilian Hodgkin’s disease; Br React, Brazilian reactive tissues.

View Large
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal