Table 2. PCR Primers and Conditions for... | American Society of Hematology

Table 2.

PCR Primers and Conditions for Amplification ofALAS2 From Genomic DNA

ALAS2 Region	Size (bp)	Temperature (°C)	Primer No.	Sense^*	Oligonucleotides^†
Promoter	351	56	117	+	5′ GCCGCCAAGCTT‖AAAAAAGAAATTGCAAATCAATATGT 3′
Region 1			313	−	5′ GCCGCCAAGCT‖TAACTTGTTGATAATTACCCAACTA 3′
Promoter	326	58	118	+	5′ GCCGCCAAGC‖TTCATAGGCGGGCTCTG 3′
Region 2			314	−	5′ GCCGCCAA‖GCTTATGAGCTCAAACAGTCAGCTT 3′
Promoter	290	60	119	+	5′ GCCGCCAAGC‖TTACAACAACCGGGGATC 3′
Region 3			316	−	5′ GCCGCCAAGCT‖TCTGGCTCTTCCCTATTT 3′
Exon 1	323	60	136	+	5′ GCCGCCGAATTC‖CTAATTTTACTGTCCTATAGAG 3′
			128	−	5′ GCCGCCGAATT‖CAGCTGGCAGACCAGAGATA 3′
Exon 2	390	60	137	+	5′ GCCGCCGAATTC‖GAAGGGCAATAAGAGCA 3′
			135	−	5′ GCCGCCGAATT‖CCCCAGGACCCTAACAT 3′
Exon 3	242	58	158	+	5′ GCCGCCGAATT‖CATTAGATCTCAGCAATTAT 3′
			159	−	5′ GCCGCCGAATTC‖GGTGGAACTTGACTCCA 3′
Exon 4	334	56	143	+	5′ GCCGCCGAATTC‖AAACTTGAATTTTCATG 3′
			144	−	5′ GCCGCCGAATTC‖GCCCTTCTGTACTGTTT 3′
Exon 5	355	62	329	+	5′ ‖AGACTAGCCAGGGAGAGACT 3′
			169	−	5′ GCCGCCGAATTC‖TTTCCATGTGTGGTTTTTC 3′
Exon 6	334	58	145	+	5′ GCCGCCGAATT‖CTACCCAGTTCCTCGA 3′
			146	−	5′ GCCGCCGAATTC‖GTAAACTGGATGCTGTAT 3′
Exon 7	324	60	141	+	5′ GCCGCCGAA‖TTCTTTGCCAGGTCAAACC 3′
			142	−	5′ GCCGCCGAATTC‖GACCAACACTAGTAAACAT 3′
Exon 8	298	60	315	+	5′ GCCGCCG‖AATTCCACATTGGAGATGG 3′
			151	−	5′ GCCGCCGAATT‖CCTCCTCTCTGGAGG 3′
Exon 9	416	60	115	+	5′ GCCGCCGAATT‖CATGATCCTGTTGCTCT 3′
			116	−	5′ GCCGCCGAATTC‖AGCGTGAGGCTCCCAGA 3′
Exon 9	293	60	129	+	5′ GCCGCCGAATT‖CAGGCAAGGCCTTTGGCTGT 3′
			130	−	5′ GCCGCCGAATTC‖CGGATGGGGATGATGTGGC 3′
Exon 10	322	62	147	+	5′ GCCGCCGAATT‖CATCTGCTTAATGGAGCTA 3′
			148	−	5′ GCCGCCGAATTC‖TCTCTTTCAGATCCTGGG 3′
Exon 11	319	60	152	+	5′ GCCGCCGAATTC‖TGGAAGATCTAGTCTAAC 3′
			153	−	5′ GCCGCCGAATT‖CACAACAAAGCAGAAGAC 3′
3′ end	372	60	318	+	5′ GCCGCCGA‖ATTCACACCCCACCTGC 3′
			319	−	5′ GCCGCCGAAT‖TCAATCCCTGGATTTTTATTG 3′

ALAS2 Region	Size (bp)	Temperature (°C)	Primer No.	Sense^*	Oligonucleotides^†
Promoter	351	56	117	+	5′ GCCGCCAAGCTT‖AAAAAAGAAATTGCAAATCAATATGT 3′
Region 1			313	−	5′ GCCGCCAAGCT‖TAACTTGTTGATAATTACCCAACTA 3′
Promoter	326	58	118	+	5′ GCCGCCAAGC‖TTCATAGGCGGGCTCTG 3′
Region 2			314	−	5′ GCCGCCAA‖GCTTATGAGCTCAAACAGTCAGCTT 3′
Promoter	290	60	119	+	5′ GCCGCCAAGC‖TTACAACAACCGGGGATC 3′
Region 3			316	−	5′ GCCGCCAAGCT‖TCTGGCTCTTCCCTATTT 3′
Exon 1	323	60	136	+	5′ GCCGCCGAATTC‖CTAATTTTACTGTCCTATAGAG 3′
			128	−	5′ GCCGCCGAATT‖CAGCTGGCAGACCAGAGATA 3′
Exon 2	390	60	137	+	5′ GCCGCCGAATTC‖GAAGGGCAATAAGAGCA 3′
			135	−	5′ GCCGCCGAATT‖CCCCAGGACCCTAACAT 3′
Exon 3	242	58	158	+	5′ GCCGCCGAATT‖CATTAGATCTCAGCAATTAT 3′
			159	−	5′ GCCGCCGAATTC‖GGTGGAACTTGACTCCA 3′
Exon 4	334	56	143	+	5′ GCCGCCGAATTC‖AAACTTGAATTTTCATG 3′
			144	−	5′ GCCGCCGAATTC‖GCCCTTCTGTACTGTTT 3′
Exon 5	355	62	329	+	5′ ‖AGACTAGCCAGGGAGAGACT 3′
			169	−	5′ GCCGCCGAATTC‖TTTCCATGTGTGGTTTTTC 3′
Exon 6	334	58	145	+	5′ GCCGCCGAATT‖CTACCCAGTTCCTCGA 3′
			146	−	5′ GCCGCCGAATTC‖GTAAACTGGATGCTGTAT 3′
Exon 7	324	60	141	+	5′ GCCGCCGAA‖TTCTTTGCCAGGTCAAACC 3′
			142	−	5′ GCCGCCGAATTC‖GACCAACACTAGTAAACAT 3′
Exon 8	298	60	315	+	5′ GCCGCCG‖AATTCCACATTGGAGATGG 3′
			151	−	5′ GCCGCCGAATT‖CCTCCTCTCTGGAGG 3′
Exon 9	416	60	115	+	5′ GCCGCCGAATT‖CATGATCCTGTTGCTCT 3′
			116	−	5′ GCCGCCGAATTC‖AGCGTGAGGCTCCCAGA 3′
Exon 9	293	60	129	+	5′ GCCGCCGAATT‖CAGGCAAGGCCTTTGGCTGT 3′
			130	−	5′ GCCGCCGAATTC‖CGGATGGGGATGATGTGGC 3′
Exon 10	322	62	147	+	5′ GCCGCCGAATT‖CATCTGCTTAATGGAGCTA 3′
			148	−	5′ GCCGCCGAATTC‖TCTCTTTCAGATCCTGGG 3′
Exon 11	319	60	152	+	5′ GCCGCCGAATTC‖TGGAAGATCTAGTCTAAC 3′
			153	−	5′ GCCGCCGAATT‖CACAACAAAGCAGAAGAC 3′
3′ end	372	60	318	+	5′ GCCGCCGA‖ATTCACACCCCACCTGC 3′
			319	−	5′ GCCGCCGAAT‖TCAATCCCTGGATTTTTATTG 3′

(+) Sense primer; (−) antisense primer.

†

Vertical bar indicates the beginning of the ALAS2 genomic sequence. The annealing temperatures were set for the regions to the right of the vertical bar.

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