CNVs in 18 spontaneously regressed CLL tumors
| . | CNV . |
|---|---|
| CLL01 | 8q24.13 del (×1; TRIB1; NSMCE2); 13q14.2−q14.3 del (×1; miR15a/16-1, DLEU7; RNASEH2B) |
| CLL02 | 10q26.3 gain (×3); 13q14.2−q14.3 del (×1; miR15a/16-1, DLEU7; RNASEH2B) |
| CLL03 | 13q14.2−q14.3 del (×1; miR15a/16-1, DLEU7) |
| CLL04 | 2q13 del (×1); 3p24.2−p24.3 gain (×3; NKIRAS1) |
| CLL05 | 13q14.2−q14.3 del (×0; miR15a/16-1, DLEU7) |
| CLL06 | 3q23 gain (×3); 13q14.2−q14.3 del (×0; miR15a/16-1, DLEU7; RNASEH2B) |
| CLL07 | 3q11.1−q11.2 gain (×3); 4q28.3 gain (×3); 11p13−p14.1 gain (×3; WT1) |
| CLL08 | No detectable CNV |
| CLL09 | 7q11.23 del (×1) |
| CLL10 | 7q31.33−q32.1 gain (×3; POT1); 13q14.2−q14.3 del (×1; miR15a/16-1, DLEU7; RNASEH2B) |
| CLL11 | 13q14.2−q14.3 del (×1; miR15a/16-1, DLEU7) |
| CLL12 | 2p16.1 del (×1) |
| CLL13 | 8p del (×1; TNFRSF10A); 13q14.2−q14.3 del (×1; miR15a/16-1, DLEU7); 17p del (×1; TP53) |
| CLL15 | 12q21.2−q31 gain (×3; PAWR); 13q14.2−q14.3 del (×1; miR15a/16-1, DLEU7; RNASEH2B); 16q11.2−q12.1 gain (×3) |
| CLL16 | 13q14.2−q14.3 del (×1; miR15a/16-1, RNASEH2B; RB1) |
| CLL18 | 6p22.3 gain (×3) |
| CLL19 | 7p12.1 gain (×3) |
| CLL20 | 13q14.2−q14.3 del (×1; miR15a/16-1, DLEU7; RNASEH2B) |
| . | CNV . |
|---|---|
| CLL01 | 8q24.13 del (×1; TRIB1; NSMCE2); 13q14.2−q14.3 del (×1; miR15a/16-1, DLEU7; RNASEH2B) |
| CLL02 | 10q26.3 gain (×3); 13q14.2−q14.3 del (×1; miR15a/16-1, DLEU7; RNASEH2B) |
| CLL03 | 13q14.2−q14.3 del (×1; miR15a/16-1, DLEU7) |
| CLL04 | 2q13 del (×1); 3p24.2−p24.3 gain (×3; NKIRAS1) |
| CLL05 | 13q14.2−q14.3 del (×0; miR15a/16-1, DLEU7) |
| CLL06 | 3q23 gain (×3); 13q14.2−q14.3 del (×0; miR15a/16-1, DLEU7; RNASEH2B) |
| CLL07 | 3q11.1−q11.2 gain (×3); 4q28.3 gain (×3); 11p13−p14.1 gain (×3; WT1) |
| CLL08 | No detectable CNV |
| CLL09 | 7q11.23 del (×1) |
| CLL10 | 7q31.33−q32.1 gain (×3; POT1); 13q14.2−q14.3 del (×1; miR15a/16-1, DLEU7; RNASEH2B) |
| CLL11 | 13q14.2−q14.3 del (×1; miR15a/16-1, DLEU7) |
| CLL12 | 2p16.1 del (×1) |
| CLL13 | 8p del (×1; TNFRSF10A); 13q14.2−q14.3 del (×1; miR15a/16-1, DLEU7); 17p del (×1; TP53) |
| CLL15 | 12q21.2−q31 gain (×3; PAWR); 13q14.2−q14.3 del (×1; miR15a/16-1, DLEU7; RNASEH2B); 16q11.2−q12.1 gain (×3) |
| CLL16 | 13q14.2−q14.3 del (×1; miR15a/16-1, RNASEH2B; RB1) |
| CLL18 | 6p22.3 gain (×3) |
| CLL19 | 7p12.1 gain (×3) |
| CLL20 | 13q14.2−q14.3 del (×1; miR15a/16-1, DLEU7; RNASEH2B) |
Shown in parentheses following each CNV are the copy number within the cytoband, followed by any genes within the cytoband that could potentially be functionally significant. Highlighted in bold are CNVs that have not been previously reported in major CLL genomic studies. Data derived from the sorted CD19+CD5+ CLL population.