Table 2

Exons comparison between SF3B1 mutant and normal groups

GeneChromosomeStrandExon locationNo. of exon testNo. of exonsExon no.Adjusted PBase MBase NLog2fold (mutant/healthy donor)P
SIRPB1 20 − 1577987-1578928 11 11 0.00 125 33.46 0.00 
SIRPB1 20 − 1584456-1584788 11 11 1.63 × 10−12 74 32.79 7.77 × 10−16 
SIRPB1 20 − 1585388-1585705 11 11 2.52 × 10−07 47 32.00 2.81 × 10−10 
SIRPB1 20 − 1579468-1579582 11 11 1.44 × 10−05 34 31.72 2.33 × 10−08 
SIRPB1 20 − 1592003-1592359 11 11 2.58 × 10−04 95 32.88 5.54 × 10−07 
AKAP13 15 86287859-86292586 36 38 38 0.00 258 30.91 0.00 
HBG2 11 − 5275867-5276011 0.00 15 658 30.03 0.00 
HBG2 11 − 5274421-5274635 1.64 × 10−05 29 067 344 −0.14 2.73 × 10−08 
PHF3 64421482-64424405 15 15 15 0.00 141 29.99 0.00 
CD37 19 49838677-49838832 0.00 111 29.65 0.00 
NIPAL3 24795476-24799472 12 12 12 0.00 173 29.40 0.00 
VPS36 13 − 52986739-52990058 13 14 14 0.00 222 28.94 0.00 
HELZ 17 − 65066555-65074702 29 33 33 7.76 × 10−13 153 29.12 3.33 × 10−16 
CTTN 11 70281132-70282689 16 19 19 1.51 × 10−12 419 31.66 6.66 × 10−16 
RSAD2 7035909-7038363 2.26 × 10−12 308 27.95 1.11 × 10−15 
RPS17 15 − 83207631-83207736 3.23 × 10−12 220 33.49 1.67 × 10−15 
POU2F2 19 − 42592673-42595743 10 13 13 6.74 × 10−12 280 29.46 3.55 × 10−15 
PARP14 122447155-122449686 17 17 17 2.06 × 10−11 128 29.10 1.11 × 10−14 
RAPGEF6 − 130759616-130762984 29 30 30 2.72 × 10−11 127 30.14 1.50 × 10−14 
CARD8 19 − 48711344-48715232 10 10 10 5.15 × 10−11 115 29.40 3.03 × 10−14 
TSC1 − 135766735-135772141 15 24 24 6.01 × 10−11 164 30.44 3.69 × 10−14 
ATM 11 108236052-108239826 54 64 64 1.13 × 10−10 200 31.49 7.21 × 10−14 
RABL3 − 120405530-120408735 1.58 × 10−10 102 30.15 1.07 × 10−13 
CCDC25 − 27590835-27593762 1.58 × 10−10 108 29.79 1.07 × 10−13 
MEGF9 − 123363091-123367919 2.41 × 10−10 262 31.12 1.68 × 10−13 
IL32 16 3119282-3119667 11 11 3.05 × 10−10 345 31.09 2.21 × 10−13 
IL32 16 3118991-3119667 11 10 1.53 × 10−02 665 85 −0.12 6.40 × 10−05 
DDX54 12 − 113594984-113596914 21 21 21 3.19 × 10−10 90 28.84 2.34 × 10−13 
TTC14 180327418-180328917 13 13 13 4.73 × 10−10 95 28.73 3.54 × 10−13 
ADPGK 15 − 73043710-73045236 6.16 × 10−10 102 32.16 4.69 × 10−13 
ADPGK 15 − 73043710-73045233 2.35 × 10−05 101 98 −0.11 4.10 × 10−08 
EZH1 17 − 40852294-40854610 19 21 21 2.04 × 10−09 131 28.95 1.63 × 10−12 
MADD 11 47350597-47351582 35 38 38 5.39 × 10−09 90 29.52 4.43 × 10−12 
RABL2B 22 − 51205920-51207302 13 13 13 5.49 × 10−09 80 29.36 4.58 × 10−12 
RABL2B 22 − 51207883-51207977 13 13 10 2.93 × 10−02 16 −28.17 1.39 × 10−04 
ZNF638 71649944-71651168 24 28 22 6.95 × 10−09 84 30.73 5.88 × 10−12 
SON 21 34948671-34949812 13 13 13 8.44 × 10−09 76 32.49 7.25 × 10−12 
IDE 10 − 94211441-94214296 24 25 25 9.99 × 10−09 71 29.31 8.69 × 10−12 
MOBKL1A 71847697-71853890 2.45 × 10−08 268 30.54 2.22 × 10−11 
ZNF592 15 85345094-85349661 10 11 11 2.45 × 10−08 81 29.21 2.20 × 10−11 
RPRD1B 20 36718128-36720764 2.62 × 10−08 112 29.42 2.41 × 10−11 
ARHGEF7 13 111955338-111958080 11 23 23 2.99 × 10−08 120 32.24 2.78 × 10−11 
KDM5D − 21867303-21868231 27 28 28 5.42 × 10−08 92 28.78 5.25 × 10−11 
ZNF295 21 − 43406941-43414217 1.51 × 10−07 28 30.45 1.55 × 10−10 
ZNF295 21 − 43406941-43411998 6.31 × 10−06 80 −27.93 9.20 × 10−09 
ARHGAP27 17 − 43471269-43472999 11 17 17 1.51 × 10−07 154 29.46 1.56 × 10−10 
CEP350 180080132-180084014 22 36 36 1.62 × 10−07 102 32.63 1.69 × 10−10 
R3HDM1 136481507-136482836 19 25 25 1.85 × 10−07 66 29.65 1.97 × 10−10 
TRMT5 14 − 61438169-61441912 2.25 × 10−07 180 30.11 2.43 × 10−10 
TRMT5 14 − 61445949-61446604 5.94 × 10−07 25 23 −0.36 6.99 × 10−10 
CA5B 15800608-15805747 2.31 × 10−07 114 30.37 2.52 × 10−10 
KIAA0319L − 35899092-35900682 20 21 21 2.52 × 10−07 73 27.72 2.81 × 10−10 
CD3E 11 118186201-118186889 4.06 × 10−07 238 27.14 4.57 × 10−10 
GTF2E1 120499890-120501915 4.96 × 10−07 138 32.16 5.72 × 10−10 
GTF2E1 120469370-120469847 1.39 × 10−06 11 20 0.11 1.83 × 10−09 
SLC9A8 20 48504366-48508772 16 16 5.36 × 10−07 65 30.44 6.25 × 10−10 
ST6GALNA − 130647601-130649067 7.62 × 10−07 136 28.77 9.06 × 10−10 
FCHSD1 − 141018870-141021130 15 20 20 8.83 × 10−07 94 27.20 1.07 × 10−09 
RUNX3 − 25226003-25229157 1.01 × 10−06 375 30.61 1.26 × 10−09 
CHD9 16 53357932-53361413 15 38 38 1.16 × 10−06 71 32.47 1.47 × 10−09 
ATG10 81272012-81272146 1.39 × 10−06 437 1440 −0.66 1.79 × 10−09 
ATG10 81267844-81268125 3.04 × 10−05 201 155 1.44 5.40 × 10−08 
NAA16 13 41949541-41951166 18 22 22 1.39 × 10−06 55 29.50 1.83 × 10−09 
LPIN1 11964758-11967531 14 20 20 1.98 × 10−06 80 29.54 2.67 × 10−09 
2-Mar 19 8503272-8503897 2.42 × 10−06 126 30.44 3.29 × 10−09 
AFG3L1 16 90061101-90063028 11 15 13 2.43 × 10−06 75 28.76 3.34 × 10−09 
LDLRAP1 25893339-25895375 3.44 × 10−06 127 31.25 4.79 × 10−09 
FRYL − 48499380-48501697 36 63 63 4.11 × 10−06 99 31.64 5.80 × 10−09 
ITK 156679617-156682109 17 17 17 4.46 × 10−06 237 31.53 6.35 × 10−09 
MCTP2 15 95022195-95027180 13 24 24 4.64 × 10−06 55 31.32 6.71 × 10−09 
HDDC3 15 − 91474157-91474786 6.58 × 10−06 80 28.62 9.68 × 10−09 
RAP1GAP2 17 2936686-2941034 25 25 6.98 × 10−06 164 31.13 1.04 × 10−08 
ARFRP1 20 − 62329996-62332054 8.08 × 10−06 85 27.86 1.22 × 10−08 
CHST15 10 − 125767186-125769855 8.68 × 10−06 81 29.59 1.32 × 10−08 
SLC5A6 − 27422457-27423447 19 20 19 1.02 × 10−05 77 30.99 1.58 × 10−08 
SLC5A6 − 27422973-27423447 19 20 18 1.46 × 10−03 54 30.43 4.39 × 10−06 
BTN3A3 26451903-26453642 11 11 1.02 × 10−05 140 29.53 1.58 × 10−08 
GCFC1 21 − 34106213-34107378 13 18 18 1.39 × 10−05 62 29.83 2.19 × 10−08 
MKNK2 19 − 2037470-2037828 13 13 1.39 × 10−05 55 28.44 2.19 × 10−08 
TRIM58 248039202-248043436 1.44 × 10−05 880 31.19 2.34 × 10−08 
TRIM58 248023919-248024014 1.24 × 10−02 10 −0.88 4.92 × 10−05 
OXSR1 38294308-38296978 18 18 1.64 × 10−05 72 32.32 2.70 × 10−08 
POLR2A 17 7416340-7417929 27 29 29 1.64 × 10−05 67 28.77 2.72 × 10−08 
RNF219 13 − 79188421-79191257 1.91 × 10−05 63 27.84 3.23 × 10−08 
GNPTAB 12 − 102139278-102141019 13 20 20 2.00 × 10−05 85 29.10 3.40 × 10−08 
CXorf15 16859551-16862640 10 10 2.29 × 10−05 64 28.14 3.97 × 10−08 
RHCE − 25747130-25747363 10 10 2.46 × 10−05 75 27.80 4.31 × 10−08 
FHDC1 153895827-153900848 11 11 11 4.27 × 10−05 317 31.91 7.79 × 10−08 
CCNT1 12 − 49086752-49088219 4.49 × 10−05 45 30.46 8.25 × 10−08 
CAPRIN2 12 − 30862486-30863404 15 19 19 4.70 × 10−05 73 28.41 8.71 × 10−08 
RXRB − 33161366-33162606 10 10 5.98 × 10−05 64 27.55 1.12 × 10−07 
GIGYF2 233721503-233725285 23 33 33 5.99 × 10−05 43 28.04 1.13 × 10−07 
DNAJB6 157208710-157210132 12 12 12 6.27 × 10−05 165 90 1.87 1.19 × 10−07 
FAM63B 15 59146681-59149732 10 6.56 × 10−05 76 30.03 1.25 × 10−07 
USP37 − 219314974-219319740 10 26 26 7.33 × 10−05 53 30.01 1.41 × 10−07 
EME1 17 48458124-48458820 10 10 8.83 × 10−05 43 30.84 1.71 × 10−07 
SQLE 126010720-126011936 11 11 9.10 × 10−05 32 27.62 1.77 × 10−07 
GATAD2A 19 19616153-19619740 11 11 1.55 × 10−04 104 28.45 3.07 × 10−07 
RFC1 − 39289076-39290464 25 25 25 1.73 × 10−04 42 28.28 3.46 × 10−07 
RORA 15 − 60780485-60789818 10 12 12 2.42 × 10−04 140 28.47 5.02 × 10−07 
SBNO1 12 − 123773657-123780597 28 32 32 2.43 × 10−04 335 128 1.24 5.06 × 10−07 
PSMB9 32821938-32822014 2.46 × 10−04 48 27.86 5.15 × 10−07 
ADRBK2 22 26118256-26125256 16 16 2.52 × 10−04 186 33.06 5.35 × 10−07 
PRDM1 106552700-106553808 2.57 × 10−04 41 18 0.04 5.49 × 10−07 
PRDM1 106554786-106557809 1.50 × 10−02 110 29.90 6.27 × 10−05 
PRDM1 106554786-106557814 1.50 × 10−02 110 29.90 6.27 × 10−05 
PPID − 159630280-159630976 10 10 10 2.63 × 10−04 76 27.35 5.68 × 10−07 
PITPNA 17 − 1421285-1423832 10 10 2.82 × 10−04 55 30.22 6.20 × 10−07 
LHFPL2 − 77781040-77784976 2.82 × 10−04 86 29.15 6.19 × 10−07 
LHFPL2 − 77805607-77806221 2.82 × 10−04 12 −0.29 6.19 × 10−07 
CYTSB 17 20217289-20218065 15 16 16 3.02 × 10−04 56 28.96 6.70 × 10−07 
SNTB1 − 121547986-121551209 3.07 × 10−04 70 27.79 6.88 × 10−07 
TSGA14 − 130036377-130038880 11 11 3.30 × 10−04 49 28.47 7.49 × 10−07 
CCND3 − 42016239-42016610 3.33 × 10−04 43 27.68 7.60 × 10−07 
ENO2 12 7031894-7032859 12 12 3.39 × 10−04 83 29.41 7.82 × 10−07 
FLVCR2 14 76112744-76114512 10 10 3.42 × 10−04 67 27.42 7.98 × 10−07 
PTPRC 198671516-198671659 34 34 3.42 × 10−04 165 29 2.08 8.02 × 10−07 
SMAD4 18 48604626-48611409 12 12 3.77 × 10−04 53 31.76 8.91 × 10−07 
FCRL1 − 157764196-157765960 13 13 4.18 × 10−04 66 29.44 1.00 × 10−06 
C3orf63 − 56654161-56657871 18 26 26 4.22 × 10−04 124 28.62 1.02 × 10−06 
ZNF45 19 − 44416777-44419352 10 10 4.62 × 10−04 55 30.37 1.12 × 10−06 
CREBZF 11 − 85374859-85376182 4.96 × 10−04 67 31.33 1.22 × 10−06 
SLC37A1 21 44000455-44001549 20 20 5.27 × 10−04 35 32.09 1.32 × 10−06 
FAM122B − 133903597-133905384 12 12 5.54 × 10−04 94 29.22 1.39 × 10−06 
TIMM17B − 48755350-48755426 5.79 × 10−04 44 27.31 1.46 × 10−06 
CHD3 17 7814782-7816075 37 37 5.99 × 10−04 51 32.62 1.53 × 10−06 
RNF160 21 − 30300466-30302832 20 30 30 5.99 × 10−04 42 28.92 1.53 × 10−06 
SORT1 − 109852192-109856679 20 20 6.31 × 10−04 108 32.48 1.62 × 10−06 
POM121C − 75046066-75048176 6.33 × 10−04 59 31.72 1.64 × 10−06 
POM121C − 75050792-75052486 6.33 × 10−04 14 −0.29 1.64 × 10−06 
ZBTB40 22852695-22857650 10 18 18 7.60 × 10−04 90 29.12 2.00 × 10−06 
APPL2 12 − 105567075-105568226 21 21 9.03 × 10−04 32 29.36 2.39 × 10−06 
MCART1 − 37877572-37880745 9.16 × 10−04 29 30.07 2.44 × 10−06 
GOPC − 117881435-117884547 9.16 × 10−04 65 27.39 2.45 × 10−06 
PDGFD 11 − 103777915-103780547 9.54 × 10−04 60 29.12 2.60 × 10−06 
CD247 − 167399878-167400983 9.89 × 10−04 361 27.72 2.71 × 10−06 
CA1 − 86262040-86262114 12 12 1.07 × 10−03 58 26.32 2.95 × 10−06 
SYVN1 11 − 64894753-64895960 12 17 17 1.11 × 10−03 42 27.32 3.09 × 10−06 
SP2 17 46005090-46006321 1.11 × 10−03 54 26.89 3.13 × 10−06 
ST8SIA4 − 100142640-100147833 1.11 × 10−03 129 71 1.56 3.13 × 10−06 
ESRRA 11 64083179-64084210 1.12 × 10−03 69 30.36 3.19 × 10−06 
DDX26B 134715453-134716459 17 17 17 1.16 × 10−03 45 26.74 3.32 × 10−06 
RNPEPL1 241517016-241518141 11 11 1.18 × 10−03 64 30.68 3.37 × 10−06 
ZKSCAN5 99128731-99131444 1.26 × 10−03 35 29.99 3.64 × 10−06 
POM121 72416676-72418837 1.33 × 10−03 57 30.76 3.87 × 10−06 
POM121 72412376-72414061 1.33 × 10−03 10 14 −0.22 3.87 × 10−06 
TJAP1 43472499-43474294 10 14 14 1.38 × 10−03 52 28.80 4.07 × 10−06 
TBCCD1 − 186263858-186264744 1.38 × 10−03 47 27.32 4.07 × 10−06 
SHQ1 − 72798430-72799987 10 11 11 1.42 × 10−03 36 27.01 4.23 × 10−06 
CUL4A 13 113917801-113919391 10 18 18 1.44 × 10−03 83 30.07 4.31 × 10−06 
NLRP12 19 − 54310749-54311959 10 11 1.50 × 10−03 32 27.88 4.56 × 10−06 
ATF7IP 12 14650588-14651696 13 15 15 1.50 × 10−03 39 27.30 4.58 × 10−06 
ZNHIT6 − 86115107-86119781 11 11 1.50 × 10−03 47 26.99 4.55 × 10−06 
MSH3 80171570-80172633 23 24 24 1.59 × 10−03 41 28.75 4.85 × 10−06 
KIAA2026 − 5919010-5923309 1.63 × 10−03 67 29.99 5.01 × 10−06 
SH2D1B − 162365056-162367105 1.75 × 10−03 313 26.58 5.39 × 10−06 
SH2D1B − 162381673-162381928 4.00 × 10−02 47 −1.06 1.99 × 10−04 
TGFBR3 − 92145902-92149414 16 17 17 2.06 × 10−03 99 19 0.03 6.44 × 10−06 
ALDOA 16 30066105-30066248 16 16 2.21 × 10−03 26 27.87 6.95 × 10−06 
SEPSECS − 25121628-25125847 10 10 2.43 × 10−03 35 30.43 7.69 × 10−06 
PIK3C2A 11 − 17108126-17111467 32 32 2.51 × 10−03 51 30.24 7.98 × 10−06 
PIK3C2A 11 − 17190224-17191354 32 1.94 × 10−02 18 15 0.17 8.75 × 10−05 
SAPS3 11 68382100-68382799 27 28 28 2.55 × 10−03 54 29.21 8.17 × 10−06 
C11orf49 11 47183015-47183796 12 12 11 2.58 × 10−03 40 30.77 8.28 × 10−06 
TCF3 19 − 1609263-1611368 19 19 2.80 × 10−03 46 29.10 9.02 × 10−06 
RB1CC1 − 53535019-53536419 18 25 25 3.02 × 10−03 79 29.68 9.77 × 10−06 
VPRBP − 51433298-51434555 21 26 26 3.13 × 10−03 35 28.00 1.02 × 10−05 
C17orf68 17 − 8128140-8131637 22 23 23 3.23 × 10−03 46 27.31 1.06 × 10−05 
ZSCAN18 19 − 58601232-58601753 3.26 × 10−03 15 0.32 1.07 × 10−05 
SERINC5 − 79434552-79439633 13 12 3.41 × 10−03 79 30.17 1.13 × 10−05 
LINS1 15 − 101113856-101114446 3.55 × 10−03 44 28.77 1.18 × 10−05 
ATP10D 47593059-47595503 11 22 22 3.57 × 10−03 34 30.41 1.19 × 10−05 
CYHR1 − 145689200-145689995 3.67 × 10−03 43 32.53 1.23 × 10−05 
MINA − 97660661-97664186 10 12 12 4.03 × 10−03 70 27.71 1.37 × 10−05 
ELP3 28047166-28048667 13 15 15 4.03 × 10−03 34 26.78 1.37 × 10−05 
AHNAK 11 − 62283375-62301546 4.04 × 10−03 1458 606 0.31 1.38 × 10−05 
POLH 43581397-43588259 11 11 4.15 × 10−03 60 29.11 1.42 × 10−05 
SCO1 17 − 10583651-10584570 4.28 × 10−03 44 27.43 1.47 × 10−05 
PAPOLG 61024197-61026096 14 22 22 4.37 × 10−03 41 28.47 1.51 × 10−05 
TTYH2 17 72256268-72258155 15 15 4.57 × 10−03 53 29.97 1.59 × 10−05 
KIAA0355 19 34843552-34846470 11 14 14 4.59 × 10−03 73 28.43 1.60 × 10−05 
SH2D1A 123505201-123507008 5.12 × 10−03 88 26.73 1.79 × 10−05 
GRK6 176868738-176869848 12 16 16 5.20 × 10−03 36 29.55 1.83 × 10−05 
KIAA0907 − 155882836-155884111 14 14 5.27 × 10−03 51 26.56 1.86 × 10−05 
DDX19B 16 70363734-70363971 12 12 5.72 × 10−03 27 −28.00 2.05 × 10−05 
DDX19B 16 70367424-70367729 12 12 12 8.84 × 10−03 22 29.10 3.38 × 10−05 
MANEA 96053624-96057326 6.18 × 10−03 46 29.45 2.24 × 10−05 
MANEA 96034278-96034859 6.18 × 10−03 11 0.03 2.24 × 10−05 
COPB1 11 − 14521155-14521404 24 24 6.18 × 10−03 23 27.40 2.22 × 10−05 
ZNF37B 10 − 43008963-43016575 6.49 × 10−03 106 29.56 2.37 × 10−05 
ZNF37B 10 − 43047021-43047262 6.49 × 10−03 0.04 2.37 × 10−05 
FCAR 19 55399374-55400437 6.49 × 10−03 66 540 1.16 2.36 × 10−05 
ZNF498 99226814-99230030 7.64 × 10−03 53 27.07 2.83 × 10−05 
TEP1 14 − 20833827-20836718 46 46 7.91 × 10−03 57 31.96 2.96 × 10−05 
ZDHHC7 16 − 85008067-85010125 7.91 × 10−03 69 30.62 2.96 × 10−05 
MOGS − 74688185-74690139 8.02 × 10−03 63 26.72 3.01 × 10−05 
BCL7B − 72950686-72951720 8.24 × 10−03 63 28.92 3.10 × 10−05 
FAM13A − 89647106-89649810 14 24 24 8.39 × 10−03 96 30.28 3.17 × 10−05 
N4BP2L2 13 − 33016525-33018263 10 14 11 8.39 × 10−03 30 27.06 3.18 × 10−05 
NFAT5 16 69725652-69728142 10 9.53 × 10−03 26 31.02 3.66 × 10−05 
CTNS 17 3563530-3566396 14 13 9.57 × 10−03 67 30.69 3.68 × 10−05 
KIAA1467 12 13233559-13236381 12 12 1.03 × 10−02 72 31.36 4.00 × 10−05 
ZNF333 19 14829040-14831770 12 12 1.12 × 10−02 34 30.32 4.42 × 10−05 
PRKCQ 10 − 6469105-6470324 12 18 18 1.23 × 10−02 51 27.05 4.88 × 10−05 
SLC26A2 149359856-149366959 1.24 × 10−02 31 29.85 4.97 × 10−05 
SLC26A2 149357191-149357914 1.24 × 10−02 19 0.22 4.97 × 10−05 
TMCO7 16 69117388-69119083 16 18 18 1.24 × 10−02 37 26.44 4.94 × 10−05 
PDZD11 − 69506211-69506966 1.24 × 10−02 39 26.32 4.97 × 10−05 
FCGR3B − 161595935-161596192 1.24 × 10−02 74 196 1.06 4.98 × 10−05 
LPAR2 19 − 19734468-19735378 1.36 × 10−02 57 27.47 5.54 × 10−05 
LPAR2 19 − 19737352-19738093 1.36 × 10−02 32 14 0.04 5.54 × 10−05 
NAPEPLD − 102740023-102744001 1.38 × 10−02 14 29.38 5.60 × 10−05 
NAPEPLD − 102740023-102743569 2.30 × 10−02 12 −28.98 1.05 × 10−04 
PIK3CA 178951882-178952495 10 21 21 1.40 × 10−02 33 31.17 5.72 × 10−05 
STAG3L2 − 74306509-74306731 1.41 × 10−02 36 26.66 5.77 × 10−05 
DNAJC16 15894273-15898226 15 15 1.44 × 10−02 79 30.26 5.94 × 10−05 
ZNF227 19 44738855-44741420 1.49 × 10−02 44 27.42 6.17 × 10−05 
NPC1 18 − 21111464-21112248 25 25 25 1.53 × 10−02 36 27.05 6.43 × 10−05 
SHPRH − 146205947-146207923 29 29 1.54 × 10−02 25 29.37 6.51 × 10−05 
YPEL4 11 − 57412561-57413543 1.54 × 10−02 72 28.59 6.50 × 10−05 
MPHOSPH 13 20245974-20247598 14 14 14 1.54 × 10−02 69 27.28 6.49 × 10−05 
GOLM1 − 88641060-88642808 11 11 1.66 × 10−02 54 28.28 7.03 × 10−05 
VPS13B 100887646-100889807 35 56 56 1.66 × 10−02 27 29.68 7.06 × 10−05 
NLRX1 11 119050402-119050997 10 1.68 × 10−02 10 0.05 7.17 × 10−05 
C18orf8 18 21110351-21110576 16 20 19 1.74 × 10−02 32 27.64 7.45 × 10−05 
ZBTB20 − 114056947-114058273 12 12 1.74 × 10−02 41 27.40 7.51 × 10−05 
ZFYVE19 15 41099274-41100066 11 1.76 × 10−02 27 27.83 7.61 × 10−05 
RBM12 20 − 34236888-34243266 1.79 × 10−02 97 28.98 7.76 × 10−05 
RBM12 20 − 34252682-34252838 1.79 × 10−02 34 32 −0.02 7.76 × 10−05 
MEPCE 100031125-100031740 1.83 × 10−02 52 27.62 8.03 × 10−05 
ELMOD3 85617261-85618873 11 17 16 1.85 × 10−02 48 30.27 8.15 × 10−05 
NPLOC4 17 − 79523915-79526442 15 15 1.88 × 10−02 202 32.35 8.38 × 10−05 
NPLOC4 17 − 79555970-79556130 15 10 1.88 × 10−02 0.30 8.38 × 10−05 
GTF3C4 135564268-135565468 1.89 × 10−02 13 28.70 8.45 × 10−05 
GTF3C4 135553364-135555190 1.89 × 10−02 10 −26.38 8.45 × 10−05 
IGHMBP2 11 68707002-68708069 15 15 15 1.94 × 10−02 35 28.12 8.71 × 10−05 
TRIM37 17 − 57075562-57076820 14 26 25 2.28 × 10−02 36 29.83 1.04 × 10−04 
ENG − 130577292-130578332 14 16 15 2.38 × 10−02 30 30.61 1.09 × 10−04 
C14orf45 14 74516405-74516898 12 2.44 × 10−02 30 27.12 1.13 × 10−04 
CCDC91 12 28701996-28703098 11 12 12 2.54 × 10−02 30 28.77 1.18 × 10−04 
ZSCAN21 99661411-99662661 2.92 × 10−02 41 28.95 1.38 × 10−04 
ZSCAN21 99654534-99655028 2.92 × 10−02 0.10 1.38 × 10−04 
RRN3P2 16 29127448-29128036 14 14 3.14 × 10−02 31 28.51 1.52 × 10−04 
DIP2A 21 47987283-47989926 40 40 3.14 × 10−02 116 33.06 1.52 × 10−04 
ZNF611 19 − 53206067-53210117 3.25 × 10−02 140 28.67 1.58 × 10−04 
RASGRP3 33787796-33789797 15 20 20 3.31 × 10−02 36 30.57 1.61 × 10−04 
CHD7 61777575-61779463 32 32 3.37 × 10−02 26 32.90 1.65 × 10−04 
FLCN 17 − 17124486-17124942 15 15 3.59 × 10−02 45 30.05 1.77 × 10−04 
C10orf119 10 − 121588972-121591112 11 11 3.78 × 10−02 35 26.46 1.87 × 10−04 
FIGNL1 − 50511834-50514995 3.80 × 10−02 42 29.09 1.88 × 10−04 
NOL9 − 6581409-6586063 10 10 4.14 × 10−02 169 28.77 2.06 × 10−04 
GLUL − 182360310-182360539 4.40 × 10−02 79 121 1.52 2.20 × 10−04 
TRAF5 211545470-211548284 11 11 4.40 × 10−02 68 30.21 2.21 × 10−04 
DHRS7B 17 21094261-21094835 4.51 × 10−02 35 26.40 2.27 × 10−04 
NLRC3 16 − 3589038-3591915 19 19 4.51 × 10−02 106 31.12 2.28 × 10−04 
NLRC3 16 − 3613010-3614759 19 4.51 × 10−02 31 0.34 2.28 × 10−04 
ABCD1 152990323-152991621 10 4.53 × 10−02 19 27.49 2.30 × 10−04 
GRIPAP1 − 48847338-48847514 23 27 4.56 × 10−02 24 25.88 2.32 × 10−04 
CHAC2 54001279-54002287 4.63 × 10−02 46 27.32 2.37 × 10−04 
SLC33A1 − 155571012-155572167 4.78 × 10−02 48 26.51 2.45 × 10−04 
ASXL1 20 31022235-31027121 13 13 4.88 × 10−02 141 32.33 2.51 × 10−04 
CASC3 17 38296507-38297032 13 14 4.94 × 10−02 28 26.09 2.55 × 10−04 
SEC22A 122990369-122992980 4.98 × 10−02 23 27.20 2.58 × 10−04 
RPL21P28 13 27830573-27830698 0.00 1736 2.38 0.00 
RPL21P28 13 27825693-27825722 0.00 231 202 −5.86 0.00 
HNRNPA1L 13 53201573-53201713 0.00 1.00 0.00 
HNRNPA1L 13 53196124-53196339 0.00 0.10 0.00 
HNRNPA1L 13 53191605-53191817 0.00 10 −1.17 0.00 
HNRNPA1L 13 53216541-53217919 0.00 1743 −34.56 0.00 
TXLNA 32653555-32653725 11 0.00 15 0.76 0.00 
TXLNA 32658258-32658332 11 0.00 0.63 0.00 
TXLNA 32657912-32658031 11 0.00 0.62 0.00 
TXLNA 32655656-32655850 11 0.00 18 0.35 0.00 
TXLNA 32646843-32647178 11 0.00 −0.64 0.00 
TXLNA 32660503-32663885 11 11 0.00 345 −33.27 0.00 
MIER1 67452086-67454302 20 21 21 0.00 447 −31.97 0.00 
MIER1 67450255-67450335 20 21 19 2.43 × 10−10 21 24 0.59 1.73 × 10−13 
MIER1 67450255-67450275 20 21 18 5.31 × 10−08 12 15 0.51 5.08 × 10−11 
MIER1 67447462-67447601 20 21 17 1.44 × 10−05 25 36 0.34 2.30 × 10−08 
MIER1 67411833-67411978 20 21 1.82 × 10−02 29 43 0.23 7.98 × 10−05 
CSF3R − 36931644-36932509 20 20 18 0.00 1003 −32.06 0.00 
CSF3R − 36932831-36932912 20 20 16 1.63 × 10−12 44 206 0.35 7.77 × 10−16 
CSF3R − 36931644-36932428 20 20 19 5.15 × 10−11 174 999 0.05 3.01 × 10−14 
CSF3R − 36933423-36933563 20 20 14 4.53 × 10−06 61 318 0.20 6.50 × 10−09 
CSF3R − 36933159-36933252 20 20 15 5.23 × 10−04 48 244 0.22 1.30 × 10−06 
SLC25A36 140695105-140698785 0.00 241 −30.23 0.00 
SLC25A36 140695102-140698785 4.68 × 10−04 155 242 0.16 1.14 × 10−06 
CDV3 133306003-133309116 0.00 372 283 0.15 0.00 
CDV3 133306740-133309116 0.00 275 −33.17 0.00 
NUFIP2 17 − 27582855-27591609 0.00 196 −30.52 0.00 
NUFIP2 17 − 27613010-27614734 2.14 × 10−09 68 94 0.11 1.73 × 10−12 
H3F3A 226252030-226252180 0.00 822 2293 0.09 0.00 
H3F3A 226250421-226250512 0.00 255 835 −0.15 0.00 
H3F3A 226259052-226259702 0.00 4290 −33.08 0.00 
POU5F1 − 31133704-31134615 0.00 299 −30.99 0.00 
POU5F1 − 31134311-31134615 3.44 × 10−06 335 273 0.09 4.80 × 10−09 
QKI 163984452-163999627 0.00 273 −31.04 0.00 
QKI 163991726-163999627 7.22 × 10−10 171 212 0.06 5.58 × 10−13 
SUMO1 − 203070803-203071526 0.00 328 −30.28 0.00 
SUMO1 − 203070903-203072044 4.59 × 10−02 506 811 0.01 2.34 × 10−04 
C1orf9 172578956-172580971 22 25 25 0.00 200 −29.70 0.00 
LGALS3 14 55612030-55612147 0.00 139 −30.94 0.00 
NCOA1 24991093-24993568 14 23 23 0.00 97 −33.15 0.00 
WDR45 − 48957143-48957492 13 14 1.63 × 10−12 57 −32.27 7.77 × 10−16 
CREM 10 35500584-35501885 15 15 2.43 × 10−12 177 −31.41 1.22 × 10−15 
RAD17 68665124-68665291 20 21 4.15 × 10−11 78 −30.64 2.34 × 10−14 
ATXN7 63985126-63989134 12 12 5.93 × 10−11 77 −31.51 3.56 × 10−14 
GON4L − 155734577-155736500 23 33 22 9.48 × 10−11 84 −32.55 5.93 × 10−14 
PIP4K2C 12 57995709-57997210 13 14 14 1.29 × 10−10 61 −31.00 8.36 × 10−14 
ATP13A3 − 194123405-194126845 18 30 30 2.25 × 10−10 313 −30.91 1.54 × 10−13 
ZNF641 12 − 48733795-48737510 1.70 × 10−09 49 −32.63 1.34 × 10−12 
ZNF641 12 − 48741690-48741898 2.78 × 10−02 14 27.56 1.30 × 10−04 
AMPD3 11 10527255-10529126 15 16 16 1.51 × 10−08 80 −32.15 1.33 × 10−11 
TCEAL4 102841582-102842653 3.54 × 10−08 107 −29.05 3.34 × 10−11 
PRDM2 14104913-14109326 6.57 × 10−08 195 137 0.12 6.52 × 10−11 
PRDM2 14113010-14114573 6.57 × 10−08 59 −31.18 6.52 × 10−11 
LRCH4 − 100171636-10017292 18 18 18 1.36 × 10−07 60 −29.52 1.37 × 10−10 
MAP4 − 47892180-47894529 17 20 19 1.66 × 10−07 53 −30.48 1.75 × 10−10 
MAP4 − 47892180-47894428 17 20 20 1.92 × 10−06 82 29.48 2.55 × 10−09 
MXD3 − 176732501-176734196 4.26 × 10−07 82 −28.74 4.85 × 10−10 
SLC4A1 17 − 42325759-42327906 20 20 20 8.44 × 10−07 3390 1884 −0.83 1.01 × 10−09 
LIPA 10 − 91011464-91011660 12 12 8.84 × 10−07 78 −28.02 1.09 × 10−09 
STRADA 17 − 61780194-61781111 13 15 15 8.84 × 10−07 58 −28.26 1.09 × 10−09 
LSM5 − 32529637-32530475 1.03 × 10−06 72 −29.98 1.31 × 10−09 
ERI2 16 − 20807662-20810389 11 1.96 × 10−06 75 −32.21 2.62 × 10−09 
SC5DL 11 121177766-121184117 7.40 × 10−06 133 −28.25 1.11 × 10−08 
PKN2 89298928-89301937 18 22 22 1.03 × 10−05 55 −29.92 1.60 × 10−08 
CEACAM1 19 − 43011459-43013380 1.59 × 10−05 146 −28.49 2.59 × 10−08 
NF2 22 30090741-30094583 18 18 1.88 × 10−05 162 −33.73 3.16 × 10−08 
NF2 22 30070825-30070930 18 12 3.50 × 10−02 2.02 1.72 × 10−04 
PRKCB 16 24231282-24231930 15 18 18 2.10 × 10−05 39 −34.39 3.60 × 10−08 
CBL 11 119170205-119178858 16 16 2.75 × 10−05 84 −30.64 4.86 × 10−08 
TGFBR2 30732912-30735631 3.34 × 10−05 72 −30.44 6.02 × 10−08 
TGFBR2 30713130-30713929 4.94 × 10−02 14 10 0.21 2.55 × 10−04 
AKAP2 112898407-112900819 3.34 × 10−05 44 80 −0.05 6.06 × 10−08 
AKAP2 112930679-112934789 3.34 × 10−05 71 −28.15 6.06 × 10−08 
UHRF1BP1 34840090-34845289 21 21 4.90 × 10−05 49 −31.33 9.13 × 10−08 
SMCR7 17 18167098-18169093 1.03 × 10−04 23 −29.44 2.02 × 10−07 
SMCR7 17 18167024-18169093 7.14 × 10−03 22 27.99 2.62 × 10−05 
NDUFV1 11 67374323-67374520 11 11 1.60 × 10−04 −28.18 3.19 × 10−07 
BCOR − 39931602-39934433 10 15 1.76 × 10−04 43 −29.87 3.54 × 10−07 
FGD4 12 32793210-32798982 17 17 1.90 × 10−04 90 −31.24 3.85 × 10−07 
SRCAP 16 30748370-30751449 29 29 2.13 × 10−04 36 29.81 4.36 × 10−07 
SRCAP 16 30734905-30736403 29 21 2.13 × 10−04 22 −30.64 4.36 × 10−07 
OAS1 12 113357194-113357711 2.42 × 10−04 29 −29.09 5.02 × 10−07 
ETS2 21 40194598-40196876 2.52 × 10−04 171 −30.13 5.35 × 10−07 
C7orf28A 5965263-5965601 2.98 × 10−04 46 −30.72 6.59 × 10−07 
PIGN 18 − 59711460-59713212 23 31 31 3.07 × 10−04 54 −29.06 6.89 × 10−07 
SELP − 169558090-169558699 15 17 17 3.28 × 10−04 35 −29.54 7.39 × 10−07 
XRCC4 82648950-82649577 10 10 3.38 × 10−04 40 −28.80 7.76 × 10−07 
SIGLEC14 19 − 52149510-52149893 3.40 × 10−04 84 −28.80 7.87 × 10−07 
CDK12 17 37686884-37690799 15 15 3.75 × 10−04 38 −31.39 8.82 × 10−07 
ATF3 212792388-212794114 4.11 × 10−04 73 −27.83 9.78 × 10−07 
MYH11 16 − 15818745-15818849 16 13 4.53 × 10−04 21 −29.20 1.09 × 10−06 
ABR 17 − 906760-909409 22 18 4.96 × 10−04 36 −30.39 1.22 × 10−06 
OLFM4 13 53624104-53626186 5.23 × 10−04 405 −29.11 1.30 × 10−06 
HIVEP1 12120123-12126103 6.98 × 10−04 13 27.93 1.83 × 10−06 
HIVEP1 12163516-12165231 6.98 × 10−04 26 −29.98 1.83 × 10−06 
MIDN 19 1256994-1259139 6.98 × 10−04 239 −31.82 1.82 × 10−06 
CEP63 134204575-134204894 15 19 9.33 × 10−04 38 −29.07 2.51 × 10−06 
RREB1 7248744-7252212 14 14 9.34 × 10−04 69 −31.98 2.52 × 10−06 
NCOA6 20 − 33328167-33331145 10 9.41 × 10−04 27 −30.79 2.55 × 10−06 
NISCH 52525888-52527087 18 21 21 1.02 × 10−03 34 −28.34 2.79 × 10−06 
RNF111 15 59323003-59323901 11 13 1.08 × 10−03 29 −28.45 3.00 × 10−06 
YLPM1 14 75264283-75266400 15 21 1.11 × 10−03 33 −28.11 3.13 × 10−06 
PML 15 74327513-74328734 10 13 10 1.12 × 10−03 39 −30.59 3.18 × 10−06 
SLC41A1 − 205758221-205760846 11 11 1.33 × 10−03 37 −30.47 3.85 × 10−06 
RNF19B − 33402052-33402910 10 11 10 1.40 × 10−03 43 −27.66 4.13 × 10−06 
SLC17A9 20 61598689-61599941 13 13 1.42 × 10−03 53 −29.47 4.21 × 10−06 
RIN3 14 93154271-93155332 1.59 × 10−03 21 37 −0.01 4.88 × 10−06 
RIN3 14 93117927-93119420 3.01 × 10−02 62 −29.47 1.45 × 10−04 
RTN4 − 5525222-55254621 10 1.90 × 10−03 29 −29.39 5.89 × 10−06 
DHX34 19 47856011-47856992 16 17 2.05 × 10−03 42 −29.13 6.37 × 10−06 
TMEM68 − 56651320-56652777 2.24 × 10−03 36 −29.39 7.05 × 10−06 
SSH2 17 − 2795296-27959949 11 11 2.54 × 10−03 101 −29.84 8.10 × 10−06 
FCGR2C 161569420-161570031 3.18 × 10−03 33 39 −0.01 1.04 × 10−05 
SLCO4C1 − 101569694-101572722 13 13 3.48 × 10−03 66 −29.04 1.15 × 10−05 
IL21R 16 27459855-27462115 10 10 3.63 × 10−03 27 −29.51 1.22 × 10−05 
MED6 14 − 71050958-71051660 3.80 × 10−03 39 −27.26 1.28 × 10−05 
STEAP4 − 87905750-87908943 4.35 × 10−03 93 −28.18 1.50 × 10−05 
PRNP 20 4667157-4667382 4.40 × 10−03 40 −27.50 1.53 × 10−05 
PAPD7 6754867-6757161 5.59 × 10−03 20 27.14 1.99 × 10−05 
PAPD7 6754764-6757161 5.59 × 10−03 17 −28.94 1.99 × 10−05 
KIF24 − 34255733-34257979 12 10 5.60 × 10−03 14 −29.00 2.00 × 10−05 
TMCC3 12 − 94960900-94965513 6.85−03 293 −27.77 2.51 × 10−05 
TMCC3 12 − 94975398-94976314 2.26 × 10−02 100 0.08 1.03 × 10−04 
C10orf18 10 5804992-5806943 15 15 7.20 × 10−03 32 −30.92 2.66 × 10−05 
SMYD5 73452924-73454355 13 13 7.73 × 10−03 24 −29.40 2.87 × 10−05 
EP400 12 132561946-132565004 27 27 8.76 × 10−03 54 17 0.15 3.34 × 10−05 
EP400 12 132445130-132446499 27 8.76 × 10−03 18 −32.52 3.34 × 10−05 
FRY 13 32869339-32870775 57 57 9.80 × 10−03 40 −31.47 3.78 × 10−05 
NPIPL3 16 − 21426278-21426406 9.91 × 10−03 0.19 3.84 × 10−05 
NPIPL3 16 − 21436621-21436658 2.92 × 10−02 −0.42 1.38 × 10−04 
IL1R1 102792813-102796333 10 10 1.06 × 10−02 107 −29.14 4.12 × 10−05 
SLC35E3 12 69158484-69159851 1.09 × 10−02 33 −26.93 4.27 × 10−05 
ELF2 − 140058784-140059021 10 11 1.09 × 10−02 22 −28.48 4.28 × 10−05 
LUZP1 − -23410516-23415546 1.19 × 10−02 36 −26.87 4.70 × 10−05 
MLH3 14 − 75513079-75516421 12 1.41 × 10−02 19 −31.99 5.81 × 10−05 
VCAM1 101203679-101204599 1.50 × 10−02 51 −26.73 6.20 × 10−05 
ADPRH 119306311-119308791 1.67 × 10−02 53 −26.88 7.13 × 10−05 
ALCAM 105085713-105086325 15 16 1.81 × 10−02 34 −27.99 7.88 × 10−05 
CHKB 22 − 51019849-51019982 1.81 × 10−02 20 −28.43 7.89 × 10−05 
PPIP5K1 15 − 43825660-43827674 20 36 36 1.84 × 10−02 24 −27.56 8.10 × 10−05 
CLEC5A − 141627157-141630018 1.87 × 10−02 252 −28.64 8.27 × 10−05 
MICAL3 22 − 18342922-18347752 28 21 1.95 × 10−02 35 25 −0.06 8.81 × 10−05 
LRP12 − 105501459-105503767 2.08 × 10−02 26 −28.17 9.40 × 10−05 
SRGAP2 206634382-206637782 15 21 21 2.13 × 10−02 21 −28.97 9.64 × 10−05 
GGCX − 85776193-85777249 12 15 15 2.32 × 10−02 25 −27.44 1.06 × 10−04 
SLC8A1 − 40339287-40342769 2.49 × 10−02 26 29 −0.34 1.16 × 10−04 
SLC8A1 − 40655613-40657444 2.49 × 10−02 41 −28.24 1.16 × 10−04 
DHRS4 14 24437966-24438486 2.70 × 10−02 22 −26.85 1.26 × 10−04 
VPS13A 80030872-80032397 22 72 72 2.74 × 10−02 14 −31.43 1.28 × 10−04 
HLA-DPB1 33054316-33054976 2.81 × 10−02 151 368 −0.91 1.33 × 10−04 
SKA2 17 − 57232317-57232800 2.81 × 10−02 26 −27.22 1.32 × 10−04 
METTL4 18 − 2537525-2539144 2.95 × 10−02 19 −27.47 1.41 × 10−04 
CRAMP1L 16 1705878-1706993 13 2.96 × 10−02 28.86 1.42 × 10−04 
CRAMP1L 16 1723882-1727907 13 13 2.96 × 10−02 25 −31.99 1.42 × 10−04 
IKBKG 153792534-153793260 10 11 11 3.01 × 10−02 20 −29.87 1.45 × 10−04 
LEPR 65886248-65886423 20 22 3.34 × 10−02 16 −28.60 1.63 × 10−04 
XPNPEP3 22 41322273-41323878 10 10 3.50 × 10−02 24 −28.94 1.72 × 10−04 
CTSH 15 − 79237293-79237420 13 14 4.08 × 10−02 25 −27.42 2.03 × 10−04 
BEST1 11 61731576-61731939 4.40 × 10−02 75 −27.40 2.21 × 10−04 
C11orf48 11 − 62439036-62439241 4.58 × 10−02 16 −28.26 2.34 × 10−04 
GeneChromosomeStrandExon locationNo. of exon testNo. of exonsExon no.Adjusted PBase MBase NLog2fold (mutant/healthy donor)P
SIRPB1 20 − 1577987-1578928 11 11 0.00 125 33.46 0.00 
SIRPB1 20 − 1584456-1584788 11 11 1.63 × 10−12 74 32.79 7.77 × 10−16 
SIRPB1 20 − 1585388-1585705 11 11 2.52 × 10−07 47 32.00 2.81 × 10−10 
SIRPB1 20 − 1579468-1579582 11 11 1.44 × 10−05 34 31.72 2.33 × 10−08 
SIRPB1 20 − 1592003-1592359 11 11 2.58 × 10−04 95 32.88 5.54 × 10−07 
AKAP13 15 86287859-86292586 36 38 38 0.00 258 30.91 0.00 
HBG2 11 − 5275867-5276011 0.00 15 658 30.03 0.00 
HBG2 11 − 5274421-5274635 1.64 × 10−05 29 067 344 −0.14 2.73 × 10−08 
PHF3 64421482-64424405 15 15 15 0.00 141 29.99 0.00 
CD37 19 49838677-49838832 0.00 111 29.65 0.00 
NIPAL3 24795476-24799472 12 12 12 0.00 173 29.40 0.00 
VPS36 13 − 52986739-52990058 13 14 14 0.00 222 28.94 0.00 
HELZ 17 − 65066555-65074702 29 33 33 7.76 × 10−13 153 29.12 3.33 × 10−16 
CTTN 11 70281132-70282689 16 19 19 1.51 × 10−12 419 31.66 6.66 × 10−16 
RSAD2 7035909-7038363 2.26 × 10−12 308 27.95 1.11 × 10−15 
RPS17 15 − 83207631-83207736 3.23 × 10−12 220 33.49 1.67 × 10−15 
POU2F2 19 − 42592673-42595743 10 13 13 6.74 × 10−12 280 29.46 3.55 × 10−15 
PARP14 122447155-122449686 17 17 17 2.06 × 10−11 128 29.10 1.11 × 10−14 
RAPGEF6 − 130759616-130762984 29 30 30 2.72 × 10−11 127 30.14 1.50 × 10−14 
CARD8 19 − 48711344-48715232 10 10 10 5.15 × 10−11 115 29.40 3.03 × 10−14 
TSC1 − 135766735-135772141 15 24 24 6.01 × 10−11 164 30.44 3.69 × 10−14 
ATM 11 108236052-108239826 54 64 64 1.13 × 10−10 200 31.49 7.21 × 10−14 
RABL3 − 120405530-120408735 1.58 × 10−10 102 30.15 1.07 × 10−13 
CCDC25 − 27590835-27593762 1.58 × 10−10 108 29.79 1.07 × 10−13 
MEGF9 − 123363091-123367919 2.41 × 10−10 262 31.12 1.68 × 10−13 
IL32 16 3119282-3119667 11 11 3.05 × 10−10 345 31.09 2.21 × 10−13 
IL32 16 3118991-3119667 11 10 1.53 × 10−02 665 85 −0.12 6.40 × 10−05 
DDX54 12 − 113594984-113596914 21 21 21 3.19 × 10−10 90 28.84 2.34 × 10−13 
TTC14 180327418-180328917 13 13 13 4.73 × 10−10 95 28.73 3.54 × 10−13 
ADPGK 15 − 73043710-73045236 6.16 × 10−10 102 32.16 4.69 × 10−13 
ADPGK 15 − 73043710-73045233 2.35 × 10−05 101 98 −0.11 4.10 × 10−08 
EZH1 17 − 40852294-40854610 19 21 21 2.04 × 10−09 131 28.95 1.63 × 10−12 
MADD 11 47350597-47351582 35 38 38 5.39 × 10−09 90 29.52 4.43 × 10−12 
RABL2B 22 − 51205920-51207302 13 13 13 5.49 × 10−09 80 29.36 4.58 × 10−12 
RABL2B 22 − 51207883-51207977 13 13 10 2.93 × 10−02 16 −28.17 1.39 × 10−04 
ZNF638 71649944-71651168 24 28 22 6.95 × 10−09 84 30.73 5.88 × 10−12 
SON 21 34948671-34949812 13 13 13 8.44 × 10−09 76 32.49 7.25 × 10−12 
IDE 10 − 94211441-94214296 24 25 25 9.99 × 10−09 71 29.31 8.69 × 10−12 
MOBKL1A 71847697-71853890 2.45 × 10−08 268 30.54 2.22 × 10−11 
ZNF592 15 85345094-85349661 10 11 11 2.45 × 10−08 81 29.21 2.20 × 10−11 
RPRD1B 20 36718128-36720764 2.62 × 10−08 112 29.42 2.41 × 10−11 
ARHGEF7 13 111955338-111958080 11 23 23 2.99 × 10−08 120 32.24 2.78 × 10−11 
KDM5D − 21867303-21868231 27 28 28 5.42 × 10−08 92 28.78 5.25 × 10−11 
ZNF295 21 − 43406941-43414217 1.51 × 10−07 28 30.45 1.55 × 10−10 
ZNF295 21 − 43406941-43411998 6.31 × 10−06 80 −27.93 9.20 × 10−09 
ARHGAP27 17 − 43471269-43472999 11 17 17 1.51 × 10−07 154 29.46 1.56 × 10−10 
CEP350 180080132-180084014 22 36 36 1.62 × 10−07 102 32.63 1.69 × 10−10 
R3HDM1 136481507-136482836 19 25 25 1.85 × 10−07 66 29.65 1.97 × 10−10 
TRMT5 14 − 61438169-61441912 2.25 × 10−07 180 30.11 2.43 × 10−10 
TRMT5 14 − 61445949-61446604 5.94 × 10−07 25 23 −0.36 6.99 × 10−10 
CA5B 15800608-15805747 2.31 × 10−07 114 30.37 2.52 × 10−10 
KIAA0319L − 35899092-35900682 20 21 21 2.52 × 10−07 73 27.72 2.81 × 10−10 
CD3E 11 118186201-118186889 4.06 × 10−07 238 27.14 4.57 × 10−10 
GTF2E1 120499890-120501915 4.96 × 10−07 138 32.16 5.72 × 10−10 
GTF2E1 120469370-120469847 1.39 × 10−06 11 20 0.11 1.83 × 10−09 
SLC9A8 20 48504366-48508772 16 16 5.36 × 10−07 65 30.44 6.25 × 10−10 
ST6GALNA − 130647601-130649067 7.62 × 10−07 136 28.77 9.06 × 10−10 
FCHSD1 − 141018870-141021130 15 20 20 8.83 × 10−07 94 27.20 1.07 × 10−09 
RUNX3 − 25226003-25229157 1.01 × 10−06 375 30.61 1.26 × 10−09 
CHD9 16 53357932-53361413 15 38 38 1.16 × 10−06 71 32.47 1.47 × 10−09 
ATG10 81272012-81272146 1.39 × 10−06 437 1440 −0.66 1.79 × 10−09 
ATG10 81267844-81268125 3.04 × 10−05 201 155 1.44 5.40 × 10−08 
NAA16 13 41949541-41951166 18 22 22 1.39 × 10−06 55 29.50 1.83 × 10−09 
LPIN1 11964758-11967531 14 20 20 1.98 × 10−06 80 29.54 2.67 × 10−09 
2-Mar 19 8503272-8503897 2.42 × 10−06 126 30.44 3.29 × 10−09 
AFG3L1 16 90061101-90063028 11 15 13 2.43 × 10−06 75 28.76 3.34 × 10−09 
LDLRAP1 25893339-25895375 3.44 × 10−06 127 31.25 4.79 × 10−09 
FRYL − 48499380-48501697 36 63 63 4.11 × 10−06 99 31.64 5.80 × 10−09 
ITK 156679617-156682109 17 17 17 4.46 × 10−06 237 31.53 6.35 × 10−09 
MCTP2 15 95022195-95027180 13 24 24 4.64 × 10−06 55 31.32 6.71 × 10−09 
HDDC3 15 − 91474157-91474786 6.58 × 10−06 80 28.62 9.68 × 10−09 
RAP1GAP2 17 2936686-2941034 25 25 6.98 × 10−06 164 31.13 1.04 × 10−08 
ARFRP1 20 − 62329996-62332054 8.08 × 10−06 85 27.86 1.22 × 10−08 
CHST15 10 − 125767186-125769855 8.68 × 10−06 81 29.59 1.32 × 10−08 
SLC5A6 − 27422457-27423447 19 20 19 1.02 × 10−05 77 30.99 1.58 × 10−08 
SLC5A6 − 27422973-27423447 19 20 18 1.46 × 10−03 54 30.43 4.39 × 10−06 
BTN3A3 26451903-26453642 11 11 1.02 × 10−05 140 29.53 1.58 × 10−08 
GCFC1 21 − 34106213-34107378 13 18 18 1.39 × 10−05 62 29.83 2.19 × 10−08 
MKNK2 19 − 2037470-2037828 13 13 1.39 × 10−05 55 28.44 2.19 × 10−08 
TRIM58 248039202-248043436 1.44 × 10−05 880 31.19 2.34 × 10−08 
TRIM58 248023919-248024014 1.24 × 10−02 10 −0.88 4.92 × 10−05 
OXSR1 38294308-38296978 18 18 1.64 × 10−05 72 32.32 2.70 × 10−08 
POLR2A 17 7416340-7417929 27 29 29 1.64 × 10−05 67 28.77 2.72 × 10−08 
RNF219 13 − 79188421-79191257 1.91 × 10−05 63 27.84 3.23 × 10−08 
GNPTAB 12 − 102139278-102141019 13 20 20 2.00 × 10−05 85 29.10 3.40 × 10−08 
CXorf15 16859551-16862640 10 10 2.29 × 10−05 64 28.14 3.97 × 10−08 
RHCE − 25747130-25747363 10 10 2.46 × 10−05 75 27.80 4.31 × 10−08 
FHDC1 153895827-153900848 11 11 11 4.27 × 10−05 317 31.91 7.79 × 10−08 
CCNT1 12 − 49086752-49088219 4.49 × 10−05 45 30.46 8.25 × 10−08 
CAPRIN2 12 − 30862486-30863404 15 19 19 4.70 × 10−05 73 28.41 8.71 × 10−08 
RXRB − 33161366-33162606 10 10 5.98 × 10−05 64 27.55 1.12 × 10−07 
GIGYF2 233721503-233725285 23 33 33 5.99 × 10−05 43 28.04 1.13 × 10−07 
DNAJB6 157208710-157210132 12 12 12 6.27 × 10−05 165 90 1.87 1.19 × 10−07 
FAM63B 15 59146681-59149732 10 6.56 × 10−05 76 30.03 1.25 × 10−07 
USP37 − 219314974-219319740 10 26 26 7.33 × 10−05 53 30.01 1.41 × 10−07 
EME1 17 48458124-48458820 10 10 8.83 × 10−05 43 30.84 1.71 × 10−07 
SQLE 126010720-126011936 11 11 9.10 × 10−05 32 27.62 1.77 × 10−07 
GATAD2A 19 19616153-19619740 11 11 1.55 × 10−04 104 28.45 3.07 × 10−07 
RFC1 − 39289076-39290464 25 25 25 1.73 × 10−04 42 28.28 3.46 × 10−07 
RORA 15 − 60780485-60789818 10 12 12 2.42 × 10−04 140 28.47 5.02 × 10−07 
SBNO1 12 − 123773657-123780597 28 32 32 2.43 × 10−04 335 128 1.24 5.06 × 10−07 
PSMB9 32821938-32822014 2.46 × 10−04 48 27.86 5.15 × 10−07 
ADRBK2 22 26118256-26125256 16 16 2.52 × 10−04 186 33.06 5.35 × 10−07 
PRDM1 106552700-106553808 2.57 × 10−04 41 18 0.04 5.49 × 10−07 
PRDM1 106554786-106557809 1.50 × 10−02 110 29.90 6.27 × 10−05 
PRDM1 106554786-106557814 1.50 × 10−02 110 29.90 6.27 × 10−05 
PPID − 159630280-159630976 10 10 10 2.63 × 10−04 76 27.35 5.68 × 10−07 
PITPNA 17 − 1421285-1423832 10 10 2.82 × 10−04 55 30.22 6.20 × 10−07 
LHFPL2 − 77781040-77784976 2.82 × 10−04 86 29.15 6.19 × 10−07 
LHFPL2 − 77805607-77806221 2.82 × 10−04 12 −0.29 6.19 × 10−07 
CYTSB 17 20217289-20218065 15 16 16 3.02 × 10−04 56 28.96 6.70 × 10−07 
SNTB1 − 121547986-121551209 3.07 × 10−04 70 27.79 6.88 × 10−07 
TSGA14 − 130036377-130038880 11 11 3.30 × 10−04 49 28.47 7.49 × 10−07 
CCND3 − 42016239-42016610 3.33 × 10−04 43 27.68 7.60 × 10−07 
ENO2 12 7031894-7032859 12 12 3.39 × 10−04 83 29.41 7.82 × 10−07 
FLVCR2 14 76112744-76114512 10 10 3.42 × 10−04 67 27.42 7.98 × 10−07 
PTPRC 198671516-198671659 34 34 3.42 × 10−04 165 29 2.08 8.02 × 10−07 
SMAD4 18 48604626-48611409 12 12 3.77 × 10−04 53 31.76 8.91 × 10−07 
FCRL1 − 157764196-157765960 13 13 4.18 × 10−04 66 29.44 1.00 × 10−06 
C3orf63 − 56654161-56657871 18 26 26 4.22 × 10−04 124 28.62 1.02 × 10−06 
ZNF45 19 − 44416777-44419352 10 10 4.62 × 10−04 55 30.37 1.12 × 10−06 
CREBZF 11 − 85374859-85376182 4.96 × 10−04 67 31.33 1.22 × 10−06 
SLC37A1 21 44000455-44001549 20 20 5.27 × 10−04 35 32.09 1.32 × 10−06 
FAM122B − 133903597-133905384 12 12 5.54 × 10−04 94 29.22 1.39 × 10−06 
TIMM17B − 48755350-48755426 5.79 × 10−04 44 27.31 1.46 × 10−06 
CHD3 17 7814782-7816075 37 37 5.99 × 10−04 51 32.62 1.53 × 10−06 
RNF160 21 − 30300466-30302832 20 30 30 5.99 × 10−04 42 28.92 1.53 × 10−06 
SORT1 − 109852192-109856679 20 20 6.31 × 10−04 108 32.48 1.62 × 10−06 
POM121C − 75046066-75048176 6.33 × 10−04 59 31.72 1.64 × 10−06 
POM121C − 75050792-75052486 6.33 × 10−04 14 −0.29 1.64 × 10−06 
ZBTB40 22852695-22857650 10 18 18 7.60 × 10−04 90 29.12 2.00 × 10−06 
APPL2 12 − 105567075-105568226 21 21 9.03 × 10−04 32 29.36 2.39 × 10−06 
MCART1 − 37877572-37880745 9.16 × 10−04 29 30.07 2.44 × 10−06 
GOPC − 117881435-117884547 9.16 × 10−04 65 27.39 2.45 × 10−06 
PDGFD 11 − 103777915-103780547 9.54 × 10−04 60 29.12 2.60 × 10−06 
CD247 − 167399878-167400983 9.89 × 10−04 361 27.72 2.71 × 10−06 
CA1 − 86262040-86262114 12 12 1.07 × 10−03 58 26.32 2.95 × 10−06 
SYVN1 11 − 64894753-64895960 12 17 17 1.11 × 10−03 42 27.32 3.09 × 10−06 
SP2 17 46005090-46006321 1.11 × 10−03 54 26.89 3.13 × 10−06 
ST8SIA4 − 100142640-100147833 1.11 × 10−03 129 71 1.56 3.13 × 10−06 
ESRRA 11 64083179-64084210 1.12 × 10−03 69 30.36 3.19 × 10−06 
DDX26B 134715453-134716459 17 17 17 1.16 × 10−03 45 26.74 3.32 × 10−06 
RNPEPL1 241517016-241518141 11 11 1.18 × 10−03 64 30.68 3.37 × 10−06 
ZKSCAN5 99128731-99131444 1.26 × 10−03 35 29.99 3.64 × 10−06 
POM121 72416676-72418837 1.33 × 10−03 57 30.76 3.87 × 10−06 
POM121 72412376-72414061 1.33 × 10−03 10 14 −0.22 3.87 × 10−06 
TJAP1 43472499-43474294 10 14 14 1.38 × 10−03 52 28.80 4.07 × 10−06 
TBCCD1 − 186263858-186264744 1.38 × 10−03 47 27.32 4.07 × 10−06 
SHQ1 − 72798430-72799987 10 11 11 1.42 × 10−03 36 27.01 4.23 × 10−06 
CUL4A 13 113917801-113919391 10 18 18 1.44 × 10−03 83 30.07 4.31 × 10−06 
NLRP12 19 − 54310749-54311959 10 11 1.50 × 10−03 32 27.88 4.56 × 10−06 
ATF7IP 12 14650588-14651696 13 15 15 1.50 × 10−03 39 27.30 4.58 × 10−06 
ZNHIT6 − 86115107-86119781 11 11 1.50 × 10−03 47 26.99 4.55 × 10−06 
MSH3 80171570-80172633 23 24 24 1.59 × 10−03 41 28.75 4.85 × 10−06 
KIAA2026 − 5919010-5923309 1.63 × 10−03 67 29.99 5.01 × 10−06 
SH2D1B − 162365056-162367105 1.75 × 10−03 313 26.58 5.39 × 10−06 
SH2D1B − 162381673-162381928 4.00 × 10−02 47 −1.06 1.99 × 10−04 
TGFBR3 − 92145902-92149414 16 17 17 2.06 × 10−03 99 19 0.03 6.44 × 10−06 
ALDOA 16 30066105-30066248 16 16 2.21 × 10−03 26 27.87 6.95 × 10−06 
SEPSECS − 25121628-25125847 10 10 2.43 × 10−03 35 30.43 7.69 × 10−06 
PIK3C2A 11 − 17108126-17111467 32 32 2.51 × 10−03 51 30.24 7.98 × 10−06 
PIK3C2A 11 − 17190224-17191354 32 1.94 × 10−02 18 15 0.17 8.75 × 10−05 
SAPS3 11 68382100-68382799 27 28 28 2.55 × 10−03 54 29.21 8.17 × 10−06 
C11orf49 11 47183015-47183796 12 12 11 2.58 × 10−03 40 30.77 8.28 × 10−06 
TCF3 19 − 1609263-1611368 19 19 2.80 × 10−03 46 29.10 9.02 × 10−06 
RB1CC1 − 53535019-53536419 18 25 25 3.02 × 10−03 79 29.68 9.77 × 10−06 
VPRBP − 51433298-51434555 21 26 26 3.13 × 10−03 35 28.00 1.02 × 10−05 
C17orf68 17 − 8128140-8131637 22 23 23 3.23 × 10−03 46 27.31 1.06 × 10−05 
ZSCAN18 19 − 58601232-58601753 3.26 × 10−03 15 0.32 1.07 × 10−05 
SERINC5 − 79434552-79439633 13 12 3.41 × 10−03 79 30.17 1.13 × 10−05 
LINS1 15 − 101113856-101114446 3.55 × 10−03 44 28.77 1.18 × 10−05 
ATP10D 47593059-47595503 11 22 22 3.57 × 10−03 34 30.41 1.19 × 10−05 
CYHR1 − 145689200-145689995 3.67 × 10−03 43 32.53 1.23 × 10−05 
MINA − 97660661-97664186 10 12 12 4.03 × 10−03 70 27.71 1.37 × 10−05 
ELP3 28047166-28048667 13 15 15 4.03 × 10−03 34 26.78 1.37 × 10−05 
AHNAK 11 − 62283375-62301546 4.04 × 10−03 1458 606 0.31 1.38 × 10−05 
POLH 43581397-43588259 11 11 4.15 × 10−03 60 29.11 1.42 × 10−05 
SCO1 17 − 10583651-10584570 4.28 × 10−03 44 27.43 1.47 × 10−05 
PAPOLG 61024197-61026096 14 22 22 4.37 × 10−03 41 28.47 1.51 × 10−05 
TTYH2 17 72256268-72258155 15 15 4.57 × 10−03 53 29.97 1.59 × 10−05 
KIAA0355 19 34843552-34846470 11 14 14 4.59 × 10−03 73 28.43 1.60 × 10−05 
SH2D1A 123505201-123507008 5.12 × 10−03 88 26.73 1.79 × 10−05 
GRK6 176868738-176869848 12 16 16 5.20 × 10−03 36 29.55 1.83 × 10−05 
KIAA0907 − 155882836-155884111 14 14 5.27 × 10−03 51 26.56 1.86 × 10−05 
DDX19B 16 70363734-70363971 12 12 5.72 × 10−03 27 −28.00 2.05 × 10−05 
DDX19B 16 70367424-70367729 12 12 12 8.84 × 10−03 22 29.10 3.38 × 10−05 
MANEA 96053624-96057326 6.18 × 10−03 46 29.45 2.24 × 10−05 
MANEA 96034278-96034859 6.18 × 10−03 11 0.03 2.24 × 10−05 
COPB1 11 − 14521155-14521404 24 24 6.18 × 10−03 23 27.40 2.22 × 10−05 
ZNF37B 10 − 43008963-43016575 6.49 × 10−03 106 29.56 2.37 × 10−05 
ZNF37B 10 − 43047021-43047262 6.49 × 10−03 0.04 2.37 × 10−05 
FCAR 19 55399374-55400437 6.49 × 10−03 66 540 1.16 2.36 × 10−05 
ZNF498 99226814-99230030 7.64 × 10−03 53 27.07 2.83 × 10−05 
TEP1 14 − 20833827-20836718 46 46 7.91 × 10−03 57 31.96 2.96 × 10−05 
ZDHHC7 16 − 85008067-85010125 7.91 × 10−03 69 30.62 2.96 × 10−05 
MOGS − 74688185-74690139 8.02 × 10−03 63 26.72 3.01 × 10−05 
BCL7B − 72950686-72951720 8.24 × 10−03 63 28.92 3.10 × 10−05 
FAM13A − 89647106-89649810 14 24 24 8.39 × 10−03 96 30.28 3.17 × 10−05 
N4BP2L2 13 − 33016525-33018263 10 14 11 8.39 × 10−03 30 27.06 3.18 × 10−05 
NFAT5 16 69725652-69728142 10 9.53 × 10−03 26 31.02 3.66 × 10−05 
CTNS 17 3563530-3566396 14 13 9.57 × 10−03 67 30.69 3.68 × 10−05 
KIAA1467 12 13233559-13236381 12 12 1.03 × 10−02 72 31.36 4.00 × 10−05 
ZNF333 19 14829040-14831770 12 12 1.12 × 10−02 34 30.32 4.42 × 10−05 
PRKCQ 10 − 6469105-6470324 12 18 18 1.23 × 10−02 51 27.05 4.88 × 10−05 
SLC26A2 149359856-149366959 1.24 × 10−02 31 29.85 4.97 × 10−05 
SLC26A2 149357191-149357914 1.24 × 10−02 19 0.22 4.97 × 10−05 
TMCO7 16 69117388-69119083 16 18 18 1.24 × 10−02 37 26.44 4.94 × 10−05 
PDZD11 − 69506211-69506966 1.24 × 10−02 39 26.32 4.97 × 10−05 
FCGR3B − 161595935-161596192 1.24 × 10−02 74 196 1.06 4.98 × 10−05 
LPAR2 19 − 19734468-19735378 1.36 × 10−02 57 27.47 5.54 × 10−05 
LPAR2 19 − 19737352-19738093 1.36 × 10−02 32 14 0.04 5.54 × 10−05 
NAPEPLD − 102740023-102744001 1.38 × 10−02 14 29.38 5.60 × 10−05 
NAPEPLD − 102740023-102743569 2.30 × 10−02 12 −28.98 1.05 × 10−04 
PIK3CA 178951882-178952495 10 21 21 1.40 × 10−02 33 31.17 5.72 × 10−05 
STAG3L2 − 74306509-74306731 1.41 × 10−02 36 26.66 5.77 × 10−05 
DNAJC16 15894273-15898226 15 15 1.44 × 10−02 79 30.26 5.94 × 10−05 
ZNF227 19 44738855-44741420 1.49 × 10−02 44 27.42 6.17 × 10−05 
NPC1 18 − 21111464-21112248 25 25 25 1.53 × 10−02 36 27.05 6.43 × 10−05 
SHPRH − 146205947-146207923 29 29 1.54 × 10−02 25 29.37 6.51 × 10−05 
YPEL4 11 − 57412561-57413543 1.54 × 10−02 72 28.59 6.50 × 10−05 
MPHOSPH 13 20245974-20247598 14 14 14 1.54 × 10−02 69 27.28 6.49 × 10−05 
GOLM1 − 88641060-88642808 11 11 1.66 × 10−02 54 28.28 7.03 × 10−05 
VPS13B 100887646-100889807 35 56 56 1.66 × 10−02 27 29.68 7.06 × 10−05 
NLRX1 11 119050402-119050997 10 1.68 × 10−02 10 0.05 7.17 × 10−05 
C18orf8 18 21110351-21110576 16 20 19 1.74 × 10−02 32 27.64 7.45 × 10−05 
ZBTB20 − 114056947-114058273 12 12 1.74 × 10−02 41 27.40 7.51 × 10−05 
ZFYVE19 15 41099274-41100066 11 1.76 × 10−02 27 27.83 7.61 × 10−05 
RBM12 20 − 34236888-34243266 1.79 × 10−02 97 28.98 7.76 × 10−05 
RBM12 20 − 34252682-34252838 1.79 × 10−02 34 32 −0.02 7.76 × 10−05 
MEPCE 100031125-100031740 1.83 × 10−02 52 27.62 8.03 × 10−05 
ELMOD3 85617261-85618873 11 17 16 1.85 × 10−02 48 30.27 8.15 × 10−05 
NPLOC4 17 − 79523915-79526442 15 15 1.88 × 10−02 202 32.35 8.38 × 10−05 
NPLOC4 17 − 79555970-79556130 15 10 1.88 × 10−02 0.30 8.38 × 10−05 
GTF3C4 135564268-135565468 1.89 × 10−02 13 28.70 8.45 × 10−05 
GTF3C4 135553364-135555190 1.89 × 10−02 10 −26.38 8.45 × 10−05 
IGHMBP2 11 68707002-68708069 15 15 15 1.94 × 10−02 35 28.12 8.71 × 10−05 
TRIM37 17 − 57075562-57076820 14 26 25 2.28 × 10−02 36 29.83 1.04 × 10−04 
ENG − 130577292-130578332 14 16 15 2.38 × 10−02 30 30.61 1.09 × 10−04 
C14orf45 14 74516405-74516898 12 2.44 × 10−02 30 27.12 1.13 × 10−04 
CCDC91 12 28701996-28703098 11 12 12 2.54 × 10−02 30 28.77 1.18 × 10−04 
ZSCAN21 99661411-99662661 2.92 × 10−02 41 28.95 1.38 × 10−04 
ZSCAN21 99654534-99655028 2.92 × 10−02 0.10 1.38 × 10−04 
RRN3P2 16 29127448-29128036 14 14 3.14 × 10−02 31 28.51 1.52 × 10−04 
DIP2A 21 47987283-47989926 40 40 3.14 × 10−02 116 33.06 1.52 × 10−04 
ZNF611 19 − 53206067-53210117 3.25 × 10−02 140 28.67 1.58 × 10−04 
RASGRP3 33787796-33789797 15 20 20 3.31 × 10−02 36 30.57 1.61 × 10−04 
CHD7 61777575-61779463 32 32 3.37 × 10−02 26 32.90 1.65 × 10−04 
FLCN 17 − 17124486-17124942 15 15 3.59 × 10−02 45 30.05 1.77 × 10−04 
C10orf119 10 − 121588972-121591112 11 11 3.78 × 10−02 35 26.46 1.87 × 10−04 
FIGNL1 − 50511834-50514995 3.80 × 10−02 42 29.09 1.88 × 10−04 
NOL9 − 6581409-6586063 10 10 4.14 × 10−02 169 28.77 2.06 × 10−04 
GLUL − 182360310-182360539 4.40 × 10−02 79 121 1.52 2.20 × 10−04 
TRAF5 211545470-211548284 11 11 4.40 × 10−02 68 30.21 2.21 × 10−04 
DHRS7B 17 21094261-21094835 4.51 × 10−02 35 26.40 2.27 × 10−04 
NLRC3 16 − 3589038-3591915 19 19 4.51 × 10−02 106 31.12 2.28 × 10−04 
NLRC3 16 − 3613010-3614759 19 4.51 × 10−02 31 0.34 2.28 × 10−04 
ABCD1 152990323-152991621 10 4.53 × 10−02 19 27.49 2.30 × 10−04 
GRIPAP1 − 48847338-48847514 23 27 4.56 × 10−02 24 25.88 2.32 × 10−04 
CHAC2 54001279-54002287 4.63 × 10−02 46 27.32 2.37 × 10−04 
SLC33A1 − 155571012-155572167 4.78 × 10−02 48 26.51 2.45 × 10−04 
ASXL1 20 31022235-31027121 13 13 4.88 × 10−02 141 32.33 2.51 × 10−04 
CASC3 17 38296507-38297032 13 14 4.94 × 10−02 28 26.09 2.55 × 10−04 
SEC22A 122990369-122992980 4.98 × 10−02 23 27.20 2.58 × 10−04 
RPL21P28 13 27830573-27830698 0.00 1736 2.38 0.00 
RPL21P28 13 27825693-27825722 0.00 231 202 −5.86 0.00 
HNRNPA1L 13 53201573-53201713 0.00 1.00 0.00 
HNRNPA1L 13 53196124-53196339 0.00 0.10 0.00 
HNRNPA1L 13 53191605-53191817 0.00 10 −1.17 0.00 
HNRNPA1L 13 53216541-53217919 0.00 1743 −34.56 0.00 
TXLNA 32653555-32653725 11 0.00 15 0.76 0.00 
TXLNA 32658258-32658332 11 0.00 0.63 0.00 
TXLNA 32657912-32658031 11 0.00 0.62 0.00 
TXLNA 32655656-32655850 11 0.00 18 0.35 0.00 
TXLNA 32646843-32647178 11 0.00 −0.64 0.00 
TXLNA 32660503-32663885 11 11 0.00 345 −33.27 0.00 
MIER1 67452086-67454302 20 21 21 0.00 447 −31.97 0.00 
MIER1 67450255-67450335 20 21 19 2.43 × 10−10 21 24 0.59 1.73 × 10−13 
MIER1 67450255-67450275 20 21 18 5.31 × 10−08 12 15 0.51 5.08 × 10−11 
MIER1 67447462-67447601 20 21 17 1.44 × 10−05 25 36 0.34 2.30 × 10−08 
MIER1 67411833-67411978 20 21 1.82 × 10−02 29 43 0.23 7.98 × 10−05 
CSF3R − 36931644-36932509 20 20 18 0.00 1003 −32.06 0.00 
CSF3R − 36932831-36932912 20 20 16 1.63 × 10−12 44 206 0.35 7.77 × 10−16 
CSF3R − 36931644-36932428 20 20 19 5.15 × 10−11 174 999 0.05 3.01 × 10−14 
CSF3R − 36933423-36933563 20 20 14 4.53 × 10−06 61 318 0.20 6.50 × 10−09 
CSF3R − 36933159-36933252 20 20 15 5.23 × 10−04 48 244 0.22 1.30 × 10−06 
SLC25A36 140695105-140698785 0.00 241 −30.23 0.00 
SLC25A36 140695102-140698785 4.68 × 10−04 155 242 0.16 1.14 × 10−06 
CDV3 133306003-133309116 0.00 372 283 0.15 0.00 
CDV3 133306740-133309116 0.00 275 −33.17 0.00 
NUFIP2 17 − 27582855-27591609 0.00 196 −30.52 0.00 
NUFIP2 17 − 27613010-27614734 2.14 × 10−09 68 94 0.11 1.73 × 10−12 
H3F3A 226252030-226252180 0.00 822 2293 0.09 0.00 
H3F3A 226250421-226250512 0.00 255 835 −0.15 0.00 
H3F3A 226259052-226259702 0.00 4290 −33.08 0.00 
POU5F1 − 31133704-31134615 0.00 299 −30.99 0.00 
POU5F1 − 31134311-31134615 3.44 × 10−06 335 273 0.09 4.80 × 10−09 
QKI 163984452-163999627 0.00 273 −31.04 0.00 
QKI 163991726-163999627 7.22 × 10−10 171 212 0.06 5.58 × 10−13 
SUMO1 − 203070803-203071526 0.00 328 −30.28 0.00 
SUMO1 − 203070903-203072044 4.59 × 10−02 506 811 0.01 2.34 × 10−04 
C1orf9 172578956-172580971 22 25 25 0.00 200 −29.70 0.00 
LGALS3 14 55612030-55612147 0.00 139 −30.94 0.00 
NCOA1 24991093-24993568 14 23 23 0.00 97 −33.15 0.00 
WDR45 − 48957143-48957492 13 14 1.63 × 10−12 57 −32.27 7.77 × 10−16 
CREM 10 35500584-35501885 15 15 2.43 × 10−12 177 −31.41 1.22 × 10−15 
RAD17 68665124-68665291 20 21 4.15 × 10−11 78 −30.64 2.34 × 10−14 
ATXN7 63985126-63989134 12 12 5.93 × 10−11 77 −31.51 3.56 × 10−14 
GON4L − 155734577-155736500 23 33 22 9.48 × 10−11 84 −32.55 5.93 × 10−14 
PIP4K2C 12 57995709-57997210 13 14 14 1.29 × 10−10 61 −31.00 8.36 × 10−14 
ATP13A3 − 194123405-194126845 18 30 30 2.25 × 10−10 313 −30.91 1.54 × 10−13 
ZNF641 12 − 48733795-48737510 1.70 × 10−09 49 −32.63 1.34 × 10−12 
ZNF641 12 − 48741690-48741898 2.78 × 10−02 14 27.56 1.30 × 10−04 
AMPD3 11 10527255-10529126 15 16 16 1.51 × 10−08 80 −32.15 1.33 × 10−11 
TCEAL4 102841582-102842653 3.54 × 10−08 107 −29.05 3.34 × 10−11 
PRDM2 14104913-14109326 6.57 × 10−08 195 137 0.12 6.52 × 10−11 
PRDM2 14113010-14114573 6.57 × 10−08 59 −31.18 6.52 × 10−11 
LRCH4 − 100171636-10017292 18 18 18 1.36 × 10−07 60 −29.52 1.37 × 10−10 
MAP4 − 47892180-47894529 17 20 19 1.66 × 10−07 53 −30.48 1.75 × 10−10 
MAP4 − 47892180-47894428 17 20 20 1.92 × 10−06 82 29.48 2.55 × 10−09 
MXD3 − 176732501-176734196 4.26 × 10−07 82 −28.74 4.85 × 10−10 
SLC4A1 17 − 42325759-42327906 20 20 20 8.44 × 10−07 3390 1884 −0.83 1.01 × 10−09 
LIPA 10 − 91011464-91011660 12 12 8.84 × 10−07 78 −28.02 1.09 × 10−09 
STRADA 17 − 61780194-61781111 13 15 15 8.84 × 10−07 58 −28.26 1.09 × 10−09 
LSM5 − 32529637-32530475 1.03 × 10−06 72 −29.98 1.31 × 10−09 
ERI2 16 − 20807662-20810389 11 1.96 × 10−06 75 −32.21 2.62 × 10−09 
SC5DL 11 121177766-121184117 7.40 × 10−06 133 −28.25 1.11 × 10−08 
PKN2 89298928-89301937 18 22 22 1.03 × 10−05 55 −29.92 1.60 × 10−08 
CEACAM1 19 − 43011459-43013380 1.59 × 10−05 146 −28.49 2.59 × 10−08 
NF2 22 30090741-30094583 18 18 1.88 × 10−05 162 −33.73 3.16 × 10−08 
NF2 22 30070825-30070930 18 12 3.50 × 10−02 2.02 1.72 × 10−04 
PRKCB 16 24231282-24231930 15 18 18 2.10 × 10−05 39 −34.39 3.60 × 10−08 
CBL 11 119170205-119178858 16 16 2.75 × 10−05 84 −30.64 4.86 × 10−08 
TGFBR2 30732912-30735631 3.34 × 10−05 72 −30.44 6.02 × 10−08 
TGFBR2 30713130-30713929 4.94 × 10−02 14 10 0.21 2.55 × 10−04 
AKAP2 112898407-112900819 3.34 × 10−05 44 80 −0.05 6.06 × 10−08 
AKAP2 112930679-112934789 3.34 × 10−05 71 −28.15 6.06 × 10−08 
UHRF1BP1 34840090-34845289 21 21 4.90 × 10−05 49 −31.33 9.13 × 10−08 
SMCR7 17 18167098-18169093 1.03 × 10−04 23 −29.44 2.02 × 10−07 
SMCR7 17 18167024-18169093 7.14 × 10−03 22 27.99 2.62 × 10−05 
NDUFV1 11 67374323-67374520 11 11 1.60 × 10−04 −28.18 3.19 × 10−07 
BCOR − 39931602-39934433 10 15 1.76 × 10−04 43 −29.87 3.54 × 10−07 
FGD4 12 32793210-32798982 17 17 1.90 × 10−04 90 −31.24 3.85 × 10−07 
SRCAP 16 30748370-30751449 29 29 2.13 × 10−04 36 29.81 4.36 × 10−07 
SRCAP 16 30734905-30736403 29 21 2.13 × 10−04 22 −30.64 4.36 × 10−07 
OAS1 12 113357194-113357711 2.42 × 10−04 29 −29.09 5.02 × 10−07 
ETS2 21 40194598-40196876 2.52 × 10−04 171 −30.13 5.35 × 10−07 
C7orf28A 5965263-5965601 2.98 × 10−04 46 −30.72 6.59 × 10−07 
PIGN 18 − 59711460-59713212 23 31 31 3.07 × 10−04 54 −29.06 6.89 × 10−07 
SELP − 169558090-169558699 15 17 17 3.28 × 10−04 35 −29.54 7.39 × 10−07 
XRCC4 82648950-82649577 10 10 3.38 × 10−04 40 −28.80 7.76 × 10−07 
SIGLEC14 19 − 52149510-52149893 3.40 × 10−04 84 −28.80 7.87 × 10−07 
CDK12 17 37686884-37690799 15 15 3.75 × 10−04 38 −31.39 8.82 × 10−07 
ATF3 212792388-212794114 4.11 × 10−04 73 −27.83 9.78 × 10−07 
MYH11 16 − 15818745-15818849 16 13 4.53 × 10−04 21 −29.20 1.09 × 10−06 
ABR 17 − 906760-909409 22 18 4.96 × 10−04 36 −30.39 1.22 × 10−06 
OLFM4 13 53624104-53626186 5.23 × 10−04 405 −29.11 1.30 × 10−06 
HIVEP1 12120123-12126103 6.98 × 10−04 13 27.93 1.83 × 10−06 
HIVEP1 12163516-12165231 6.98 × 10−04 26 −29.98 1.83 × 10−06 
MIDN 19 1256994-1259139 6.98 × 10−04 239 −31.82 1.82 × 10−06 
CEP63 134204575-134204894 15 19 9.33 × 10−04 38 −29.07 2.51 × 10−06 
RREB1 7248744-7252212 14 14 9.34 × 10−04 69 −31.98 2.52 × 10−06 
NCOA6 20 − 33328167-33331145 10 9.41 × 10−04 27 −30.79 2.55 × 10−06 
NISCH 52525888-52527087 18 21 21 1.02 × 10−03 34 −28.34 2.79 × 10−06 
RNF111 15 59323003-59323901 11 13 1.08 × 10−03 29 −28.45 3.00 × 10−06 
YLPM1 14 75264283-75266400 15 21 1.11 × 10−03 33 −28.11 3.13 × 10−06 
PML 15 74327513-74328734 10 13 10 1.12 × 10−03 39 −30.59 3.18 × 10−06 
SLC41A1 − 205758221-205760846 11 11 1.33 × 10−03 37 −30.47 3.85 × 10−06 
RNF19B − 33402052-33402910 10 11 10 1.40 × 10−03 43 −27.66 4.13 × 10−06 
SLC17A9 20 61598689-61599941 13 13 1.42 × 10−03 53 −29.47 4.21 × 10−06 
RIN3 14 93154271-93155332 1.59 × 10−03 21 37 −0.01 4.88 × 10−06 
RIN3 14 93117927-93119420 3.01 × 10−02 62 −29.47 1.45 × 10−04 
RTN4 − 5525222-55254621 10 1.90 × 10−03 29 −29.39 5.89 × 10−06 
DHX34 19 47856011-47856992 16 17 2.05 × 10−03 42 −29.13 6.37 × 10−06 
TMEM68 − 56651320-56652777 2.24 × 10−03 36 −29.39 7.05 × 10−06 
SSH2 17 − 2795296-27959949 11 11 2.54 × 10−03 101 −29.84 8.10 × 10−06 
FCGR2C 161569420-161570031 3.18 × 10−03 33 39 −0.01 1.04 × 10−05 
SLCO4C1 − 101569694-101572722 13 13 3.48 × 10−03 66 −29.04 1.15 × 10−05 
IL21R 16 27459855-27462115 10 10 3.63 × 10−03 27 −29.51 1.22 × 10−05 
MED6 14 − 71050958-71051660 3.80 × 10−03 39 −27.26 1.28 × 10−05 
STEAP4 − 87905750-87908943 4.35 × 10−03 93 −28.18 1.50 × 10−05 
PRNP 20 4667157-4667382 4.40 × 10−03 40 −27.50 1.53 × 10−05 
PAPD7 6754867-6757161 5.59 × 10−03 20 27.14 1.99 × 10−05 
PAPD7 6754764-6757161 5.59 × 10−03 17 −28.94 1.99 × 10−05 
KIF24 − 34255733-34257979 12 10 5.60 × 10−03 14 −29.00 2.00 × 10−05 
TMCC3 12 − 94960900-94965513 6.85−03 293 −27.77 2.51 × 10−05 
TMCC3 12 − 94975398-94976314 2.26 × 10−02 100 0.08 1.03 × 10−04 
C10orf18 10 5804992-5806943 15 15 7.20 × 10−03 32 −30.92 2.66 × 10−05 
SMYD5 73452924-73454355 13 13 7.73 × 10−03 24 −29.40 2.87 × 10−05 
EP400 12 132561946-132565004 27 27 8.76 × 10−03 54 17 0.15 3.34 × 10−05 
EP400 12 132445130-132446499 27 8.76 × 10−03 18 −32.52 3.34 × 10−05 
FRY 13 32869339-32870775 57 57 9.80 × 10−03 40 −31.47 3.78 × 10−05 
NPIPL3 16 − 21426278-21426406 9.91 × 10−03 0.19 3.84 × 10−05 
NPIPL3 16 − 21436621-21436658 2.92 × 10−02 −0.42 1.38 × 10−04 
IL1R1 102792813-102796333 10 10 1.06 × 10−02 107 −29.14 4.12 × 10−05 
SLC35E3 12 69158484-69159851 1.09 × 10−02 33 −26.93 4.27 × 10−05 
ELF2 − 140058784-140059021 10 11 1.09 × 10−02 22 −28.48 4.28 × 10−05 
LUZP1 − -23410516-23415546 1.19 × 10−02 36 −26.87 4.70 × 10−05 
MLH3 14 − 75513079-75516421 12 1.41 × 10−02 19 −31.99 5.81 × 10−05 
VCAM1 101203679-101204599 1.50 × 10−02 51 −26.73 6.20 × 10−05 
ADPRH 119306311-119308791 1.67 × 10−02 53 −26.88 7.13 × 10−05 
ALCAM 105085713-105086325 15 16 1.81 × 10−02 34 −27.99 7.88 × 10−05 
CHKB 22 − 51019849-51019982 1.81 × 10−02 20 −28.43 7.89 × 10−05 
PPIP5K1 15 − 43825660-43827674 20 36 36 1.84 × 10−02 24 −27.56 8.10 × 10−05 
CLEC5A − 141627157-141630018 1.87 × 10−02 252 −28.64 8.27 × 10−05 
MICAL3 22 − 18342922-18347752 28 21 1.95 × 10−02 35 25 −0.06 8.81 × 10−05 
LRP12 − 105501459-105503767 2.08 × 10−02 26 −28.17 9.40 × 10−05 
SRGAP2 206634382-206637782 15 21 21 2.13 × 10−02 21 −28.97 9.64 × 10−05 
GGCX − 85776193-85777249 12 15 15 2.32 × 10−02 25 −27.44 1.06 × 10−04 
SLC8A1 − 40339287-40342769 2.49 × 10−02 26 29 −0.34 1.16 × 10−04 
SLC8A1 − 40655613-40657444 2.49 × 10−02 41 −28.24 1.16 × 10−04 
DHRS4 14 24437966-24438486 2.70 × 10−02 22 −26.85 1.26 × 10−04 
VPS13A 80030872-80032397 22 72 72 2.74 × 10−02 14 −31.43 1.28 × 10−04 
HLA-DPB1 33054316-33054976 2.81 × 10−02 151 368 −0.91 1.33 × 10−04 
SKA2 17 − 57232317-57232800 2.81 × 10−02 26 −27.22 1.32 × 10−04 
METTL4 18 − 2537525-2539144 2.95 × 10−02 19 −27.47 1.41 × 10−04 
CRAMP1L 16 1705878-1706993 13 2.96 × 10−02 28.86 1.42 × 10−04 
CRAMP1L 16 1723882-1727907 13 13 2.96 × 10−02 25 −31.99 1.42 × 10−04 
IKBKG 153792534-153793260 10 11 11 3.01 × 10−02 20 −29.87 1.45 × 10−04 
LEPR 65886248-65886423 20 22 3.34 × 10−02 16 −28.60 1.63 × 10−04 
XPNPEP3 22 41322273-41323878 10 10 3.50 × 10−02 24 −28.94 1.72 × 10−04 
CTSH 15 − 79237293-79237420 13 14 4.08 × 10−02 25 −27.42 2.03 × 10−04 
BEST1 11 61731576-61731939 4.40 × 10−02 75 −27.40 2.21 × 10−04 
C11orf48 11 − 62439036-62439241 4.58 × 10−02 16 −28.26 2.34 × 10−04 

Differential exons comparison was done testing 81 564 exons from 9069 genes. The table illustrates the complete list of 423 exons from 350 genes found to be differentially used at the 0.05 False Discovery Rate (FDR) level (ie, adjusted P value less than .05) in the SF3B1 mutant relative to normal groups.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal