Table 1

Characterization of T-ALL individuals with PTPN2 inactivation

IndividualSexAge, yPTPN2 deletion*PTPN2 mutationDeregulated transcription factorNUP214-ABL1JAK1 status
1§ 30 PTPN2−/− NA TLX1 − wt 
2§ 24 PTPN2−/− NA TLX1 wt 
3§ 27 PTPN2−/− NA TLX1 − wt 
4§ 21 PTPN2−/− NA TLX1 − wt 
5§ 45 PTPN2−/− NA TLX1 wt 
6§ PTPN2−/− NA TLX3 − c.1944A > C p.K648N 
7§ 43 PTPN2−/− NA TLX1 − wt 
8§ 20 PTPN2−/− NA TLX1 − wt 
9§ PTPN2+/− wt TLX1 wt 
10§ 11 PTPN2+/− wt TLX1 − wt 
11§ 35 PTPN2+/− wt TLX1 − wt 
12§ PTPN2+/− wt TLX1 wt 
13§ 49 PTPN2+/− c.862C > T, p.R288Stop TLX1 − c.1953T > C p.Y652H 
14 34 PTPN2−/− NA TLX1 − wt 
15 42 PTPN2+/− wt TLX1 − wt 
16 38 PTPN2+/− wt TLX1 wt 
17 53 PTPN2−/− NA TLX1 − wt 
18 28 PTPN2−/− NA TLX1 wt 
IndividualSexAge, yPTPN2 deletion*PTPN2 mutationDeregulated transcription factorNUP214-ABL1JAK1 status
1§ 30 PTPN2−/− NA TLX1 − wt 
2§ 24 PTPN2−/− NA TLX1 wt 
3§ 27 PTPN2−/− NA TLX1 − wt 
4§ 21 PTPN2−/− NA TLX1 − wt 
5§ 45 PTPN2−/− NA TLX1 wt 
6§ PTPN2−/− NA TLX3 − c.1944A > C p.K648N 
7§ 43 PTPN2−/− NA TLX1 − wt 
8§ 20 PTPN2−/− NA TLX1 − wt 
9§ PTPN2+/− wt TLX1 wt 
10§ 11 PTPN2+/− wt TLX1 − wt 
11§ 35 PTPN2+/− wt TLX1 − wt 
12§ PTPN2+/− wt TLX1 wt 
13§ 49 PTPN2+/− c.862C > T, p.R288Stop TLX1 − c.1953T > C p.Y652H 
14 34 PTPN2−/− NA TLX1 − wt 
15 42 PTPN2+/− wt TLX1 − wt 
16 38 PTPN2+/− wt TLX1 wt 
17 53 PTPN2−/− NA TLX1 − wt 
18 28 PTPN2−/− NA TLX1 wt 
*

Determined by FISH, quantitative PCR, or aCGH; −/− indicates a biallelic deletion; and +/−, a monoallelic deletion.

Positivity for TLX1 or TLX3 expression.

Positivity for NUP214-ABL1 expression or rearrangement; + indicates positive for NUP214-ABL1; and −, negative for NUP214-ABL1.

§

Patient results have been published previously and are consecutively numbered.15 

NA indicates not applicable; and wt, wild-type.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal