Table 1

Genetic characteristics of 29 ALK-negative ALCLs with 6p25.3 rearrangements

Case no.Age, yearsSexDisease distributionBreakpoint on 6p25.3*7q32.3 BAP FISHt(6;7) D-FISHNo. of fusion signals
1† 46 Male Systemic DUSP22 Break Fusion 2 
2 65 Male Systemic DUSP22 Break Fusion 2 
3 79 Male Systemic DUSP22 Break Fusion 1 or 2 
4 89 Female Cutaneous DUSP22 Break Fusion 1 or 2 
5 50 Male Systemic DUSP22 Break Fusion 1 or 2 
6 68 Male Cutaneous DUSP22 Break Fusion 1 
7 66 Female Cutaneous DUSP22 Break Fusion 1 
8 65 Male Systemic DUSP22 Break Fusion 1 
9 50 Male Cutaneous DUSP22 Break Fusion 1 
10 51 Male Systemic IRF4 Break Fusion 1 
11 65 Male Cutaneous Indeterminate Break Fusion 1 
12 77 Male Cutaneous IRF4 Break Tissue depleted — 
13 65 Male Systemic Indeterminate Break Tissue depleted — 
14 76 Male Cutaneous DUSP22 Aneuploid — — 
15 66 Male Cutaneous DUSP22 Aneuploid — — 
16 59 Female Cutaneous IRF4 Aneuploid — — 
17 52 Male Cutaneous IRF4 Aneuploid — — 
18 57 Male Cutaneous Indeterminate Aneuploid — — 
19 65 Female Cutaneous Tissue depleted Aneuploid — — 
20 71 Female Cutaneous DUSP22 Normal — — 
21 50 Male Systemic DUSP22 Normal — — 
22 54 Male Systemic DUSP22 Normal — — 
23 33 Female Systemic DUSP22 Normal — — 
24 62 Male Systemic IRF4 Normal — — 
25 35 Male Cutaneous IRF4 Normal — — 
26 54 Male Systemic IRF4 Normal — — 
27 56 Female Cutaneous IRF4 Normal — — 
28 45 Male Cutaneous Indeterminate Normal — — 
29 86 Male Cutaneous Indeterminate Normal — — 
Case no.Age, yearsSexDisease distributionBreakpoint on 6p25.3*7q32.3 BAP FISHt(6;7) D-FISHNo. of fusion signals
1† 46 Male Systemic DUSP22 Break Fusion 2 
2 65 Male Systemic DUSP22 Break Fusion 2 
3 79 Male Systemic DUSP22 Break Fusion 1 or 2 
4 89 Female Cutaneous DUSP22 Break Fusion 1 or 2 
5 50 Male Systemic DUSP22 Break Fusion 1 or 2 
6 68 Male Cutaneous DUSP22 Break Fusion 1 
7 66 Female Cutaneous DUSP22 Break Fusion 1 
8 65 Male Systemic DUSP22 Break Fusion 1 
9 50 Male Cutaneous DUSP22 Break Fusion 1 
10 51 Male Systemic IRF4 Break Fusion 1 
11 65 Male Cutaneous Indeterminate Break Fusion 1 
12 77 Male Cutaneous IRF4 Break Tissue depleted — 
13 65 Male Systemic Indeterminate Break Tissue depleted — 
14 76 Male Cutaneous DUSP22 Aneuploid — — 
15 66 Male Cutaneous DUSP22 Aneuploid — — 
16 59 Female Cutaneous IRF4 Aneuploid — — 
17 52 Male Cutaneous IRF4 Aneuploid — — 
18 57 Male Cutaneous Indeterminate Aneuploid — — 
19 65 Female Cutaneous Tissue depleted Aneuploid — — 
20 71 Female Cutaneous DUSP22 Normal — — 
21 50 Male Systemic DUSP22 Normal — — 
22 54 Male Systemic DUSP22 Normal — — 
23 33 Female Systemic DUSP22 Normal — — 
24 62 Male Systemic IRF4 Normal — — 
25 35 Male Cutaneous IRF4 Normal — — 
26 54 Male Systemic IRF4 Normal — — 
27 56 Female Cutaneous IRF4 Normal — — 
28 45 Male Cutaneous Indeterminate Normal — — 
29 86 Male Cutaneous Indeterminate Normal — — 

These 29 cases with 6p25.3 rearrangements were identified out of a total of 125 ALK-negative ALCLs (23%), including 66 systemic cases and 59 cutaneous cases (supplemental Table 2; and unpublished data).6,8  The estimated frequency of t(6;7) (p25.3;q32.3) is 10% (13 of 125 ALK-negative ALCLs). The frequency of 6p25.3 rearrangements identified in systemic cases (12 of 66; 18%) is higher than that identified in a previous, smaller series.6 

BAP FISH indicates breakapart FISH; D-FISH, dual-fusion FISH; and —, not applicable.

*

Determined using DUSP22 and IRF4 FISH probes shown in supplemental Figure 1. DUSP22 breaks were seen in 15 cases (12% of the 125 ALK-negative ALCLs tested).

†

Index case (sequenced).

View Large
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal