Table 1.

Cellular Genotype Defines Major Forms of Childhood Leukemia: Leukemias Often Result from the Fusion of Genes Critical for Signal Transduction or Transcription

Molecular Genetic AbnormalityTranslocationBiochemical DefectAssociated FeaturesReference
Chronic myelogenous leukemia 
BCR-ABL fusion (p210) t(9; 22)(q34; q11) Signal transduction Myeloproliferation 36 
B-cell lineage leukemia 
TEL-AML1 fusion t(12; 21) cryptic Transcription Good prognosis 50 
BCR-ABL fusion (p185) t(9; 22)(q34; q11) Signal transduction Poor prognosis 37 
E2A-PBX fusion t(1; 19)(q23; p13) Transcription Pre-B phenotype, poor response to antimetabolites 66 
MLL-AFX1 fusion t(x; 11)(q13; q23) Transcription  67 
MLL-AF4 fusion t(4; 11)(q21; q23) Transcription Mixed lineage, infants, poor prognosis 39, 40, 45 
MLL-ENL fusion t(11; 19)(q23; p13) Transcription Hyperleukocytosis 38 
IGH-MYC fusion t(8; 14)(q24; q32) Transcription FAB L3, extramedullary disease 68 
IGκ-MYC fusion t(2; 8)(p12; q24) Transcription FAB L3, extramedullary disease 68 
IGλ-MYC fusion t(8; 22)(q24; q11) Transcription FAB L3, extramedullary disease 68 
Hyperdiploidy None Unknown Good prognosis 49 
T-cell lineage leukemia 
TAL1 deletion None Transcription Extramedullary disease, CD2+, CD10− 69 
TCRδ-TAL1 fusion t(1; 14)(p32; q11) Transcription Extramedullary disease, CD2+, CD10− 69 
TCRβ-TAL1 fusion t(1; 7)(p32; q35) Transcription Extramedullary disease, CD2+, CD10− 69 
TCRα-MYC fusion t(8; 14)(q24; q11) Transcription Extramedullary disease 70 
TCRδ-RBTN1 fusion t(11; 14)(p15; q11) Transcription Extramedullary disease 71 
TCRδ-RBTN2 fusion t(11; 14)(p13; q11) Transcription Extramedullary disease 71 
TCRδ-HOX11 fusion t(10; 14)(q24; q11) Transcription Extramedullary disease 72 
TCRβ-LCK fusion t(1; 7)(p34; q34) Signal transduction Extramedullary disease 73 
Acute myelogenous leukemia 
AML 1-ETO fusion t(8; 21)(q22; q22) Transcription FAB M2 41 
CBFβ-MYH11 fusion inv(16)(p13; q22) Transcription FAB M4EO 74 
DEK-CAN fusion t(6; 9)(p23; q34) Transcription Basophilia 75 
MLL-AF1p fusion t(1; 11)(p32; q23) Transcription  76 
MLL-AF1q fusion t(1; 11)(q21; q23) Transcription FAB M4-M5, infants 77 
MLL-AF6 fusion t(6; 11)(q27; q23) Transcription  78 
MLL-AF9 fusion t(9; 11)(p22; q23) Transcription FAB M4, M5, infants 79 
MLL-AF10 fusion t(10; 11)(p12; q23) Transcription FAB M5 80 
MLL-AF17 fusion t(11; 17)(q23; q21) Transcription  81 
MLL-CBP fusion t(11; 16)(q23; p13) Transcription FAB M4, M5, infants 82 
MLL-EEN fusion t(11; 19)(q23; p13) Transcription Infants 83 
MLL-ENL fusion, MLL-ELL fusion t(11; 19)(q23; p13) Transcription Myelodysplastic syndrome 38, 84 
MLL-MLL fusion None Transcription FAB M4, M5 85 
MOZ-CBP fusion t(8; 16)(p11; p13) Chromatin acetylation/Transcription FAB M4, M5 86 
NUP98-HOXA9 fusion t(7; 11)(p15; p15) ? Activate HOXA9 FAB M2, M4 87 
NPM-MLF 1 fusion t(3; 5)(q25; q34) Abnormal traffic Myelodysplastic syndrome 88 
PML-RARα fusion t(15; 17)(q22; q21) Retinoic acid response FAB M3, coagulopathy 42 
Molecular Genetic AbnormalityTranslocationBiochemical DefectAssociated FeaturesReference
Chronic myelogenous leukemia 
BCR-ABL fusion (p210) t(9; 22)(q34; q11) Signal transduction Myeloproliferation 36 
B-cell lineage leukemia 
TEL-AML1 fusion t(12; 21) cryptic Transcription Good prognosis 50 
BCR-ABL fusion (p185) t(9; 22)(q34; q11) Signal transduction Poor prognosis 37 
E2A-PBX fusion t(1; 19)(q23; p13) Transcription Pre-B phenotype, poor response to antimetabolites 66 
MLL-AFX1 fusion t(x; 11)(q13; q23) Transcription  67 
MLL-AF4 fusion t(4; 11)(q21; q23) Transcription Mixed lineage, infants, poor prognosis 39, 40, 45 
MLL-ENL fusion t(11; 19)(q23; p13) Transcription Hyperleukocytosis 38 
IGH-MYC fusion t(8; 14)(q24; q32) Transcription FAB L3, extramedullary disease 68 
IGκ-MYC fusion t(2; 8)(p12; q24) Transcription FAB L3, extramedullary disease 68 
IGλ-MYC fusion t(8; 22)(q24; q11) Transcription FAB L3, extramedullary disease 68 
Hyperdiploidy None Unknown Good prognosis 49 
T-cell lineage leukemia 
TAL1 deletion None Transcription Extramedullary disease, CD2+, CD10− 69 
TCRδ-TAL1 fusion t(1; 14)(p32; q11) Transcription Extramedullary disease, CD2+, CD10− 69 
TCRβ-TAL1 fusion t(1; 7)(p32; q35) Transcription Extramedullary disease, CD2+, CD10− 69 
TCRα-MYC fusion t(8; 14)(q24; q11) Transcription Extramedullary disease 70 
TCRδ-RBTN1 fusion t(11; 14)(p15; q11) Transcription Extramedullary disease 71 
TCRδ-RBTN2 fusion t(11; 14)(p13; q11) Transcription Extramedullary disease 71 
TCRδ-HOX11 fusion t(10; 14)(q24; q11) Transcription Extramedullary disease 72 
TCRβ-LCK fusion t(1; 7)(p34; q34) Signal transduction Extramedullary disease 73 
Acute myelogenous leukemia 
AML 1-ETO fusion t(8; 21)(q22; q22) Transcription FAB M2 41 
CBFβ-MYH11 fusion inv(16)(p13; q22) Transcription FAB M4EO 74 
DEK-CAN fusion t(6; 9)(p23; q34) Transcription Basophilia 75 
MLL-AF1p fusion t(1; 11)(p32; q23) Transcription  76 
MLL-AF1q fusion t(1; 11)(q21; q23) Transcription FAB M4-M5, infants 77 
MLL-AF6 fusion t(6; 11)(q27; q23) Transcription  78 
MLL-AF9 fusion t(9; 11)(p22; q23) Transcription FAB M4, M5, infants 79 
MLL-AF10 fusion t(10; 11)(p12; q23) Transcription FAB M5 80 
MLL-AF17 fusion t(11; 17)(q23; q21) Transcription  81 
MLL-CBP fusion t(11; 16)(q23; p13) Transcription FAB M4, M5, infants 82 
MLL-EEN fusion t(11; 19)(q23; p13) Transcription Infants 83 
MLL-ENL fusion, MLL-ELL fusion t(11; 19)(q23; p13) Transcription Myelodysplastic syndrome 38, 84 
MLL-MLL fusion None Transcription FAB M4, M5 85 
MOZ-CBP fusion t(8; 16)(p11; p13) Chromatin acetylation/Transcription FAB M4, M5 86 
NUP98-HOXA9 fusion t(7; 11)(p15; p15) ? Activate HOXA9 FAB M2, M4 87 
NPM-MLF 1 fusion t(3; 5)(q25; q34) Abnormal traffic Myelodysplastic syndrome 88 
PML-RARα fusion t(15; 17)(q22; q21) Retinoic acid response FAB M3, coagulopathy 42 

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