Table 1.

Oligonucleotide Primers Used for Amplifications of Genomic DNA or cDNA Fragments

LocationForward (5′ to 3′)Reverse (5′ to 3′)
Genomic DNA primers* 
Exon 8 8F: 8R: 
  CAGTTCAATTCTTGTCTTCTTGT  GCTCCAGGACAAAGGCCCT 
Exon 9 9F: 9R: 
  GGGCCCAACTGTGTCTAAAT  TTATGAGGGGGTGTGGGTT 
Exon 10 10F: 10R: 
  CAGCGGGTCCACCTTCCT  CCAGCCTCCCGGTCTCT 
Exon 11 11F: 11R: 
  TTGCCTTAATCACTGTGTCCT  CCTGGGTGTGTGCAACTCT 
Exon 12 12F: 12R: 
  TTCCTCCATTTTCCCTACTC  CCTGCCTAACATGGTTCTTC 
Exon 13 13F: 13R: 
  TTCATTCACAACGCCCTGCT  GACCACCCAAAGCATCTGC 
Intron 9 I9F: 
  ACTTGGGATCTGAAGTCACAG 
cDNA primers 
Exon 7 M7F: TTCTGTCCATGGATTCCAGC 
Exon 9 M9F: GTATGCCGTTGTGGGCCTGG 
Exon 13  M13R: TTGCTCTGGCGCGTTCTTCC 
Exon 14  M14R: GTGATATTGGTGAAGGTAGACGTG 
LocationForward (5′ to 3′)Reverse (5′ to 3′)
Genomic DNA primers* 
Exon 8 8F: 8R: 
  CAGTTCAATTCTTGTCTTCTTGT  GCTCCAGGACAAAGGCCCT 
Exon 9 9F: 9R: 
  GGGCCCAACTGTGTCTAAAT  TTATGAGGGGGTGTGGGTT 
Exon 10 10F: 10R: 
  CAGCGGGTCCACCTTCCT  CCAGCCTCCCGGTCTCT 
Exon 11 11F: 11R: 
  TTGCCTTAATCACTGTGTCCT  CCTGGGTGTGTGCAACTCT 
Exon 12 12F: 12R: 
  TTCCTCCATTTTCCCTACTC  CCTGCCTAACATGGTTCTTC 
Exon 13 13F: 13R: 
  TTCATTCACAACGCCCTGCT  GACCACCCAAAGCATCTGC 
Intron 9 I9F: 
  ACTTGGGATCTGAAGTCACAG 
cDNA primers 
Exon 7 M7F: TTCTGTCCATGGATTCCAGC 
Exon 9 M9F: GTATGCCGTTGTGGGCCTGG 
Exon 13  M13R: TTGCTCTGGCGCGTTCTTCC 
Exon 14  M14R: GTGATATTGGTGAAGGTAGACGTG 
*

Primers for exons are complementary to intronic sequences flanking each exon.

The primer used is about 100 bp upstream to an Alu repeat.

The primers are contained within exon sequences.

or Create an Account

Close Modal
Close Modal