Table 1

Sample characteristics of 56 primary AML samples

IDKaryotypeMolecular genetic aberrationsFABGPR56 RPKMGPR56+ % (FACS)
02H053 46,XY[20] NPM1, FLT3-ITD, IDH2 M1 0.94 NA 
03H041 46,XX[22] FLT3-ITD, NUP98-NSD1 fusion M5 0.86 1.69 
03H116 46,XX[21] NPM1, FLT3-ITD, IDH2 M1 7.69 3.73 
03H119 46,XY[20] RUNX1 M1 3.04 3.02 
04H024 46,XX[21] NPM1, IDH2, DNMT3A (other) M1 6.87 20.98 
04H112 46,XX[21] NPM1, FLT3-ITD, GATA2, DNMT3A (R882H) M1 161.28 91.03 
04H133 46,XX[20] NPM1, FLT3-ITD, DNMT3A (other) M1 143.72 84.95 
05H050 46,XY[20] FLT3-ITD, WT1, DNMT3A (R882H), MLL-PTD M4 2.36 3.11 
05H094 46,XY[23] NPM1, TET2 M5B 0.90 1.55 
05H149 46,XY[20] IDH2, RUNX1, DNMT3A (R882H) NC 12.23 20.02 
05H163 46,XY[22]  M1 6.35 20.17 
05H181 46,XX,inc[11] NPM1, FLT3-ITD M5B 1.36 NA 
06H028 46,XX[20] NPM1, TET2, GATA2 M1 1.34 1.62 
06H088 46,XY,t(6;11)(q27;q23)[20]  M1 5.82 4.43 
06H135 Complex karyotype TP53 M0 2.33 NA 
06H144 46,XX[20] NPM1, IDH2, DNMT3A (other) M1 1.39 NA 
07H099 46,XX,inv(16)(p13.1q22)[20]  NC 1.02 NA 
07H135 46,XY[20] NPM1, FLT3-ITD, IDH2, DNMT3A (other) M1 37.56 91.48 
08H012 47,XX,+11[21] FLT3-ITD, IDH2, DNMT3A (other), MLL-PTD M1 8.34 42.15 
08H021 46,XY,t(9;11)(p22;q23)[20]  M5A 0.54 0.46 
08H048 46,XY[21] WT1 M1 0.75 NA 
08H112 46,XY[20] IDH2, MLL-PTD NC 10.87 10.34 
09H031 46,XX[20] NPM1, FLT3-ITD M1 16.34 78.73 
09H043 46,XY[21] NPM1, FLT3-ITD, DNMT3A (L566*) M1 67.35 90.97 
09H046 45,XY,add(16)(p13.1),-17[20] TP53, TET2, RUNX1, DNMT3A (other) NC 11.81 14.97 
09H083 46,XX[20] NPM1, FLT3-ITD, IDH2, DNMT3A (R882H) M1 40.04 84.19 
09H113 46,XY[22] IDH2, DNMT3A (other), MLL-PTD M1 23.58 40.53 
09H115 46,XY[24] FLT3-ITD, IDH2, MLL-PTD M1 1.90 3.51 
10H031 46,XX[27] MLL-MLLT4 (by FISH and RNA-Seq) M5B 0.45 0.29 
10H038 46,XX[20] WT1 M0 5.52 31.86 
10H056 46,XX[18] IDH1, DNMT3A (other) M1 6.21 9.53 
10H072 46,XY[20] NPM1, TET2, DNMT3A (R882C) M5B 0.91 1.44 
10H089 46,XX[26] WT1 NC 1.32 NA 
10H092 46,XX[21] NPM1, FLT3-ITD, DNMT3A (R882C) M1 67.18 97.01 
10H101 46,XX[22] NPM1, FLT3-ITD, DNMT3A (R882H) M2 47.97 83.44 
10H109 45,XX,der(7)?t(7;18)(p12;q12),-18[17]/46,XX[3] NPM1, TET2 M1 1.72 NA 
10H113 Complex karyotype TP53, IDH2 M1 7.32 28.35 
10H115 46,XY[23] NPM1, FLT3-ITD, IDH2, WT1 M1 4.65 6.88 
10H127 46,XY,t(9;11)(p22;q23)[20]  M5A 0.15 0.15 
10H161 47,XX,+8[9]/46,XX[4] NPM1, TET2, DNMT3A (R882C) M5B 0.13 0.76 
10H166 46,XY[20] NPM1, FLT3-ITD, IDH2, DNMT3A (R882H) NC 41.00 69.93 
11H006 46,XX[23] NPM1, IDH1, DNMT3A (R882H) M5A 1.04 14.21 
11H008 48,XY,+13,+15[3]/46,XY[14] FLT3-ITD, MLL-PTD NC 6.37 5.59 
11H009 46,XY[20] FLT3-ITD, IDH1, DNMT3A (R882H) M2 24.86 61.9 
11H019 45,XX,add(10)(p13),-18[11]/46,XX[10] NPM1, TET2 M1 2.35 1.85 
11H021 46,XX[20] FLT3-ITD, MLL-PTD M2 7.44 NA 
11H046 92,XXYY[4]/46,XY[19] IDH1, RUNX1 M0 13.56 22.13 
11H058 46,XY[20] NPM1, FLT3-ITD, IDH1 M1 44.24 NA 
11H072 46,XX[20] NPM1, FLT3-ITD, DNMT3A (R882H) M2 73.17 95.2 
11H083 46,XY[20] NPM1, FLT3-ITD, DNMT3A (R882C) M5A 49.36 54.7 
11H095 46,XY[20]  M5A 0.23 0.13 
11H126 46,XY[21] NPM1, TET2 M5B 1.32 NA 
11H129 47,XY,+10[19]/46,XY[1] GATA2 M1 0.73 1.91 
11H142 46,XX[21] NPM1, FLT3-ITD, TET2 M1 27.70 59.62 
11H160 46,XX[22] FLT3-ITD M4 3.56 3.07 
11H170 Complex karyotype RUNX1 M0 44.80 50.33 
IDKaryotypeMolecular genetic aberrationsFABGPR56 RPKMGPR56+ % (FACS)
02H053 46,XY[20] NPM1, FLT3-ITD, IDH2 M1 0.94 NA 
03H041 46,XX[22] FLT3-ITD, NUP98-NSD1 fusion M5 0.86 1.69 
03H116 46,XX[21] NPM1, FLT3-ITD, IDH2 M1 7.69 3.73 
03H119 46,XY[20] RUNX1 M1 3.04 3.02 
04H024 46,XX[21] NPM1, IDH2, DNMT3A (other) M1 6.87 20.98 
04H112 46,XX[21] NPM1, FLT3-ITD, GATA2, DNMT3A (R882H) M1 161.28 91.03 
04H133 46,XX[20] NPM1, FLT3-ITD, DNMT3A (other) M1 143.72 84.95 
05H050 46,XY[20] FLT3-ITD, WT1, DNMT3A (R882H), MLL-PTD M4 2.36 3.11 
05H094 46,XY[23] NPM1, TET2 M5B 0.90 1.55 
05H149 46,XY[20] IDH2, RUNX1, DNMT3A (R882H) NC 12.23 20.02 
05H163 46,XY[22]  M1 6.35 20.17 
05H181 46,XX,inc[11] NPM1, FLT3-ITD M5B 1.36 NA 
06H028 46,XX[20] NPM1, TET2, GATA2 M1 1.34 1.62 
06H088 46,XY,t(6;11)(q27;q23)[20]  M1 5.82 4.43 
06H135 Complex karyotype TP53 M0 2.33 NA 
06H144 46,XX[20] NPM1, IDH2, DNMT3A (other) M1 1.39 NA 
07H099 46,XX,inv(16)(p13.1q22)[20]  NC 1.02 NA 
07H135 46,XY[20] NPM1, FLT3-ITD, IDH2, DNMT3A (other) M1 37.56 91.48 
08H012 47,XX,+11[21] FLT3-ITD, IDH2, DNMT3A (other), MLL-PTD M1 8.34 42.15 
08H021 46,XY,t(9;11)(p22;q23)[20]  M5A 0.54 0.46 
08H048 46,XY[21] WT1 M1 0.75 NA 
08H112 46,XY[20] IDH2, MLL-PTD NC 10.87 10.34 
09H031 46,XX[20] NPM1, FLT3-ITD M1 16.34 78.73 
09H043 46,XY[21] NPM1, FLT3-ITD, DNMT3A (L566*) M1 67.35 90.97 
09H046 45,XY,add(16)(p13.1),-17[20] TP53, TET2, RUNX1, DNMT3A (other) NC 11.81 14.97 
09H083 46,XX[20] NPM1, FLT3-ITD, IDH2, DNMT3A (R882H) M1 40.04 84.19 
09H113 46,XY[22] IDH2, DNMT3A (other), MLL-PTD M1 23.58 40.53 
09H115 46,XY[24] FLT3-ITD, IDH2, MLL-PTD M1 1.90 3.51 
10H031 46,XX[27] MLL-MLLT4 (by FISH and RNA-Seq) M5B 0.45 0.29 
10H038 46,XX[20] WT1 M0 5.52 31.86 
10H056 46,XX[18] IDH1, DNMT3A (other) M1 6.21 9.53 
10H072 46,XY[20] NPM1, TET2, DNMT3A (R882C) M5B 0.91 1.44 
10H089 46,XX[26] WT1 NC 1.32 NA 
10H092 46,XX[21] NPM1, FLT3-ITD, DNMT3A (R882C) M1 67.18 97.01 
10H101 46,XX[22] NPM1, FLT3-ITD, DNMT3A (R882H) M2 47.97 83.44 
10H109 45,XX,der(7)?t(7;18)(p12;q12),-18[17]/46,XX[3] NPM1, TET2 M1 1.72 NA 
10H113 Complex karyotype TP53, IDH2 M1 7.32 28.35 
10H115 46,XY[23] NPM1, FLT3-ITD, IDH2, WT1 M1 4.65 6.88 
10H127 46,XY,t(9;11)(p22;q23)[20]  M5A 0.15 0.15 
10H161 47,XX,+8[9]/46,XX[4] NPM1, TET2, DNMT3A (R882C) M5B 0.13 0.76 
10H166 46,XY[20] NPM1, FLT3-ITD, IDH2, DNMT3A (R882H) NC 41.00 69.93 
11H006 46,XX[23] NPM1, IDH1, DNMT3A (R882H) M5A 1.04 14.21 
11H008 48,XY,+13,+15[3]/46,XY[14] FLT3-ITD, MLL-PTD NC 6.37 5.59 
11H009 46,XY[20] FLT3-ITD, IDH1, DNMT3A (R882H) M2 24.86 61.9 
11H019 45,XX,add(10)(p13),-18[11]/46,XX[10] NPM1, TET2 M1 2.35 1.85 
11H021 46,XX[20] FLT3-ITD, MLL-PTD M2 7.44 NA 
11H046 92,XXYY[4]/46,XY[19] IDH1, RUNX1 M0 13.56 22.13 
11H058 46,XY[20] NPM1, FLT3-ITD, IDH1 M1 44.24 NA 
11H072 46,XX[20] NPM1, FLT3-ITD, DNMT3A (R882H) M2 73.17 95.2 
11H083 46,XY[20] NPM1, FLT3-ITD, DNMT3A (R882C) M5A 49.36 54.7 
11H095 46,XY[20]  M5A 0.23 0.13 
11H126 46,XY[21] NPM1, TET2 M5B 1.32 NA 
11H129 47,XY,+10[19]/46,XY[1] GATA2 M1 0.73 1.91 
11H142 46,XX[21] NPM1, FLT3-ITD, TET2 M1 27.70 59.62 
11H160 46,XX[22] FLT3-ITD M4 3.56 3.07 
11H170 Complex karyotype RUNX1 M0 44.80 50.33 

FAB, French-American-British classification; NA, not available; NC, not classifiable by FAB criteria.

View Large
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal