Table 1

Ras pathway mutations in relapsed B-lineage ALL and clinical characteristics

Parameter/categoryTotal cohortAll RAS pathway genesNRAS and KRASNRASKRASPTPN11FLT3
n%n%Pn%Pn%Pn%Pn%Pn%P
Gender                     
 Total 206 100.0 78 100  60   30   30   9   10   
 Male 126 61.2 53 68.0 .12 42 70.0 .095 18 60.0 .89 24 80.0 .022 6 66.7 .73 6 60.0 1.00 
 Female 80 38.8 25 32.0  18 30.0  12 40.0  6 20.0  3 33.3  4 40.0  
Age at relapse diagnosis                     
 <5 y 29 14.1 14 18.0 .46 11 18.3 .52 5 16.7 .89 6 20.0 .57 2 22.2 .72 2 20.0 .82 
 5-10 y 89 43.2 32 41.0  24 40.0  13 43.3  11 36.7  4 44.4  4 40.0  
 ≥10 y 88 42.7 32 41.0  25 41.7  12 40.0  13 43.3  3 33.3  4 40.0  
Time point of relapse                     
 Very early 44 21.4 18 23.0 .011 16 26.7 .001 6 20.0 .017 10 33.3 .039 1 11.1 .72 1 10.0 .83 
 Early 43 20.9 24 30.8  21 35.0  12 40.0  9 30.0  1 11.1  1 20.0  
 Late 119 57.8 36 46.2  23 38.3  12 40.0  11 36.7  7 77.8  7 70.0  
Relapse stage                     
 On therapy 62 30.1 28 35.9 .16 25 41.7 .02 13 43.3 .087 12 40.0 .20 2 22.2 .73 1 10.0 .29 
 Off therapy 144 69.9 50 64.1  35 58.3  17 56.7  18 60.0  7 77.8  9 90.0  
Site of relapse                     
 BM isolated 163 79.1 59 75.6 .34 44 73.3 .19 20 66.7 .069 24 80.0 .90 7 77.8 1.00 8 80.0 1.00 
 BM combined 61 29.6 19 24.4  16 26.7  10 33.3  6 20.0  2 22.2  2 20.0  
CNS involvement                     
 No 177 85.9 63 80.8 .097 46 76.7 .014 22 73.3 .032 24 80.0 .31 8 88.9 1.00 9 90.0 1.00 
 Yes 29 14.1 15 19.2  14 23.3  8 26.7  6 20.0  1 11.1  1 10.0  
Strategic group                     
 S2 131 63.6 44 56.4  30 50.0 .024 16 53.3 .15 14 46.7 .11 7 77.8 .88 8 80.0 .72 
 S3 31 15.0 16 20.5  14 23.3  8 26.7  6 20.0  1 11.1  1 10.0  
 S4 44 21.4 18 23.1  16 26.7  6 20  10 33.3  1 11.1  1 10.0  
Cytological response                     
 After first course 86 41.7 26 34.7 .079 18 31.6 .031 12 40.0 .26 6 22.2 .023 4 44.4 .83 4 40.0 .70 
 After second course 56 27.2 27 36.0  19 33.3  9 30  10 37.0  4 44.4  5 50.0  
 After third course 17 8.3 8 10.7  8 14.0  2 6.7  6 22.2  0 0  0 0  
 After fourth course 6 2.9 4 5.3  4 7.0  3 10.0  1 3.7  0 0  0 0  
 Nonresponse (no CR) 33 16.0 10 13.3  8 14.0  4 13.3  4 14.8  1 11.1  1 10.0  
 Unknown 8  3   3   0      0      
Outcome                     
 CCR 94 45.6 33 42.3 .40 23 38.3 .32 12 40 .63 11 37 .31 5 56 1.00 6 60 .85 
 Second relapse 55 26.7 27 34.6  22 36.7  12 40  10 33  3 33  2 20  
 TRD 15 7.3 5 6.4  4 6.7  2 7  2 7  0 0  1 10  
 Secondary malignancy 2 9.7 0 0  0 0  0 0  0 0  0 0  0 0  
 Nonresponse 33 16.0 10 12.8  8 13.3  4 13  4 13  1 11  1 10  
 Induction death 7 3.4 3 3.9  3 5.0  0 0  3 10  0 0  0 0  
ETV6-RUNX1                     
 Positive 31 15.2 4 5.1 .001 4 6.7 .032 3 10.0 .58 1 3.3 .055 0 0 .19 0 0 .17 
 Negative 173 83.8 74 94.9  56 93.3  27 90.0  29 96.7  9 100  10 100  
 Unknown 2     0   0   0         
High hyperdiploid                     
 Positive 41 19.9 24 30.8 .002 18 30.0 .020 8 26.7 .32 10 33.3 .046 4 44.4 .08 2 20 1.00 
 Negative 165 80.1 54 69.2  42 70.0  22 73.3  20 66.7  5 55.6  8 80  
TP53 alteration                     
 Positive 23 11.5 7 9.2 .43 6 10.3 .74 3 10.3 1.00 3 10.34 1.00 1 11.1 1.00 0 0 .61 
 Negative 177 88.5 69 90.8  52 89.7  26 89.7  26 89.7  8 88.9  10 100  
 Unknown 6                    
IKZF1 deletion                     
 Positive 65 32.5 28 36.8 .310 20 34.5 .70 11 37.9 .52 9 31.0 1.00 4 44.4 .48 4 40 .73 
 Negative 135 67.5 48 63.2  38 65.5  18 62.1  20 69.0  5 55.6  6 60  
 Unknown 6  
Parameter/categoryTotal cohortAll RAS pathway genesNRAS and KRASNRASKRASPTPN11FLT3
n%n%Pn%Pn%Pn%Pn%Pn%P
Gender                     
 Total 206 100.0 78 100  60   30   30   9   10   
 Male 126 61.2 53 68.0 .12 42 70.0 .095 18 60.0 .89 24 80.0 .022 6 66.7 .73 6 60.0 1.00 
 Female 80 38.8 25 32.0  18 30.0  12 40.0  6 20.0  3 33.3  4 40.0  
Age at relapse diagnosis                     
 <5 y 29 14.1 14 18.0 .46 11 18.3 .52 5 16.7 .89 6 20.0 .57 2 22.2 .72 2 20.0 .82 
 5-10 y 89 43.2 32 41.0  24 40.0  13 43.3  11 36.7  4 44.4  4 40.0  
 ≥10 y 88 42.7 32 41.0  25 41.7  12 40.0  13 43.3  3 33.3  4 40.0  
Time point of relapse                     
 Very early 44 21.4 18 23.0 .011 16 26.7 .001 6 20.0 .017 10 33.3 .039 1 11.1 .72 1 10.0 .83 
 Early 43 20.9 24 30.8  21 35.0  12 40.0  9 30.0  1 11.1  1 20.0  
 Late 119 57.8 36 46.2  23 38.3  12 40.0  11 36.7  7 77.8  7 70.0  
Relapse stage                     
 On therapy 62 30.1 28 35.9 .16 25 41.7 .02 13 43.3 .087 12 40.0 .20 2 22.2 .73 1 10.0 .29 
 Off therapy 144 69.9 50 64.1  35 58.3  17 56.7  18 60.0  7 77.8  9 90.0  
Site of relapse                     
 BM isolated 163 79.1 59 75.6 .34 44 73.3 .19 20 66.7 .069 24 80.0 .90 7 77.8 1.00 8 80.0 1.00 
 BM combined 61 29.6 19 24.4  16 26.7  10 33.3  6 20.0  2 22.2  2 20.0  
CNS involvement                     
 No 177 85.9 63 80.8 .097 46 76.7 .014 22 73.3 .032 24 80.0 .31 8 88.9 1.00 9 90.0 1.00 
 Yes 29 14.1 15 19.2  14 23.3  8 26.7  6 20.0  1 11.1  1 10.0  
Strategic group                     
 S2 131 63.6 44 56.4  30 50.0 .024 16 53.3 .15 14 46.7 .11 7 77.8 .88 8 80.0 .72 
 S3 31 15.0 16 20.5  14 23.3  8 26.7  6 20.0  1 11.1  1 10.0  
 S4 44 21.4 18 23.1  16 26.7  6 20  10 33.3  1 11.1  1 10.0  
Cytological response                     
 After first course 86 41.7 26 34.7 .079 18 31.6 .031 12 40.0 .26 6 22.2 .023 4 44.4 .83 4 40.0 .70 
 After second course 56 27.2 27 36.0  19 33.3  9 30  10 37.0  4 44.4  5 50.0  
 After third course 17 8.3 8 10.7  8 14.0  2 6.7  6 22.2  0 0  0 0  
 After fourth course 6 2.9 4 5.3  4 7.0  3 10.0  1 3.7  0 0  0 0  
 Nonresponse (no CR) 33 16.0 10 13.3  8 14.0  4 13.3  4 14.8  1 11.1  1 10.0  
 Unknown 8  3   3   0      0      
Outcome                     
 CCR 94 45.6 33 42.3 .40 23 38.3 .32 12 40 .63 11 37 .31 5 56 1.00 6 60 .85 
 Second relapse 55 26.7 27 34.6  22 36.7  12 40  10 33  3 33  2 20  
 TRD 15 7.3 5 6.4  4 6.7  2 7  2 7  0 0  1 10  
 Secondary malignancy 2 9.7 0 0  0 0  0 0  0 0  0 0  0 0  
 Nonresponse 33 16.0 10 12.8  8 13.3  4 13  4 13  1 11  1 10  
 Induction death 7 3.4 3 3.9  3 5.0  0 0  3 10  0 0  0 0  
ETV6-RUNX1                     
 Positive 31 15.2 4 5.1 .001 4 6.7 .032 3 10.0 .58 1 3.3 .055 0 0 .19 0 0 .17 
 Negative 173 83.8 74 94.9  56 93.3  27 90.0  29 96.7  9 100  10 100  
 Unknown 2     0   0   0         
High hyperdiploid                     
 Positive 41 19.9 24 30.8 .002 18 30.0 .020 8 26.7 .32 10 33.3 .046 4 44.4 .08 2 20 1.00 
 Negative 165 80.1 54 69.2  42 70.0  22 73.3  20 66.7  5 55.6  8 80  
TP53 alteration                     
 Positive 23 11.5 7 9.2 .43 6 10.3 .74 3 10.3 1.00 3 10.34 1.00 1 11.1 1.00 0 0 .61 
 Negative 177 88.5 69 90.8  52 89.7  26 89.7  26 89.7  8 88.9  10 100  
 Unknown 6                    
IKZF1 deletion                     
 Positive 65 32.5 28 36.8 .310 20 34.5 .70 11 37.9 .52 9 31.0 1.00 4 44.4 .48 4 40 .73 
 Negative 135 67.5 48 63.2  38 65.5  18 62.1  20 69.0  5 55.6  6 60  
 Unknown 6  

P values are derived from comparisons of mutated vs nonmutated group. In terms of time point of relapse, very early is <18 mo from initial diagnosis, early is between 18 mo after initial diagnosis and 6 mo after regular completion of initial treatment, and late is >6 mo after regular completion of initial treatment. P values (< .05) are in bold font.

BM, bone marrow; CCR, continuous complete remission; CNS, central nervous system; CR, complete remission; TRD, treatment-related death.

View Large
Close Modal
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal