Table 1

BRAF V600E allele–specific PCR and MAP2K1 exons 2 and 3 Sanger sequencing results

Case #BRAF V600E AS-PCR resultMAP2K1 Sanger sequencing
Exon 2Exon 3Confirmed somatic*
1 Negative WT c. 303_308del p. E102_I103del Yes 
2 Negative c.140G>A p.R47Q WT Yes 
3 Positive WT WT N/A 
4 Positive WT WT N/A 
5 Negative WT WT N/A 
6 Positive WT WT N/A 
7 Positive WT WT N/A 
8 Negative c. 159_173del p.F53_Q58delinsL WT Yes 
9 Positive WT WT N/A 
10 Negative WT WT N/A 
11 Positive WT WT N/A 
12 Negative c. 168_182del p.K57_G61del WT Yes 
13 Positive WT WT N/A 
14 Positive WT WT N/A 
15 Negative WT WT N/A 
16 Positive† WT WT N/A 
17 Negative WT WT N/A 
18 Negative WT WT N/A 
19 Negative WT c.299_307delinsCTC p.H100_I103delinsPL Yes 
20 Positive WT WT N/A 
21 Negative WT c. 303_308del p. E102_I103del Yes 
22 Negative WT WT N/A 
23 Positive WT WT N/A 
24 Negative WT WT N/A 
25 Negative WT WT N/A 
26 Negative WT c. 304_309del p. E102_I103del Yes 
27 Negative WT WT N/A 
28 Positive WT WT N/A 
29 Negative WT WT N/A 
30 Positive WT WT N/A 
31 Negative WT c. 295_312del p. I99_K104del Yes 
32 Negative WT c. 361T>A
p. C121S
c. 383G>T
p.G128V 		Yes 
33 Positive WT WT N/A 
34 Negative WT WT N/A 
35 Positive WT WT N/A 
36 Negative WT c. 304_309del p. E102_I103del Yes 
37 Negative c. 145C>T, p. R49C c. 316G>A
p. A106T 		Yes 
38 Positive WT WT N/A 
39 Positive WT WT N/A 
40 Positive WT WT N/A 
Case #BRAF V600E AS-PCR resultMAP2K1 Sanger sequencing
Exon 2Exon 3Confirmed somatic*
1 Negative WT c. 303_308del p. E102_I103del Yes 
2 Negative c.140G>A p.R47Q WT Yes 
3 Positive WT WT N/A 
4 Positive WT WT N/A 
5 Negative WT WT N/A 
6 Positive WT WT N/A 
7 Positive WT WT N/A 
8 Negative c. 159_173del p.F53_Q58delinsL WT Yes 
9 Positive WT WT N/A 
10 Negative WT WT N/A 
11 Positive WT WT N/A 
12 Negative c. 168_182del p.K57_G61del WT Yes 
13 Positive WT WT N/A 
14 Positive WT WT N/A 
15 Negative WT WT N/A 
16 Positive† WT WT N/A 
17 Negative WT WT N/A 
18 Negative WT WT N/A 
19 Negative WT c.299_307delinsCTC p.H100_I103delinsPL Yes 
20 Positive WT WT N/A 
21 Negative WT c. 303_308del p. E102_I103del Yes 
22 Negative WT WT N/A 
23 Positive WT WT N/A 
24 Negative WT WT N/A 
25 Negative WT WT N/A 
26 Negative WT c. 304_309del p. E102_I103del Yes 
27 Negative WT WT N/A 
28 Positive WT WT N/A 
29 Negative WT WT N/A 
30 Positive WT WT N/A 
31 Negative WT c. 295_312del p. I99_K104del Yes 
32 Negative WT c. 361T>A
p. C121S
c. 383G>T
p.G128V 		Yes 
33 Positive WT WT N/A 
34 Negative WT WT N/A 
35 Positive WT WT N/A 
36 Negative WT c. 304_309del p. E102_I103del Yes 
37 Negative c. 145C>T, p. R49C c. 316G>A
p. A106T 		Yes 
38 Positive WT WT N/A 
39 Positive WT WT N/A 
40 Positive WT WT N/A 

AS-PCR, allele-specific polymerase chain reaction; N/A, not applicable.

*

MAP2K1 Sanger sequencing of germline DNA was performed to confirm the somatic nature of mutations where indicated.

†

c. 1798_1799insAGGCTACAG, p. T599_V600insEAT was confirmed by Sanger sequencing of BRAF exon 15.

View Large
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal