Table 2

New recurrent copy number alterations

Genomic lesionPaired patients, nUnpaired patients, nFrequency within cohortStartStopSegment lengthGenes
del(15)(q15.1) 1* 7 4% 39 745 774 39 816 254 70 480 MGA 
del(10)(q24) 2* 4* 2% 104 146 465 105 040 096 893 631 19 genes (eg, NFKB2
del(14)(q24.3) 3 2% 75 152 557 75 614 215 461 658 FLVCR2, C14orf1, TTLL5, BCYRN1, TGFB3, C14orf179 
del(1)(q23.3) 1% 158 997 196 159 441 807 444 611 19 genes 
del(1)(q42.12) 1% 223 854 863 224 490 349 635 486 12 genes 
del(3)(p21.31) 1% 47 565 887 49 821 882 1 255 995 58 genes (eg, ATRIP
del(6)(p22.1) 1% 26 121 993 26 343 281 221 288 Histone cluster, HFE 
gain(6)(p25.3) 1% 94 649 1 485 307 1 390 658 DUSP22, IRF4, EXOC2, HUS1B, LOC285768, FOXQ1, FOXF2 
del(9)(q13-q21.11) 1% 70 139 836 70 788 159 648 323 PGM5, C9orf71, PIP5K1B 
del(14)(q13.2)  1% 34 107 436 35 183 612 1 076 176 11 genes (eg, NFKBIA
Genomic lesionPaired patients, nUnpaired patients, nFrequency within cohortStartStopSegment lengthGenes
del(15)(q15.1) 1* 7 4% 39 745 774 39 816 254 70 480 MGA 
del(10)(q24) 2* 4* 2% 104 146 465 105 040 096 893 631 19 genes (eg, NFKB2
del(14)(q24.3) 3 2% 75 152 557 75 614 215 461 658 FLVCR2, C14orf1, TTLL5, BCYRN1, TGFB3, C14orf179 
del(1)(q23.3) 1% 158 997 196 159 441 807 444 611 19 genes 
del(1)(q42.12) 1% 223 854 863 224 490 349 635 486 12 genes 
del(3)(p21.31) 1% 47 565 887 49 821 882 1 255 995 58 genes (eg, ATRIP
del(6)(p22.1) 1% 26 121 993 26 343 281 221 288 Histone cluster, HFE 
gain(6)(p25.3) 1% 94 649 1 485 307 1 390 658 DUSP22, IRF4, EXOC2, HUS1B, LOC285768, FOXQ1, FOXF2 
del(9)(q13-q21.11) 1% 70 139 836 70 788 159 648 323 PGM5, C9orf71, PIP5K1B 
del(14)(q13.2)  1% 34 107 436 35 183 612 1 076 176 11 genes (eg, NFKBIA
*

Loss in close vicinity in 1 patient.

Losses in close vicinity in 5 different patients.

Losses in close vicinity in 2 different patients.

or Create an Account

Close Modal
Close Modal