Table 1

Somatic mutations in AA

Study
Lane et al13 Kulasekararaj et al15 Heuser et al14 Babushok et al16 Yoshizato et al18 
N = 39N = 150N = 38N = 22N = 439 (All)N = 256 (NIH)
Ratio of male to female (M/F, n) 1.3 (22/17) 0.9 (71/79) 0.9 (18/20) 0.7 (9/13) 1.3 (244/195) 1.6 (157/99) 
Median age, y (range) 34.8 (4-65.7) 44 (17-84) 30 (9-79) 14.5 (1.5-61) 40.5 (2.5-88) 29.5 (2.5-82.5) 
SAA/VSAA, n (%) 29 (74) 74 (49) 27 (71) 9 (41) 344 (78) 256 (100) 
Serially collected samples, n — — — — 82 62 
Platform for sequencing       
 Targeted exons 219 genes 835 genes (n = 57) 42 genes — 106 genes 
 Whole exome, n — — — 22 52 35 
Mutated genes, n (%)       
DNMT3A 1 (2.6) 8 (5.3) 0 (0) 0 (0%) 37 (8.4) 18 (7.0) 
ASXL1 2 (5.1) 12 (8.0) 1 (2.6) 1 (4.5) 27 (6.2) 17 (6.6) 
BCOR/BCORL1 0 (0) 6 (4.0) 0 (0) 1 (4.5) 41 (9.3) 28 (10.9) 
PIGA ND 18 (12.0) ND 9 (40.9) 33 (7.5) 25 (9.8) 
 Other genes* 6 (15.1)  1 (2.6) 5 (22.7) 67 (15.3) 29 (6.6) 
 Any genes 9 (23.1) 29 (19.3) 2 (5.3) 16 (72.7) 157 (35.8) 90 (35.2) 
 Excluding PIGA alone 9 (23.1) 29 (19.3) 2 (5.3)  137 (31.2) 74 (28.9) 
Clone size       
 Median (range) (%) ND 20 (1.5-68) ND ND 15.4 (2.4-96.4) 15.2 (2.4-76.7) 
 Clone size <10%, n (%) 7 (78) 11 (14) 0 (0) 2 (9.1) 130 (29.6) 79 (30.9) 
Cytogenetic abnormalities, n (%) ND  3 (7.9) 2 (9.1) 20 (8.5) 9 (3.8) 
6pUPD (+) clone, n (%) ND ND 3 (13.6) 55 (13.2) 31 (13.2) 
PNH clone, n (%) 4 (10) 85 (57) 17 (45) 10 (46) 221 (50.3) 110 (43.0) 
IST, n (%)       
 Yes 19 (49) 107 (71.3) ND 20 (91) 403 (92.4) 256 (100) 
 No 20 (51) 43 (28.7) ND 2 (9) 33 (7.6) 0 (0) 
Transformation to MDS/AML, n (%) ND 17 (11.3) ND ND 47 (10.7) 36 (14.1) 
Study
Lane et al13 Kulasekararaj et al15 Heuser et al14 Babushok et al16 Yoshizato et al18 
N = 39N = 150N = 38N = 22N = 439 (All)N = 256 (NIH)
Ratio of male to female (M/F, n) 1.3 (22/17) 0.9 (71/79) 0.9 (18/20) 0.7 (9/13) 1.3 (244/195) 1.6 (157/99) 
Median age, y (range) 34.8 (4-65.7) 44 (17-84) 30 (9-79) 14.5 (1.5-61) 40.5 (2.5-88) 29.5 (2.5-82.5) 
SAA/VSAA, n (%) 29 (74) 74 (49) 27 (71) 9 (41) 344 (78) 256 (100) 
Serially collected samples, n — — — — 82 62 
Platform for sequencing       
 Targeted exons 219 genes 835 genes (n = 57) 42 genes — 106 genes 
 Whole exome, n — — — 22 52 35 
Mutated genes, n (%)       
DNMT3A 1 (2.6) 8 (5.3) 0 (0) 0 (0%) 37 (8.4) 18 (7.0) 
ASXL1 2 (5.1) 12 (8.0) 1 (2.6) 1 (4.5) 27 (6.2) 17 (6.6) 
BCOR/BCORL1 0 (0) 6 (4.0) 0 (0) 1 (4.5) 41 (9.3) 28 (10.9) 
PIGA ND 18 (12.0) ND 9 (40.9) 33 (7.5) 25 (9.8) 
 Other genes* 6 (15.1)  1 (2.6) 5 (22.7) 67 (15.3) 29 (6.6) 
 Any genes 9 (23.1) 29 (19.3) 2 (5.3) 16 (72.7) 157 (35.8) 90 (35.2) 
 Excluding PIGA alone 9 (23.1) 29 (19.3) 2 (5.3)  137 (31.2) 74 (28.9) 
Clone size       
 Median (range) (%) ND 20 (1.5-68) ND ND 15.4 (2.4-96.4) 15.2 (2.4-76.7) 
 Clone size <10%, n (%) 7 (78) 11 (14) 0 (0) 2 (9.1) 130 (29.6) 79 (30.9) 
Cytogenetic abnormalities, n (%) ND  3 (7.9) 2 (9.1) 20 (8.5) 9 (3.8) 
6pUPD (+) clone, n (%) ND ND 3 (13.6) 55 (13.2) 31 (13.2) 
PNH clone, n (%) 4 (10) 85 (57) 17 (45) 10 (46) 221 (50.3) 110 (43.0) 
IST, n (%)       
 Yes 19 (49) 107 (71.3) ND 20 (91) 403 (92.4) 256 (100) 
 No 20 (51) 43 (28.7) ND 2 (9) 33 (7.6) 0 (0) 
Transformation to MDS/AML, n (%) ND 17 (11.3) ND ND 47 (10.7) 36 (14.1) 

F, female; M, male; ND, not determined; NIH, National Institutes of Health; SAA, severe AA; VSAA, very severe AA; —, no corresponding samples.

*

Excluding DNMT3A, ASXL1, BCOR/BCORL1, and PIGA.

Maximum clone size in mutation-positive cases.

Variant allele frequency >5%.

or Create an Account

Close Modal
Close Modal