Table 1

IgVH sequence analysis of cutaneous MZBCLs

Patient no.Ig isotype (RT-PCR)IgVH rearrangementNo. of mutationsR/S ratio FRCDR3 sequenceCDR3- length (aa)
CM01 Cγ4 V1-69/D3-10/JH6 25 0.9* CAR ATYSGSEQYDFDSSSYLDV WGKG 19 
 Cα V1-69/D3-10/JH6 33 2.6* CAG VDYSDSGRHYSFSASYFDV WGKG 19 
CM03 Cγ1/Cα V3-30/D2-8/JH4 20 2.6 CAK GGMVSTIPIDY WGQG 11 
CM04 Cμ/Cδ V3-9/D2-8/JH4 19 2.3 CAK DVDIVLMIFSFRSRGFDS WGQG 18 
CM06 Cγ/Cϵ ND ND ND CAR GKTAVVGAPGYYFDY WGQG 15 
CM07 Cγ/Cϵ ND ND ND CAT VRLDSPY(S/A)FAY WGQG 11 
CM08 Cγ4 V3-30/D3-9/JH4 43 1.3* CAS LRMSIDRGFDC WGQG 11 
CM10 Cγ V1-08/D3-10/JH4 41 2.1* CGR VLNTPAHRPIRGLIAY WGQG 16 
CM11 Cα V1-69/D6-6/JH4 4 ND CAR AVDFDSSSSYSF WGQG 12 
CM13 Cμ V3-72/D6-19/JH3 12 1.3 CVR GYSIGWPYDALAR WGQG 13 
CM15 Cγ1/Cϵ V3-53/D2-2/JH3 24 3.6 CAR ENPRHDVFDI WGLG 10 
CM19 Cγ ND ND ND CAK ESGGAARMRGNYYYYYYMDV WGQG 20 
CM20 Cγ ND ND ND CVR HSAEVADSVEED WGQG 12 
CM21 Cγ ND ND ND CAR ETNYDSWTGSPSSHYFGLDF WGQG 20 
CM22 Cα ND ND ND CAR GSGDYKVTKYYEDAFDI WGQG 17 
CM29 Cγ ND ND ND CAR GVDFDYFDL WGRG 9 
CM34 Cγ ND ND ND CAK DLLLRVVGCLDY WGQG 12 
CM35 Cγ V1-69/D1-14/JH5 ND ND CAR GSHLIGGTIASFDP WGQG 14 
CM37 Cγ/Cα V1-02/D2-21/JH4 ND ND CAA AL(S/P)ESSFPFTFHD WGQG 13 
CM42 Cγ ND ND ND CAR LNYVLHLGRLIEGAGTNYGMDV LGQG 22 
CM43 Cμ/Cδ ND ND ND CAR APFLGDVFFDP WGQG 11 
CM44 Cγ V3-48/D5-24/JH4 38 1.4 CAK LQRRGLQLGYLEY FGQG 13 
Patient no.Ig isotype (RT-PCR)IgVH rearrangementNo. of mutationsR/S ratio FRCDR3 sequenceCDR3- length (aa)
CM01 Cγ4 V1-69/D3-10/JH6 25 0.9* CAR ATYSGSEQYDFDSSSYLDV WGKG 19 
 Cα V1-69/D3-10/JH6 33 2.6* CAG VDYSDSGRHYSFSASYFDV WGKG 19 
CM03 Cγ1/Cα V3-30/D2-8/JH4 20 2.6 CAK GGMVSTIPIDY WGQG 11 
CM04 Cμ/Cδ V3-9/D2-8/JH4 19 2.3 CAK DVDIVLMIFSFRSRGFDS WGQG 18 
CM06 Cγ/Cϵ ND ND ND CAR GKTAVVGAPGYYFDY WGQG 15 
CM07 Cγ/Cϵ ND ND ND CAT VRLDSPY(S/A)FAY WGQG 11 
CM08 Cγ4 V3-30/D3-9/JH4 43 1.3* CAS LRMSIDRGFDC WGQG 11 
CM10 Cγ V1-08/D3-10/JH4 41 2.1* CGR VLNTPAHRPIRGLIAY WGQG 16 
CM11 Cα V1-69/D6-6/JH4 4 ND CAR AVDFDSSSSYSF WGQG 12 
CM13 Cμ V3-72/D6-19/JH3 12 1.3 CVR GYSIGWPYDALAR WGQG 13 
CM15 Cγ1/Cϵ V3-53/D2-2/JH3 24 3.6 CAR ENPRHDVFDI WGLG 10 
CM19 Cγ ND ND ND CAK ESGGAARMRGNYYYYYYMDV WGQG 20 
CM20 Cγ ND ND ND CVR HSAEVADSVEED WGQG 12 
CM21 Cγ ND ND ND CAR ETNYDSWTGSPSSHYFGLDF WGQG 20 
CM22 Cα ND ND ND CAR GSGDYKVTKYYEDAFDI WGQG 17 
CM29 Cγ ND ND ND CAR GVDFDYFDL WGRG 9 
CM34 Cγ ND ND ND CAK DLLLRVVGCLDY WGQG 12 
CM35 Cγ V1-69/D1-14/JH5 ND ND CAR GSHLIGGTIASFDP WGQG 14 
CM37 Cγ/Cα V1-02/D2-21/JH4 ND ND CAA AL(S/P)ESSFPFTFHD WGQG 13 
CM42 Cγ ND ND ND CAR LNYVLHLGRLIEGAGTNYGMDV LGQG 22 
CM43 Cμ/Cδ ND ND ND CAR APFLGDVFFDP WGQG 11 
CM44 Cγ V3-48/D5-24/JH4 38 1.4 CAK LQRRGLQLGYLEY FGQG 13 

R/S ratio FR indicates replacement/silent mutation ratio in IgVH framework regions; aa, amino acids; and ND, not determined.

*

Significant according to Chang and Casali.32 

View Large