Table 2

Common regions of genomic alterations

ChromosomeMinimally altered regionSize, Mb*Gain/lossNovel alterationPatient no.
1      
    p31.1 77.4-77.8 0.4 L Y 26 
    p22.1 91.6-93.1 1.5 L Y 26 
    q21.2 145.2-146.5 1.3 G Y 40 
    q42.3 231.0-231.4 0.4 G Y 38 
    q42.3 231.6-232.1 0.5 L Y 40 
2      
    p23.1 32.0-33.1 0.9 L Y 33, 44 
    p11.2 87.5-87.9 0.4 G Y 13 
    q33.1-q33.2 203-204 1 L Y 26, 29, 33 
3      
    p25.3 10.4-10.9 0.5 G Y 44 
    p14.3 56.4-57.8 1.4 L Y 44 
    q13.12 108.7-109.2 0.5 G Y 33 
    q13.2-q13.31 114.4-114.9 0.5 L Y 44 
    q21.3 127.7-128.5 0.8 G Y 39 
    q21.3 129.1-129.5 0.4 G Y 39 
    q26.2 170.8-171.6 0.8 L Y 33 
4      
    p14 39.2-39.8 0.6 L Y 22,26,29,30,33,40 
    q35.2 190.9-191.3 0.4 G/L Y 1, 26 
5      
    p15.33 0-2.3 2.3 G Y 22 
    q13.1-q13.2 68.3-68.9 0.6 L Y 26, 33, 40 
    q13.2 69.9-70.1 0.2 L Y 22 
    q14.3-q33 101.8-156.6 54.8 L Y 1, 4, 10, 24 
    q31.1 133.6-134.3 0.7 L Y 40 
    q33.3 159.3-159.6 0.3 L Y 17, 44 
    q35.1 168.9-169.6 0.7 G N 7 
6      
    p25.1 6.6-6.8 0.2 G Y 9 
    p23 14.9-15.4 0.5 L Y 26, 40 
    p21.2 39.2-40.2 1 G Y 11 
    q26 160.5-161.0 0.5 L Y 20 
    q27 167.8-168.2 0.4 G Y 16 
7      
    Entire chromosome 0-158.1 158.1 L N 5, 22 
    p13 44.2-44.8 0.6 L Y 33 
    q21.11 83.4-83.6 0.2 L Y 11 
    q21.12-q36.2 87.6-152.6 65 L N 44 
    q22.1 99.6-101.4 1.8 L N 2 
    q22.1 101.5-101.9 0.4 L N 13 
    q34 141.6-141.8 0.2 G N 11, 12, 24, 25, 38 
8      
    Entire chromosome 0-143.9 143.9 G N 25, 35 
    p23.1 7.2-7.6 0.4 L Y 10 
    q24.23 137.2-137.6 0.4 L Y 7 
9      
    p24.1 6.3-6.9 0.6 L Y 29 
    p22.2 16.6-17.3 0.7 L Y 40 
    q21.33-q31.2 82.0-103.1 21.1 L Y 4 
10      
    q11.22 46.3-46.9 0.6 G/L Y 7,12,20 
    q21.3 64.6-65.1 0.5 L Y 22,26,29,33,40 
11      
    p15.4 4.2-4.9 0.7 G Y 3 
    p15.2 14.9-16.0 1.1 G Y 44 
    p12-p13 36.2-37.1 0.9 G N 44 
    q12.2 61.2-61.4 0.2 G Y 13, 19 
    q13.2-q13.4 68.4-71.2 2.7 G Y 39 
    q23.2 114.4-115.0 0.6 G N 41 
    q24.2-qter 126.1-135.0 9 G N 1, 3 
12      
    p13.31 10.8-11.5 0.7 G Y 30 
    q23.3 106.0-106.6 0.6 G N 41 
14      
    Entire chromosome 17.4-105.4 88 G N 2 
    q12 29.4-29.9 0.5 L Y 26, 29, 33 
    q13.2 33.2-33.7 0.5 L Y 12 
    q32.33 104.2-105.0 0.8 G/L Y 22, 38 
15      
    q13.3 30.0-30.4 0.4 G Y 16 
    q14 33.6-33.9 0.3 G Y 31 
    q15.1 38.8-39.5 0.7 L Y 44 
    q15.3-q21.1 41.9-42.5 0.6 L Y 44 
    q24.1 71.6-71.7 0.1 G Y 11, 30 
    q25.3 86.0-86.5 0.5 G Y 30, 38 
16      
    p11.2 33.4-34.2 0.8 L Y 1 
17      
    q11.2 31.1-32.9 1.8 G Y 26, 33, 40 
    q12 35.9-36.3 0.4 G Y 3, 14 
    q24.1 63.1-63.4 0.3 G Y 38 
    q25.1 72.0-72.6 0.6 G N 41 
18      
    q21.1 44.3-44.5 0.2 G Y 31 
19      
    p-q13.2 0-46.3 46.3 L Y 44 
    p12-p13.2 9.0-24.1 15.1 L Y 33, 40 
    q13.2-q13.31 47.9-48.2 0.3 G/L Y 7, 12, 30 
20      
    p12.1 14.6-15.1 0.5 L N 20 
    q11.21-q13.13 40.2-50.4 10.2 L N 8, 9, 23 
    q13.13-qter 50.4-63.3 12.9 G N 9 
    q13.33 62.5-62.9 0.4 G Y 3 
21      
    q21.1-q21.2 22.6-23.5 0.9 L Y 41 
    q21.3 27.9-28.1 0.2 G Y 7 
    q22.11-q22.12 33.9-36.0 2.1 G Y 6 
    q22.13-q22.2 38.2-40.8 2.6 G N 6 
22      
    q13.1-q13.2 39.2-39.7 0.5 L Y 22, 44 
    q11.21 16.9-17.3 0.4 L Y 37 
X      
    p22.13 14.9-15.6 0.7 L Y 2 
    q13.2-qter 70.6-105.2 34.6 L N 41 
Y      
    Entire chromosome 2.4-26.2 23.8 L N 21 
ChromosomeMinimally altered regionSize, Mb*Gain/lossNovel alterationPatient no.
1      
    p31.1 77.4-77.8 0.4 L Y 26 
    p22.1 91.6-93.1 1.5 L Y 26 
    q21.2 145.2-146.5 1.3 G Y 40 
    q42.3 231.0-231.4 0.4 G Y 38 
    q42.3 231.6-232.1 0.5 L Y 40 
2      
    p23.1 32.0-33.1 0.9 L Y 33, 44 
    p11.2 87.5-87.9 0.4 G Y 13 
    q33.1-q33.2 203-204 1 L Y 26, 29, 33 
3      
    p25.3 10.4-10.9 0.5 G Y 44 
    p14.3 56.4-57.8 1.4 L Y 44 
    q13.12 108.7-109.2 0.5 G Y 33 
    q13.2-q13.31 114.4-114.9 0.5 L Y 44 
    q21.3 127.7-128.5 0.8 G Y 39 
    q21.3 129.1-129.5 0.4 G Y 39 
    q26.2 170.8-171.6 0.8 L Y 33 
4      
    p14 39.2-39.8 0.6 L Y 22,26,29,30,33,40 
    q35.2 190.9-191.3 0.4 G/L Y 1, 26 
5      
    p15.33 0-2.3 2.3 G Y 22 
    q13.1-q13.2 68.3-68.9 0.6 L Y 26, 33, 40 
    q13.2 69.9-70.1 0.2 L Y 22 
    q14.3-q33 101.8-156.6 54.8 L Y 1, 4, 10, 24 
    q31.1 133.6-134.3 0.7 L Y 40 
    q33.3 159.3-159.6 0.3 L Y 17, 44 
    q35.1 168.9-169.6 0.7 G N 7 
6      
    p25.1 6.6-6.8 0.2 G Y 9 
    p23 14.9-15.4 0.5 L Y 26, 40 
    p21.2 39.2-40.2 1 G Y 11 
    q26 160.5-161.0 0.5 L Y 20 
    q27 167.8-168.2 0.4 G Y 16 
7      
    Entire chromosome 0-158.1 158.1 L N 5, 22 
    p13 44.2-44.8 0.6 L Y 33 
    q21.11 83.4-83.6 0.2 L Y 11 
    q21.12-q36.2 87.6-152.6 65 L N 44 
    q22.1 99.6-101.4 1.8 L N 2 
    q22.1 101.5-101.9 0.4 L N 13 
    q34 141.6-141.8 0.2 G N 11, 12, 24, 25, 38 
8      
    Entire chromosome 0-143.9 143.9 G N 25, 35 
    p23.1 7.2-7.6 0.4 L Y 10 
    q24.23 137.2-137.6 0.4 L Y 7 
9      
    p24.1 6.3-6.9 0.6 L Y 29 
    p22.2 16.6-17.3 0.7 L Y 40 
    q21.33-q31.2 82.0-103.1 21.1 L Y 4 
10      
    q11.22 46.3-46.9 0.6 G/L Y 7,12,20 
    q21.3 64.6-65.1 0.5 L Y 22,26,29,33,40 
11      
    p15.4 4.2-4.9 0.7 G Y 3 
    p15.2 14.9-16.0 1.1 G Y 44 
    p12-p13 36.2-37.1 0.9 G N 44 
    q12.2 61.2-61.4 0.2 G Y 13, 19 
    q13.2-q13.4 68.4-71.2 2.7 G Y 39 
    q23.2 114.4-115.0 0.6 G N 41 
    q24.2-qter 126.1-135.0 9 G N 1, 3 
12      
    p13.31 10.8-11.5 0.7 G Y 30 
    q23.3 106.0-106.6 0.6 G N 41 
14      
    Entire chromosome 17.4-105.4 88 G N 2 
    q12 29.4-29.9 0.5 L Y 26, 29, 33 
    q13.2 33.2-33.7 0.5 L Y 12 
    q32.33 104.2-105.0 0.8 G/L Y 22, 38 
15      
    q13.3 30.0-30.4 0.4 G Y 16 
    q14 33.6-33.9 0.3 G Y 31 
    q15.1 38.8-39.5 0.7 L Y 44 
    q15.3-q21.1 41.9-42.5 0.6 L Y 44 
    q24.1 71.6-71.7 0.1 G Y 11, 30 
    q25.3 86.0-86.5 0.5 G Y 30, 38 
16      
    p11.2 33.4-34.2 0.8 L Y 1 
17      
    q11.2 31.1-32.9 1.8 G Y 26, 33, 40 
    q12 35.9-36.3 0.4 G Y 3, 14 
    q24.1 63.1-63.4 0.3 G Y 38 
    q25.1 72.0-72.6 0.6 G N 41 
18      
    q21.1 44.3-44.5 0.2 G Y 31 
19      
    p-q13.2 0-46.3 46.3 L Y 44 
    p12-p13.2 9.0-24.1 15.1 L Y 33, 40 
    q13.2-q13.31 47.9-48.2 0.3 G/L Y 7, 12, 30 
20      
    p12.1 14.6-15.1 0.5 L N 20 
    q11.21-q13.13 40.2-50.4 10.2 L N 8, 9, 23 
    q13.13-qter 50.4-63.3 12.9 G N 9 
    q13.33 62.5-62.9 0.4 G Y 3 
21      
    q21.1-q21.2 22.6-23.5 0.9 L Y 41 
    q21.3 27.9-28.1 0.2 G Y 7 
    q22.11-q22.12 33.9-36.0 2.1 G Y 6 
    q22.13-q22.2 38.2-40.8 2.6 G N 6 
22      
    q13.1-q13.2 39.2-39.7 0.5 L Y 22, 44 
    q11.21 16.9-17.3 0.4 L Y 37 
X      
    p22.13 14.9-15.6 0.7 L Y 2 
    q13.2-qter 70.6-105.2 34.6 L N 41 
Y      
    Entire chromosome 2.4-26.2 23.8 L N 21 

G indicates gain; and L, loss.

*

Mb position was determined using UCSC genome browser on Human Mar. 2003 assembly.

View Large
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal