Table 1

Relative expression of EVI1 splice variants (-1D, -1A, -1B, -1C, -3L) and MDS1/EVI1 (ME), a priori karyotype and final FISH results in EVI1+ patients from cohorts A and B

No.1D1A1B1C3LMEKaryotype (ISCN 1995)FISH
Cohort A         
    1 850 1634 199 80 819 0,1 45,XY,inv(3)(p12p2?4),−7[16]/46,XY[8] inv(3) 
    2 540 2159 75 73 157 0,2 45,XY,t(3;3)(q21;q26),−7[20] ND 
    3 254 1473 42 6 479 0,1 46,XY,t(3;3)(q21;q26)[51] ND 
    4 265 1405 67 58 76 0,0 45,XX,−7[24] inv(3) 
    5 352 88 33 4 65 0,5 47,XX,del(5)(q23q34),+del(21)(q21q22)[4]/47,idem,t(2;3)(p2?2;q2?7)[20]/46,XX[3] t(2;3) 
    6 796 943 160 225 131 3 45,XY,inv(3)(q21q26.2),−7[13] ND 
    7 68 74 47 5 43 8 45,XY,−7[16] inv(3) 
    8 166 177 42 5 43 25 46,XY[14] NA 
    9 50 84 21 3 137 89 48,XY,+9,+21[9]/49,idem,+21[14] NA 
    10 686 408 209 57 361 95 47,XX,del(3)(q25) or del(3)(q21q26),+mar NA 
    11 54 163 50 1 212 145 46,XX,t(6;11)(q27;q23)[36] NN 
    12 217 174 73 10 327 224 53,XY,+6,+8,+9,t(11;16)(q23;p13),+13,+14,+19,+21[15] NN 
    13 227 694 88 3 855 269 46,XX NA 
    14 120 380 85 6 527 289 46,XX,t(6;11)(q27;q23)[28] NN 
    15 94 494 119 4 680 437 46,XY[30] NA 
    16 183 1013 136 30 628 934 47,XY,+?8(9%)/46,XY NA 
    17 54 3 2 5 2185 1048 46,XY,t(3;21)(q26;q22),del(12)(p12p13)[20] ND 
    18 13 132 7 0,0 21 0,2 46,XY[38] inv(3) 
    19 21 89 11 0,5 90 24 46,XY,?der(11)(q2?)[3]/46,XY[18] NN 
    20 14 67 16 0,5 21 32 46,XY,inv(3)(q21q26)[32] inv(3) 
    21 26 99 27 1 135 86 46,XY,t(11;19)(q23;p13.1)[15]/46,XY[5] NN 
    22 7 27 9 2 77 216 NA NA 
Cohort B         
    23 1624 1256 363 59 834 19 45,XX,inv(3)(q22q26),−7[29]/46,XX[1] ND 
    24 584 417 116 74 37 4 45,XY,inv(3)(q22q26),−7[25] ND 
    25 506 845 119 37 350 0,2 45,XY,inv(3)(q12q26.2),−7[20] ND 
    26 700 1121 161 76 244 0,0 45,XX,−7[27]/46,XX[3] inv(3) 
    27 214 1074 44 9 541 0,1 NA NN 
    28 173 172 28 10 46 0,0 46,XX[68] inv(3) 
    29 196 239 69 6 167 0,0 46,XX,t(1;6)(p32;q24∼25),del(2)(q34)[33]/46,XX[1] inv(3) 
    30 829 1258 132 68 333 63 NA NA 
    31 745 2354 147 23 1309 286 45,XY,−7,t(9;11)(p21;q23)[33] NN 
    32 315 641 174 9 2532 532 46,XX,t(11;19)(q23;p13)[21] NN 
    33 207 186 118 5 373 168 46,XY,t(9;22)(q34;q11)[22] NN 
    34 192 897 112 8 3266 539 46,XX,t(2;9;11)(p13;p22;q23)[20] NA 
    35 83 306 43 3 517 448 46,XY[40] NN 
    36 79 67 36 3 204 1065 46,XX,del(7)(q22)[41]/46,XX[1] NN 
    37 52 157 27 0,9 605 429 46,XY,t(6;11)(q25;q23)[22] NN 
    38 14 7 6 0,1 95 139 47,XY,+13[11]/46,XY[28] NN 
    39 16 39 9 0,9 33 223 45,XY,−7,t(7;8)(q22;p11)[21] NN 
    40 11 6 6 1,7 144 397 47,XX,+13[27]/46,XX[1] NN 
    41 14 13 5 2,8 234 1830 46,XY,−7,add(12)(p12),+mar[46]/46,XY[54] NN 
No.1D1A1B1C3LMEKaryotype (ISCN 1995)FISH
Cohort A         
    1 850 1634 199 80 819 0,1 45,XY,inv(3)(p12p2?4),−7[16]/46,XY[8] inv(3) 
    2 540 2159 75 73 157 0,2 45,XY,t(3;3)(q21;q26),−7[20] ND 
    3 254 1473 42 6 479 0,1 46,XY,t(3;3)(q21;q26)[51] ND 
    4 265 1405 67 58 76 0,0 45,XX,−7[24] inv(3) 
    5 352 88 33 4 65 0,5 47,XX,del(5)(q23q34),+del(21)(q21q22)[4]/47,idem,t(2;3)(p2?2;q2?7)[20]/46,XX[3] t(2;3) 
    6 796 943 160 225 131 3 45,XY,inv(3)(q21q26.2),−7[13] ND 
    7 68 74 47 5 43 8 45,XY,−7[16] inv(3) 
    8 166 177 42 5 43 25 46,XY[14] NA 
    9 50 84 21 3 137 89 48,XY,+9,+21[9]/49,idem,+21[14] NA 
    10 686 408 209 57 361 95 47,XX,del(3)(q25) or del(3)(q21q26),+mar NA 
    11 54 163 50 1 212 145 46,XX,t(6;11)(q27;q23)[36] NN 
    12 217 174 73 10 327 224 53,XY,+6,+8,+9,t(11;16)(q23;p13),+13,+14,+19,+21[15] NN 
    13 227 694 88 3 855 269 46,XX NA 
    14 120 380 85 6 527 289 46,XX,t(6;11)(q27;q23)[28] NN 
    15 94 494 119 4 680 437 46,XY[30] NA 
    16 183 1013 136 30 628 934 47,XY,+?8(9%)/46,XY NA 
    17 54 3 2 5 2185 1048 46,XY,t(3;21)(q26;q22),del(12)(p12p13)[20] ND 
    18 13 132 7 0,0 21 0,2 46,XY[38] inv(3) 
    19 21 89 11 0,5 90 24 46,XY,?der(11)(q2?)[3]/46,XY[18] NN 
    20 14 67 16 0,5 21 32 46,XY,inv(3)(q21q26)[32] inv(3) 
    21 26 99 27 1 135 86 46,XY,t(11;19)(q23;p13.1)[15]/46,XY[5] NN 
    22 7 27 9 2 77 216 NA NA 
Cohort B         
    23 1624 1256 363 59 834 19 45,XX,inv(3)(q22q26),−7[29]/46,XX[1] ND 
    24 584 417 116 74 37 4 45,XY,inv(3)(q22q26),−7[25] ND 
    25 506 845 119 37 350 0,2 45,XY,inv(3)(q12q26.2),−7[20] ND 
    26 700 1121 161 76 244 0,0 45,XX,−7[27]/46,XX[3] inv(3) 
    27 214 1074 44 9 541 0,1 NA NN 
    28 173 172 28 10 46 0,0 46,XX[68] inv(3) 
    29 196 239 69 6 167 0,0 46,XX,t(1;6)(p32;q24∼25),del(2)(q34)[33]/46,XX[1] inv(3) 
    30 829 1258 132 68 333 63 NA NA 
    31 745 2354 147 23 1309 286 45,XY,−7,t(9;11)(p21;q23)[33] NN 
    32 315 641 174 9 2532 532 46,XX,t(11;19)(q23;p13)[21] NN 
    33 207 186 118 5 373 168 46,XY,t(9;22)(q34;q11)[22] NN 
    34 192 897 112 8 3266 539 46,XX,t(2;9;11)(p13;p22;q23)[20] NA 
    35 83 306 43 3 517 448 46,XY[40] NN 
    36 79 67 36 3 204 1065 46,XX,del(7)(q22)[41]/46,XX[1] NN 
    37 52 157 27 0,9 605 429 46,XY,t(6;11)(q25;q23)[22] NN 
    38 14 7 6 0,1 95 139 47,XY,+13[11]/46,XY[28] NN 
    39 16 39 9 0,9 33 223 45,XY,−7,t(7;8)(q22;p11)[21] NN 
    40 11 6 6 1,7 144 397 47,XX,+13[27]/46,XX[1] NN 
    41 14 13 5 2,8 234 1830 46,XY,−7,add(12)(p12),+mar[46]/46,XY[54] NN 

Relative expression of each of the distinct EVI1 transcripts was determined as explained in “Real-time quantitative PCR and Northern blot analysis.” A positive EVI1 or ME signal (ie, >30) is indicated by italics.

ME indicates MDS1/EVI1; ISCN, International System for Human Cytogenetic Nomenclature; FISH, fluorescent in situ hybridization; NN, normal 3q21, 3q26, and 3q telomere locus; inv(3), inversion of chromosomal band 3q21 and 3q26; NA, not available; NN, normal at the 3q21, 3q26, and 3q telomere locus as determined by FISH; and ND, not determined.

View Large
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal