Table 1.

TfR dimer interface residues and their TfR2 counterparts

TfR positionTfR residueTfR2 residueTfR2 position
182 Trp Trp 192 
183 Arg Thr 193 
185 Gln Thr 196 
312 Gly Gly 334  
313 Phe Phe 335 
314 Pro Pro 336  
315 Ser Ser 337 
316 Phe Phe 338  
317 Asn Asn 339 
320 Gln Gln 342  
321 Phe Phe 343 
322 Pro Pro 344  
400 Asp Asp 424 
402 Tyr Tyr 426 
449 Ile Leu 472 
466 Trp Trp 489  
469 Gly Gly 492 
470 Tyr Tyr 493  
471 Leu Leu 494 
472 Ser Ser 495 
473 Ser Val* 496 
474 Leu Leu 497  
476 Leu Leu 499 
477 Lys Lys 500  
637 Leu Leu 669 
638 Ser Thr 670 
639 Leu Leu 671  
641 Trp Trp 673 
667 Asp Asp 699 
668 Arg Glu* 700 
669 Phe Arg* 701 
672 Lys Arg 704 
673 Lys Met* 705 
676 Asp Val 708 
680 Arg Arg 712 
683 Tyr Phe 715 
684 His Tyr 716 
688 Pro Gln* 720 
689 Tyr Tyr 721  
691 Ser Ser 723 
692 Pro Pro 724 
693 Lys Ala 725 
733 Asn Arg* 774 
735 Leu Leu 776  
736 Ala Ala 777 
737 Leu Leu 778  
740 Trp Trp 781 
744 Gly Gly 785  
747 Asn Asn 788 
748 Ala Ala 789  
753 Val Val 794 
754 Trp Trp 795 
755 Asp Asn 796 
756 Ile Ile 797  
758 Asn Asn 799 
759 Glu Asn 800 
760 Phe Phe 801 
TfR positionTfR residueTfR2 residueTfR2 position
182 Trp Trp 192 
183 Arg Thr 193 
185 Gln Thr 196 
312 Gly Gly 334  
313 Phe Phe 335 
314 Pro Pro 336  
315 Ser Ser 337 
316 Phe Phe 338  
317 Asn Asn 339 
320 Gln Gln 342  
321 Phe Phe 343 
322 Pro Pro 344  
400 Asp Asp 424 
402 Tyr Tyr 426 
449 Ile Leu 472 
466 Trp Trp 489  
469 Gly Gly 492 
470 Tyr Tyr 493  
471 Leu Leu 494 
472 Ser Ser 495 
473 Ser Val* 496 
474 Leu Leu 497  
476 Leu Leu 499 
477 Lys Lys 500  
637 Leu Leu 669 
638 Ser Thr 670 
639 Leu Leu 671  
641 Trp Trp 673 
667 Asp Asp 699 
668 Arg Glu* 700 
669 Phe Arg* 701 
672 Lys Arg 704 
673 Lys Met* 705 
676 Asp Val 708 
680 Arg Arg 712 
683 Tyr Phe 715 
684 His Tyr 716 
688 Pro Gln* 720 
689 Tyr Tyr 721  
691 Ser Ser 723 
692 Pro Pro 724 
693 Lys Ala 725 
733 Asn Arg* 774 
735 Leu Leu 776  
736 Ala Ala 777 
737 Leu Leu 778  
740 Trp Trp 781 
744 Gly Gly 785  
747 Asn Asn 788 
748 Ala Ala 789  
753 Val Val 794 
754 Trp Trp 795 
755 Asp Asn 796 
756 Ile Ile 797  
758 Asn Asn 799 
759 Glu Asn 800 
760 Phe Phe 801 

Residues in the TfR dimer interface were identified by contact analysis in CNS25 of the unliganded TfR structure (1CX8.pdb)26 using a probe radius of 1.4 Å and a distance cutoff of 4 Å. The interface is 70% identical between TfR and TfR2, consistent with the observation of TfR-TfR2 heterodimers. Nonconservative substitutions are underlined and semiconservative substitutions are italicized. Nonconservative substitutions with an asterisk could probably be accommodated in the dimer interface, as determined by inspection of the TfR structure. For example, the substitutions at TfR position 668 and 669 would disrupt a cation-π interaction between an arginine and a phenylalanine and replace it with a salt bridge between a glutamate and an arginine.

or Create an Account

Close Modal
Close Modal