Table 4.

vEDGs: EDGs with similar expression patterns in tonsil BCs and all or subsets of MM

Accession no.SymbolFunctionQuantitative gene expression
TBCsTPCsBPCsMM
D28364 ANXA2 Annexin family − + + −/+ 
U81787 WNT10B Signaling; ligand − + ++ −/++ 
U88898 LOC51581a Unknown − + + −/+ 
X12451 CTSL Protease; cysteine − ++ ++ − 
Z25347 CDK8 Cell cycle; kinase − ++++ ++++ −/++ 
D38548 KIAA0076a Unknown + ++ ++ +/++ 
D86479 AEBP1 Extracellular matrix + ++ ++ + 
U04689 OR1D2 Signaling; receptor + ++ + + 
M31328 GNB3 Signaling; G protein + ++ ++ + 
U13395 WWOX Metabolism; oxidoreductase + ++ ++ + 
X14675 BCR Signaling; GTPase for RAC + ++ ++ + 
X16665 HOXB2 Transcription; homeobox domain + ++ ++ −/+  
Z11899 POU5F1 Transcription; homeobox domain + ++ ++ +  
Z36531 FGL2 Secreted fibrinogenlike + ++ ++ +  
X80907 PIK3R2 Signaling; kinase adaptor + +++ +++ ++ 
D31846 AQP2 Aquaporin ++ +++ +++ ++ 
L18983 PTPRN Phosphatase; membrane ++ ++++ ++++ ++  
M23323 CD3E Signaling; T-cell receptor partner ++ ++++ ++++ ++ 
D83781 K1AA0197a Unknown + − − + 
HT4824 CBS Metabolism; cystathionine-beta-synthase + − − −/++ 
S78873 RABIF Signaling; GTP-releasing factor + − − +/++  
U32645 ELF4 Transcription;ets domain + − − −/+ 
X97630 EMK1 Signaling; kinase; ELK domain + − − +  
Z24724 UNKNOWNa Cell cycle + − − +/++  
D16480 HADHA Mitochondrial oxidation ++ − − −/++ 
L77701 COX17 Mitochondrial oxidation ++ − − −/++ 
M90356 BTF3L2 Transcription; NAC domain ++ − − ++ 
U08815 SF3A3 Spliceosome ++ − − +/++ 
U53225 SNX1 Intracellular trafficking ++ − − +/++  
M25753 CCNB1 Cell cycle ++ + − −/++ 
D87448 TOPBP1a Topoisomerase II binding protein ++ + + +/++  
L38810 PSMC5 26S proteasome subunit 5 ++ + + ++  
M29551 PPP3CB Signaling; calcium-dependent phosphatase ++ + + +/++ 
M32886 SRI Signaling; calcium binding ++ + + ++ 
U24704 PSMD4 26S proteasome subunit 4 ++ + + ++ 
U25165 FXR1 RNA binding protein ++ + + ++ 
U37022 CDK4 Cell cycle; kinase ++ + + ++ 
U53003 C21orf33 Unknown; highly conserved ++ + + ++  
X89985 BCL7B Actin crosslinking ++ + + ++  
D49738 CKAP1 Tubulin folding +++ + + ++ 
D43950 CCT5 Chaperonin +++ ++ ++ +++ 
D82348 ATIC Metabolism; purine biosynthesis +++ ++ ++ +++ 
D86550 DYRK1A Signaling; kinase +++ ++ ++ +++ 
L06132 VDAC1 Anion channel +++ ++ ++ ++/+++ 
L43631 SAFB Nuclear scaffold factor +++ ++ ++ ++/+++  
M30448 CSNK2B Signaling; casein kinase regulation +++ ++ ++ ++/++++ 
X76013 QARS Metabolism; glutaminyl tRNA synthetase +++ ++ ++ ++/+++  
D83735 CNN2 Actin binding ++++ ++ ++ ++/++++ 
M86667 NAP1L1 Nucleosome assembly ++++ ++ ++ +++ 
X04828 GNAI2 Signaling; G protein ++++ ++ ++ ++/+++ 
Accession no.SymbolFunctionQuantitative gene expression
TBCsTPCsBPCsMM
D28364 ANXA2 Annexin family − + + −/+ 
U81787 WNT10B Signaling; ligand − + ++ −/++ 
U88898 LOC51581a Unknown − + + −/+ 
X12451 CTSL Protease; cysteine − ++ ++ − 
Z25347 CDK8 Cell cycle; kinase − ++++ ++++ −/++ 
D38548 KIAA0076a Unknown + ++ ++ +/++ 
D86479 AEBP1 Extracellular matrix + ++ ++ + 
U04689 OR1D2 Signaling; receptor + ++ + + 
M31328 GNB3 Signaling; G protein + ++ ++ + 
U13395 WWOX Metabolism; oxidoreductase + ++ ++ + 
X14675 BCR Signaling; GTPase for RAC + ++ ++ + 
X16665 HOXB2 Transcription; homeobox domain + ++ ++ −/+  
Z11899 POU5F1 Transcription; homeobox domain + ++ ++ +  
Z36531 FGL2 Secreted fibrinogenlike + ++ ++ +  
X80907 PIK3R2 Signaling; kinase adaptor + +++ +++ ++ 
D31846 AQP2 Aquaporin ++ +++ +++ ++ 
L18983 PTPRN Phosphatase; membrane ++ ++++ ++++ ++  
M23323 CD3E Signaling; T-cell receptor partner ++ ++++ ++++ ++ 
D83781 K1AA0197a Unknown + − − + 
HT4824 CBS Metabolism; cystathionine-beta-synthase + − − −/++ 
S78873 RABIF Signaling; GTP-releasing factor + − − +/++  
U32645 ELF4 Transcription;ets domain + − − −/+ 
X97630 EMK1 Signaling; kinase; ELK domain + − − +  
Z24724 UNKNOWNa Cell cycle + − − +/++  
D16480 HADHA Mitochondrial oxidation ++ − − −/++ 
L77701 COX17 Mitochondrial oxidation ++ − − −/++ 
M90356 BTF3L2 Transcription; NAC domain ++ − − ++ 
U08815 SF3A3 Spliceosome ++ − − +/++ 
U53225 SNX1 Intracellular trafficking ++ − − +/++  
M25753 CCNB1 Cell cycle ++ + − −/++ 
D87448 TOPBP1a Topoisomerase II binding protein ++ + + +/++  
L38810 PSMC5 26S proteasome subunit 5 ++ + + ++  
M29551 PPP3CB Signaling; calcium-dependent phosphatase ++ + + +/++ 
M32886 SRI Signaling; calcium binding ++ + + ++ 
U24704 PSMD4 26S proteasome subunit 4 ++ + + ++ 
U25165 FXR1 RNA binding protein ++ + + ++ 
U37022 CDK4 Cell cycle; kinase ++ + + ++ 
U53003 C21orf33 Unknown; highly conserved ++ + + ++  
X89985 BCL7B Actin crosslinking ++ + + ++  
D49738 CKAP1 Tubulin folding +++ + + ++ 
D43950 CCT5 Chaperonin +++ ++ ++ +++ 
D82348 ATIC Metabolism; purine biosynthesis +++ ++ ++ +++ 
D86550 DYRK1A Signaling; kinase +++ ++ ++ +++ 
L06132 VDAC1 Anion channel +++ ++ ++ ++/+++ 
L43631 SAFB Nuclear scaffold factor +++ ++ ++ ++/+++  
M30448 CSNK2B Signaling; casein kinase regulation +++ ++ ++ ++/++++ 
X76013 QARS Metabolism; glutaminyl tRNA synthetase +++ ++ ++ ++/+++  
D83735 CNN2 Actin binding ++++ ++ ++ ++/++++ 
M86667 NAP1L1 Nucleosome assembly ++++ ++ ++ +++ 
X04828 GNAI2 Signaling; G protein ++++ ++ ++ ++/+++ 

Please see Table 2 note.

The range of QGE levels for genes with variable expression in MM are given as lowest level/highest level.

View Large
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal