Table 1.

Cohort of patients for single-cell RNA sequencing of BM cells

Sample IDOriginAge, sexWHO 2017KaryotypeMolecular genetics% BM blastsPrevious treatmentNumber of cells
HY1 Femur 30, M      651 
HY2 Femur 65, M      1558 
HY3 Femur 55, F      4190 
HY4 Femur 70, F      1050 
HY5 Femur 52, F      1576 
HY6 Femur 90, F      2031 
HY7 BM 72, F      524 
MDS1 BM 81, M MDS-MLD 46,XY [20] ASXL1, TET2 <1% Naive 481 
MDS2 Femur 75, F del5q 46,XX,del(5)(q13q31), inv(6)(p23q13)[3]/46,XX,del(5)(q13q31),der(11)t(11;17)(q23;p13) [3] None 15% Len, 5Aza 5422 
MDS3 BM 79, M del5q 46,XY,del(5)(q14q34) [19] 46,XY,del(5)(q14q34), t(7;9)(q21;q34)[3] TP53 <5% Len 1636 
MDS4 Femur 86, M MDS-MLD 46,XY,del(9)(q13q22) [11] None <5% Naive 1348 
MDS5 BM 78, M MDS-MLD 46,XY[20] SF3B1, RUNX1 <5% 5Aza 400 
MDS6 BM 56, M MDS-RS-T 46, XY, del (5)(q14), der(11)t(11;16) (q22;q12),der(16) t(11;16) (q23;p13) t(5;16)(q14;q12)[16] SF3B1 <5% Naive 418 
MDS7 BM 67, F MDS-MLD-RS 46,XX [20] SF3B1 <5% Naive 1383 
MDS8 BM 83, M MDS-MLD 46,XY[20] RUNX1, BCOR 10% 5Aza 1703 
Sample IDOriginAge, sexWHO 2017KaryotypeMolecular genetics% BM blastsPrevious treatmentNumber of cells
HY1 Femur 30, M      651 
HY2 Femur 65, M      1558 
HY3 Femur 55, F      4190 
HY4 Femur 70, F      1050 
HY5 Femur 52, F      1576 
HY6 Femur 90, F      2031 
HY7 BM 72, F      524 
MDS1 BM 81, M MDS-MLD 46,XY [20] ASXL1, TET2 <1% Naive 481 
MDS2 Femur 75, F del5q 46,XX,del(5)(q13q31), inv(6)(p23q13)[3]/46,XX,del(5)(q13q31),der(11)t(11;17)(q23;p13) [3] None 15% Len, 5Aza 5422 
MDS3 BM 79, M del5q 46,XY,del(5)(q14q34) [19] 46,XY,del(5)(q14q34), t(7;9)(q21;q34)[3] TP53 <5% Len 1636 
MDS4 Femur 86, M MDS-MLD 46,XY,del(9)(q13q22) [11] None <5% Naive 1348 
MDS5 BM 78, M MDS-MLD 46,XY[20] SF3B1, RUNX1 <5% 5Aza 400 
MDS6 BM 56, M MDS-RS-T 46, XY, del (5)(q14), der(11)t(11;16) (q22;q12),der(16) t(11;16) (q23;p13) t(5;16)(q14;q12)[16] SF3B1 <5% Naive 418 
MDS7 BM 67, F MDS-MLD-RS 46,XX [20] SF3B1 <5% Naive 1383 
MDS8 BM 83, M MDS-MLD 46,XY[20] RUNX1, BCOR 10% 5Aza 1703 

5Aza, azacytidine; F, female; Len, lenalidomide; M, male; WHO, World Health Organization.

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