Table 1.

Clinicopathologic characteristics of patients with HLH and/or FAS mutations

PIDHLHFAS mutationMutation significance VAFIHCLOHAgeSexLymphoma subtypesALC, K/mLHLH, moDeath, moHemophagocytosisEBV titer, IU/mLsIL2R, pg/mLFerritin, ng/mL
Yes No NA NA ND NA 19 ENKTL 0.8 No >800 000 10 997 135 680 
Yes No NA NA ND NA 53 ATLL 2.8 No 7966 >20 000 123 756 
Yes No NA NA ND NA 69 AITL 0.2 Yes >20 000 19 962 
Yes No NA NA ND NA 23 HSTCL 1.9 No <400 >80 000 30 529 
Yes No NA NA ND NA 48 HSTCL 3.3 15 16 No >20 000 54 647 
Yes No NA NA ND NA 62 PTCL, NOS 0.1 12 Yes 14 250 5463 
Yes No NA NA ND NA 69 PTCL, NOS 0.5 No 19 525 47 693 
Yes No NA NA ND NA 61 PTCL, NOS 0.1 18 18 No 7313 6699 140 740 
Yes No NA NA ND NA 16 PTCL, NOS 0.3 alive Yes >20 000 11 782 
10 Yes No NA NA ND NA 55 PTCL, NOS 0.4 12 13 Yes 3105 18 355 13 393 
11 Yes No NA NA ND NA 65 PTCL, NOS 6.7 No >20 000 19 502 
12 Yes No NA NA ND NA 59 PTCL, NOS 0.3 22 22 No 12 408 >20 000 5547 
13 Yes No NA NA ND NA 62 PTCL, NOS 34.3 ND 2333 >20 000 17 800 
14 Yes No NA NA ND NA 54 PTCL, NOS 0.6 Yes 38 945 42 659 
15 Yes No NA NA ND NA 77 PTCL, NOS 0.8 No 6621 >20 000 21 966 
16 Yes No NA NA ND NA 72 PTCL, NOS 0.7 17 18 Yes >20 000 9246 
17 Yes No NA NA ND NA 61 PTCL, NOS 0.2 14 No <400 >20 000 8906 
18 Yes No NA NA ND NA 64 T-LGLL 1.2 13 15 No 3214 8989 4021 
19 Yes No NA NA ND NA 69 T-LGLL 0.5 14 17 Yes <400 >20 000 27 328 
20 Yes No NA NA ND NA 71 T-LGLL 0.5 12 13 Yes 1683 10 975 82 206 
21 Yes No NA NA ND NA 56 MF 1.0 16 16 No <400 >20 000 2282 
22 Yes No NA NA ND NA 68 CD8+ PCAETL 0.5 42 42 No 3557 >20 000 972 
23 Yes No NA NA ND NA 54 ALCL 3.1 12 12 Yes >20 000 22 621 
24 Yes No NA NA ND NA 49 ALCL 0.3 79 80 ND >20 000 15 073 
25 Yes L224∗ Likely oncogenic 0.42 Pos No 68 AITL 0.4 25 27 Yes 5773 >20 000 12 277 
26 Yes W281∗ Likely oncogenic 0.41 Neg No 57 PTCL, NOS 0.3 No 1356 >20 000 64 718 
27 Yes D260N predicted damaging 0.26 Neg ND 47 ATLL 0.7 55 58 No >20 000 2286 
28 Yes S230Lfs∗4 predicted damaging 0.05 Neg No 67 ANKL 0.6 Yes 1408 >20 000 20 597 
29 Yes N264K predicted damaging 0.10 Neg No 71 ANKL 0.1 10 Yes 38 866 >33 500 
30 No C135Vfs∗52 Likely oncogenic 0.03 ND No 52 MEITL 2.2 NA alive No ND ND ND 
31 No V220Wfs∗3 Likely oncogenic 0.18 Neg Yes 61 PTCL, NOS 0.5 NA alive No ND ND 
32 No X218_splice Likely oncogenic 0.12 ND ND 86 PTCL, NOS 0.3 NA 70 No ND ND ND 
33 No I233Yfs∗14 Likely oncogenic 0.21 ND ND 68 PTCL, NOS 1.6 NA alive No ND ND 
34 No N302Vfs∗57 Likely oncogenic 0.66 ND Yes 75 PTCL, NOS 1.4 NA 49 No ND ND 
35 No S230Efs∗2 Likely oncogenic 0.45 Neg No 56 PTCL, NOS 4.5 NA 19 No ND ND 
36 No X66_splice Likely oncogenic 0.12 Neg No 82 PTCL, NOS 0.7 NA No ND ND ND 
37 No E272I predicted damaging 0.07 ND Yes 48 PTCL, NOS ND NA alive No ND ND ND 
38 No D269G predicted damaging 0.33 ND ND 77 PTCL, NOS 1.6 NA 44 No ND 1476 
39 No L242Pfs∗5 Likely oncogenic 0.44 Pos No 74 ATLL 99.8 NA No >20 000 595 
40 No E261V predicted damaging 0.37 ND ND 74 ATLL NA NA alive No ND ND ND 
41 No G286A predicted damaging 0.25 ND ND 65 ATLL 5.1 NA alive No ND ND ND 
42 No L298Yfs∗8 Likely oncogenic 0.77 Pos Yes 86 T-LGLL 3.2 NA No ND ND 
43 No D260G predicted damaging 0.35 ND No 68 T-LGLL NA alive No ND ND ND 
44 No Q273∗ Likely oncogenic 0.09 ND No 71 T-LGLL 0.6 NA alive No ND ND 484 
45 No D265G predicted damaging 0.39 ND ND 58 ENKTL 2.1 NA alive No ND ND 
46 No N252D predicted damaging 0.12 ND ND 80 AITL 1.1 NA alive No ND 4138 
47 No E150∗ Likely oncogenic 0.49 Neg Yes 76 PCGDTCL 2.9 NA alive No ND ND 34 
48 No C119Afs∗68 Likely oncogenic 0.03 Neg No 41 SS 4.1 NA alive No ND 239 
49 No H142D Predicted damaging 0.97 Neg Yes 81 SS 1.2 NA alive No ND ND ND 
50 No X66_splice Likely oncogenic 0.12 ND Yes 62 MF 0.2 NA 19 No ND 1674 
51 No X226_splice Likely oncogenic 0.45 ND No 65 MF 1.1 NA alive No ND ND 
52 No F134_C135ins∗ Likely oncogenic 0.46 Neg Yes 59 T-PLL 1.2 NA alive No ND ND ND 
PIDHLHFAS mutationMutation significance VAFIHCLOHAgeSexLymphoma subtypesALC, K/mLHLH, moDeath, moHemophagocytosisEBV titer, IU/mLsIL2R, pg/mLFerritin, ng/mL
Yes No NA NA ND NA 19 ENKTL 0.8 No >800 000 10 997 135 680 
Yes No NA NA ND NA 53 ATLL 2.8 No 7966 >20 000 123 756 
Yes No NA NA ND NA 69 AITL 0.2 Yes >20 000 19 962 
Yes No NA NA ND NA 23 HSTCL 1.9 No <400 >80 000 30 529 
Yes No NA NA ND NA 48 HSTCL 3.3 15 16 No >20 000 54 647 
Yes No NA NA ND NA 62 PTCL, NOS 0.1 12 Yes 14 250 5463 
Yes No NA NA ND NA 69 PTCL, NOS 0.5 No 19 525 47 693 
Yes No NA NA ND NA 61 PTCL, NOS 0.1 18 18 No 7313 6699 140 740 
Yes No NA NA ND NA 16 PTCL, NOS 0.3 alive Yes >20 000 11 782 
10 Yes No NA NA ND NA 55 PTCL, NOS 0.4 12 13 Yes 3105 18 355 13 393 
11 Yes No NA NA ND NA 65 PTCL, NOS 6.7 No >20 000 19 502 
12 Yes No NA NA ND NA 59 PTCL, NOS 0.3 22 22 No 12 408 >20 000 5547 
13 Yes No NA NA ND NA 62 PTCL, NOS 34.3 ND 2333 >20 000 17 800 
14 Yes No NA NA ND NA 54 PTCL, NOS 0.6 Yes 38 945 42 659 
15 Yes No NA NA ND NA 77 PTCL, NOS 0.8 No 6621 >20 000 21 966 
16 Yes No NA NA ND NA 72 PTCL, NOS 0.7 17 18 Yes >20 000 9246 
17 Yes No NA NA ND NA 61 PTCL, NOS 0.2 14 No <400 >20 000 8906 
18 Yes No NA NA ND NA 64 T-LGLL 1.2 13 15 No 3214 8989 4021 
19 Yes No NA NA ND NA 69 T-LGLL 0.5 14 17 Yes <400 >20 000 27 328 
20 Yes No NA NA ND NA 71 T-LGLL 0.5 12 13 Yes 1683 10 975 82 206 
21 Yes No NA NA ND NA 56 MF 1.0 16 16 No <400 >20 000 2282 
22 Yes No NA NA ND NA 68 CD8+ PCAETL 0.5 42 42 No 3557 >20 000 972 
23 Yes No NA NA ND NA 54 ALCL 3.1 12 12 Yes >20 000 22 621 
24 Yes No NA NA ND NA 49 ALCL 0.3 79 80 ND >20 000 15 073 
25 Yes L224∗ Likely oncogenic 0.42 Pos No 68 AITL 0.4 25 27 Yes 5773 >20 000 12 277 
26 Yes W281∗ Likely oncogenic 0.41 Neg No 57 PTCL, NOS 0.3 No 1356 >20 000 64 718 
27 Yes D260N predicted damaging 0.26 Neg ND 47 ATLL 0.7 55 58 No >20 000 2286 
28 Yes S230Lfs∗4 predicted damaging 0.05 Neg No 67 ANKL 0.6 Yes 1408 >20 000 20 597 
29 Yes N264K predicted damaging 0.10 Neg No 71 ANKL 0.1 10 Yes 38 866 >33 500 
30 No C135Vfs∗52 Likely oncogenic 0.03 ND No 52 MEITL 2.2 NA alive No ND ND ND 
31 No V220Wfs∗3 Likely oncogenic 0.18 Neg Yes 61 PTCL, NOS 0.5 NA alive No ND ND 
32 No X218_splice Likely oncogenic 0.12 ND ND 86 PTCL, NOS 0.3 NA 70 No ND ND ND 
33 No I233Yfs∗14 Likely oncogenic 0.21 ND ND 68 PTCL, NOS 1.6 NA alive No ND ND 
34 No N302Vfs∗57 Likely oncogenic 0.66 ND Yes 75 PTCL, NOS 1.4 NA 49 No ND ND 
35 No S230Efs∗2 Likely oncogenic 0.45 Neg No 56 PTCL, NOS 4.5 NA 19 No ND ND 
36 No X66_splice Likely oncogenic 0.12 Neg No 82 PTCL, NOS 0.7 NA No ND ND ND 
37 No E272I predicted damaging 0.07 ND Yes 48 PTCL, NOS ND NA alive No ND ND ND 
38 No D269G predicted damaging 0.33 ND ND 77 PTCL, NOS 1.6 NA 44 No ND 1476 
39 No L242Pfs∗5 Likely oncogenic 0.44 Pos No 74 ATLL 99.8 NA No >20 000 595 
40 No E261V predicted damaging 0.37 ND ND 74 ATLL NA NA alive No ND ND ND 
41 No G286A predicted damaging 0.25 ND ND 65 ATLL 5.1 NA alive No ND ND ND 
42 No L298Yfs∗8 Likely oncogenic 0.77 Pos Yes 86 T-LGLL 3.2 NA No ND ND 
43 No D260G predicted damaging 0.35 ND No 68 T-LGLL NA alive No ND ND ND 
44 No Q273∗ Likely oncogenic 0.09 ND No 71 T-LGLL 0.6 NA alive No ND ND 484 
45 No D265G predicted damaging 0.39 ND ND 58 ENKTL 2.1 NA alive No ND ND 
46 No N252D predicted damaging 0.12 ND ND 80 AITL 1.1 NA alive No ND 4138 
47 No E150∗ Likely oncogenic 0.49 Neg Yes 76 PCGDTCL 2.9 NA alive No ND ND 34 
48 No C119Afs∗68 Likely oncogenic 0.03 Neg No 41 SS 4.1 NA alive No ND 239 
49 No H142D Predicted damaging 0.97 Neg Yes 81 SS 1.2 NA alive No ND ND ND 
50 No X66_splice Likely oncogenic 0.12 ND Yes 62 MF 0.2 NA 19 No ND 1674 
51 No X226_splice Likely oncogenic 0.45 ND No 65 MF 1.1 NA alive No ND ND 
52 No F134_C135ins∗ Likely oncogenic 0.46 Neg Yes 59 T-PLL 1.2 NA alive No ND ND ND 

HLH represents months from TCL diagnosis to HLH diagnosis; and death represents months from TCL diagnosis to decease.

ALC, absolute lymphocyte counts; CD8+ PCAETL, Primary cutaneous CD8+ epidermotropic cytotoxic T-cell lymphoma; ENKTL, extranodal T/NK-cell lymphoma, nasal type; IHC, immunohistochemistry; LOH, loss of heterozygosity; MEITL, monomorphic epitheliotropic intestinal T-cell lymphoma; NA, not applicable; ND, not done/determined; Neg, negative; PCGDTCL, primary cutaneous gamma delta T-cell lymphoma; Pos, positive; T-LGLL, T-large granular lymphocytic leukemia; VAF, variant allelic frequency.

Mutations were classified as oncogenic, likely oncogenic, or variant of unknown significance (VUS) as assessed according to the Clinical Genome Resource, Cancer Genomics Consortium, and Variant Interpretation for Cancer Consortium guidelines. VUS were further evaluated by Polyphen 2 and SIFT. A score of Polyphen2 >0.9 and/or of SIFT <0.05 was deemed as damaging.

or Create an Account

Close Modal
Close Modal